使用intel全家桶编译cp2k8.2

Penson · 发表于 Post on 2021-9-12 16:40:20

原来Intel编译器已经全免费了，太好了

waitingseven · 发表于 Post on 2021-9-13 09:55:26

abin 发表于 2021-9-12 10:34
请自行确认一下toolchain组件的链接情形，
可能也看不出来啥，只能看到链接到MKL。

请问 Linux-x86-64-intel-regtest.psmp 与 Linux-x86-64-intel-minimal.psmp 有什么区别吗？还有楼上说用新版oneapi会发生内存泄漏，内存一直增加，我自己测试发现cp2k8.2和8.1都是内存一直增加，但是跑vasp5.4和6.1都没出现问题，这是啥原因啊

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-9-13 10:16:49

最稳妥的方法还是用

--math-mode=openblas --with-openmpi=install --with-openblas=install --with-scalapack=install

所有模块正确编译，算例一个不会出错，其实速度也没慢多少

abin · 发表于 Post on 2021-9-13 10:47:39

waitingseven 发表于 2021-9-13 09:55
请问 Linux-x86-64-intel-regtest.psmp 与 Linux-x86-64-intel-minimal.psmp 有什么区别吗？还有楼上说用 ...

这两个文件是官方给的.

有何差异自己diff看一下.
如果看不懂, 那就不用捣鼓自己编译调优了.

另, 使用官方推荐的工具链进行编译哦, 否则MPI容易死掉.

另, 我编译的cp2k 8.1 8.2都比较稳定, 7.1也很稳定.
仅仅是采用官方推荐的工具链而已.

djjj148 · 发表于 Post on 2021-9-13 13:00:43

丁越发表于 2021-9-12 13:33
麻烦老师可以详细说明一下编译cp2k的过程么？

编译出来的程序有问题。make test全通过，但是跑优化的时候无法进入下一个离子步。就不放出来了。

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-13 17:09:40

abin 发表于 2021-9-12 10:34
请自行确认一下toolchain组件的链接情形，
可能也看不出来啥，只能看到链接到MKL。

王老师这个psmp方法可以的呀，我正好想试试

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-14 08:52:00

大兄弟，请教一下，为啥我的centos 7.6还有wsl按照帖子炒作最后都有同样的报错呀，好奇怪，这种情况有啥办法嘛；
另外想问一下帖子里intel mpi 和openmpi程序执行代码是啥，mpirun ，，，，，OMP_NUM_THEARD 还有ssmp，popt或者psmp具体怎么执行的呀，要不然直接比较不是太明白测试条件，最主要还是上面的问题，这个ONEAPI在make报错怎么办

丁越 · 发表于 Post on 2021-9-14 22:16:42

Aridea 发表于 2021-9-14 08:52
大兄弟，请教一下，为啥我的centos 7.6还有wsl按照帖子炒作最后都有同样的报错呀，好奇怪，这种情况有啥办 ...

你能换成centos8就换了，7的话看看刘博的帖子，升级gcc之类的很麻烦。这种报错我也不会解决，不行就直接gcc,gfortran编译，这样编译出来的至少有popt版的，intel编译器只有ssmp,效率看体系，有时候比openmpi的popt快，有时候慢好多。

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-15 09:28:14

丁越发表于 2021-9-14 22:16
你能换成centos8就换了，7的话看看刘博的帖子，升级gcc之类的很麻烦。这种报错我也不会解决，不行就直接g ...

嗯嗯，我这个centos7.6已经升级了gcc* 9（gcc，g++，gfortran），这个报错应该不是gcc gfortran的问题吧

ChemG · 发表于 Post on 2021-9-15 09:42:02

Aridea 发表于 2021-9-15 09:28
嗯嗯，我这个centos7.6已经升级了gcc* 9（gcc，g++，gfortran），这个报错应该不是gcc gfortran的问题吧

简单的升级gcc9有可能lib和include还是指向本机的gcc，用toolchain编译的时候能看到是不是指向了新的gcc。感觉还是直接用centos8靠谱点。因为我用centos7编译cp2k也总有问题，换centos8就好很多了

Aridea · 发表于 Post on 2021-9-15 09:55:24

ChemG 发表于 2021-9-15 09:42
简单的升级gcc9有可能lib和include还是指向本机的gcc，用toolchain编译的时候能看到是不是指向了新的gcc ...

这样呢，多谢分享~

LittlePupil · 发表于 Post on 2021-10-8 23:59:36

成功编译ssmp版本后，“make -j 4 ARCH=Linux-x86-64-intel-minimal VERSION="psmp"”可以编译出psmp版本，但奇怪的是，拿sob老师的算例测试，设置OMP_NUM_THREADS为1跑这个psmp版本，居然比设置OMP_NUM_THREADS为4跑ssmp版本还慢了一秒多，即使修改makefile的“O2”为“O3”也没有明显改善。

ChemG · 发表于 Post on 2021-10-9 09:38:03

djjj148 发表于 2021-9-13 13:00
编译出来的程序有问题。make test全通过，但是跑优化的时候无法进入下一个离子步。就不放出来了。

http://bbs.keinsci.com/thread-25553-1-1.html 看这篇帖子

gog · 发表于 Post on 2021-11-4 15:34:27

Penson 发表于 2021-9-12 16:40
原来Intel编译器已经全免费了，太好了

2021的版本是这样。

Penson · 发表于 Post on 2021-11-6 11:15:06

gog 发表于 2021-11-4 15:34
2021的版本是这样。

很好的福利

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