xeon 8375C ES双路使用感受

静哥哥

wolfli369 发表于 2022-2-24 20:21
不客气

这位老师，我再请教几个问题，我按照您推荐的版本intel2018 update4（ifort 18.0.5)安装，在此基础上我装好了vasp6.1，没有问题。然后按照社长装cp2k的帖子装cp2k，cp2k测试没有问题，但是反过来测试vasp发现出问题了。我看了应该是编译器的问题，导致vasp重装无法make all,出现“compilation aborted for fortran.c (code 4)”。

我的问题是社长装cp2k帖子中“此时MKL会被装到/opt/intel/目录下，被装到笔者机子里的是MKL 2018版，占2.2GB硬盘。把下面的语句加入到~/.bashrc文件中，然后重新进入终端使之生效
source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018.0.033/bin/psxevars.sh”需要安装MKL 2018，我想问一下，我前面装vasp时装好了intel2018 update4（ifort 18.0.5)还需要装社长那个库吗？
因为我发现intel下出现parallel_studio_xe_2018（带箭头）、parallel_studio_xe_2018.0.033、parallel_studio_xe_2018.4.057。

现在的问题是cp2k可以运行，vasp无法make all。

我的bashrc
# .bashrc

# User specific aliases and functions

alias rm='rm -i'
alias cp='cp -i'
alias mv='mv -i'

# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018.4.057/bin/psxevars.sh

export OMPI_ALLOW_RUN_AS_ROOT=1
export OMPI_ALLOW_RUN_AS_ROOT_CONFIRM=1

export PATH=$PATH:/opt/vasp61/vasp/bin

export PATH=/opt/vaspkit131/bin:${PATH}

source /opt/cp2k91/tools/toolchain/install/setup
export PATH=$PATH:/opt/cp2k91/exe/local

ulimit -s unlimited



3\、另外，source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018.4.057/bin/psxevars.sh和source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018.4.057/psxevars.sh有区别吗

wolfli369

静哥哥 发表于 2022-2-25 14:34
这位老师，我再请教几个问题，我按照您推荐的版本intel2018 update4（ifort 18.0.5)安装，在此基础上我装 ...

source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018/psxevars.sh这样设置就行。你这应该是ifort的问题。已经有intel mpi了，就不用openmpi了。可以尝试先安装vasp6.1，然后make test，接着将bashrc文件里面的vasp6.1.0/bin注释掉。再安装cp2k，使用./install_cp2k_toolchain.sh  --with-sirius=no --with-intelmpi=system --with-plumed=install --with-ptscotch=install --with-superlu=install --with-pexsi=install --with-quip=install，这样就能利用intelmpi和mkl数据库编译cp2k，还能稍微加速计算，接着test。

静哥哥

wolfli369 发表于 2022-2-25 18:36
source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018/psxevars.sh这样设置就行。你这应该是ifort的问题。已经有in ...

您好，其他都装好了，奇怪最后quip无法安装。提示stage6/install_quip.sh, line 107, non-zero exit code detected

静哥哥

wolfli369 发表于 2022-2-25 18:36
source /opt/intel/parallel_studio_xe_2018/psxevars.sh这样设置就行。你这应该是ifort的问题。已经有in ...

./install_cp2k_toolchain.sh  --with-sirius=no --with-intelmpi=system --with-plumed=install --with-ptscotch=install --with-superlu=install --with-pexsi=install --with-quip=install完成后，除了quip无法安装外，我发现在install下没有arch文件夹

wolfli369

静哥哥 发表于 2022-2-25 22:23
./install_cp2k_toolchain.sh  --with-sirius=no --with-intelmpi=system --with-plumed=install --with- ...

quip这个力场文件不是很好安装，我也没有找到正确的安装方法。

静哥哥

wolfli369 发表于 2022-2-26 08:50
quip这个力场文件不是很好安装，我也没有找到正确的安装方法。

这个老师早啊，我看您帖子写的用的是intel 2018 update1(ifort 18.0.5)，但是后面您回复我用的是intel 2018 update4,。目前我发现个问题，如果用intel 2018 update4（ifort18.0.5）自带的mkl库，同时拥intelmpi,gcc，发现装完后出quip无法安装。并且install/下没有arch文件夹。后面我就想了一个方法，按照社长的帖子多装了个2018.0.128mkl库+open编译器才能通过，没有报错

wolfli369

静哥哥 发表于 2022-2-26 09:07
这个老师早啊，我看您帖子写的用的是intel 2018 update1(ifort 18.0.5)，但是后面您回复我用的是intel 20 ...

intel(18.0.5)就行，初次发帖好多错误。open编译器我没有听说过

静哥哥

wolfli369 发表于 2022-2-26 09:14
intel(18.0.5)就行，初次发帖好多错误。open编译器我没有听说过

社长用的是 mkl 2018.0.3编译的。使用的安装组合 gcc+openmpi+mkl，用的./install_cp2k_toolchain.sh --with-sirius=no --with-openmpi=install --with-plumed=install里面 --with-openmpi=install 这个openmpi。
无论如何，编译过了就行，这两天真是学到不少东西。
特别感谢您一直回帖

wolfli369

静哥哥 发表于 2022-2-26 09:18
社长用的是 mkl 2018.0.3编译的。使用的安装组合 gcc+openmpi+mkl，用的./install_cp2k_toolchain.sh --w ...

我也是刚入门的小白，还期待你能分享一些计算例子给我，我可以自己多学习一下

urright

学习了

Geyer

2.8是步6吗？我咋记得是步5

wolfli369

Geyer 发表于 2022-3-12 20:13
2.8是步6吗？我咋记得是步5

写错了

乐平

发现intel 2019 update 1和intel 2020 update 4，在跑大体系是都会出现mpi内存泄漏被localhost杀掉

请问这里的“大体系”具体是多大呢？能否上传一下您的例子？谢谢啦

fantexi113

受教了。我也自己组了一台，卖家说是8375C QS版，在hwinfo中步进D2，cpuz步进6，满载3.5，都是正显。卖家说现在的正式版都是这个，实际上是QS，不知道真假。反正用着不错

wolfli369

fantexi113 发表于 2022-3-20 21:28
受教了。我也自己组了一台，卖家说是8375C QS版，在hwinfo中步进D2，cpuz步进6，满载3.5，都是正显。卖家说 ...

恭喜你，这个可以尽情使用了