计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5555|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 脱ONO的路径柔性扫描时发生结构突变

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

64

eV
积分
73

Level 2 能力者

各位老师好,学生在做一条无势垒反应的柔性扫描时,发现结构发生了突变
对于这条脱ONO的路径,
学生先是用guess=mix,stable=opt做了波函数稳定性测试,然后opt=modredundant,guess=read 对2和31号原子进行了键长的柔性扫描
如图一所示,能量曲线有明显的转折
而且发现在距离从2->2.1时,结构发生了第一次变化,像是ONO进行了翻转,再到2.3->2.4的时候,ONO又发生了翻转
对于这种无势垒反应,为何扫描不出如图二所示的曲线呢(老板很确定的和我说这是无势垒反应,最后的曲线应该和图二类似才对)

屏幕截图 2021-08-28 155946.jpg (276.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

图一. 柔性扫描结果

图一. 柔性扫描结果

无势垒.jpg (73.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

图二. 无势垒反应能量曲线

图二. 无势垒反应能量曲线

51

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1132

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2021-8-28 17:12:02 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/474 参考这篇博文
专注于面向个人的量化问题解决,LAMMPS ReaxFF力场。一对一提供服务,本人个人电脑提供计算资源,双路8168,128G内存。

9

帖子

0

威望

64

eV
积分
73

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-8-28 17:34:40 | 只看该作者 Only view this author
447951397 发表于 2021-8-28 17:12
http://sobereva.com/474 参考这篇博文

谢谢您的回复,有看到这篇博文里sob老师对于突越的描述,但是我并不是要找过渡态,而是对于一个已经确定无势垒反应的路径进行扫描,获得扫描曲线,按理说不应该有结构突变才对


sob.jpg (260.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

sob.jpg

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125147

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2021-8-28 20:22:34 | 只看该作者 Only view this author
人家的体系、化学过程和你的截然不同,人家无势垒你就是无势垒了?
你老板那么自信,让他拿出依据来

我博文里的图和解释又不是说要让读者找过渡态,明明专门说的是突跃是什么导致的,完全适用于你当前的情况

另外,我博文里的例子也明确说了,这种情况扫描应当从对称破缺态的远距离向闭壳层的近距离扫(除非你的第一个点就是对称破缺态)
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 16:52 , Processed in 0.277871 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list