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楼主 Author: mettlyz
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[ORCA] ORCA调用xtb时出现问题

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发表于 Post on 2022-7-17 20:32:09 | 只看该作者 Only view this author
yjb 发表于 2022-7-17 12:55
我是看到节点上top显示出来的%CPU,orca进程占了不到一个核,xtb显示 %CPU经常保持在50。

那可能是xtb确实没有读到你设的num_threads,比如可能因为你用的程序接口本来就没考虑到QM区用xtb的情形。可以手动把OMP_NUM_THREADS设为12看看
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-7-17 20:53:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-17 20:32
那可能是xtb确实没有读到你设的num_threads,比如可能因为你用的程序接口本来就没考虑到QM区用xtb的情形 ...

已经在./bashrc里面设置过,用Gaussian+xtb,可以看见%CPU=1200,我觉得可能amber自带的接口没有考虑到orca接了xtb的情况。
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发表于 Post on 2022-7-18 23:07:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-7-17 20:32
那可能是xtb确实没有读到你设的num_threads,比如可能因为你用的程序接口本来就没考虑到QM区用xtb的情形 ...

老师,我今天试着做了一个更大的QM体系,xtb显示%CPU=1200,可能之前那个QM区域比较小, 用不到12核.
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