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楼主 Author: sobereva
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[CP2K] 使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和分析电子激发态

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发表于 Post on 2022-3-3 23:58:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 21:37
最新版的CP2K支持TDDFT受力,原理上可以用于激发态优化以及之后计算发射光谱,但我没实际测试过

谢谢老师的回复,我在有些文献上看到他们在DFT计算里用delta scf方法(改变电子占据)得到优化后的激发态构型。那我拿这个优化后的激发态构型,再用老师本文的方法计算得到吸收光谱,那这个光谱是否就是发射光谱了?

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发表于 Post on 2022-3-4 01:14:59 | 只看该作者 Only view this author
该方法是不是还能算离子晶体?高斯好像只能算分子晶体。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 05:14:58 | 只看该作者 Only view this author
qq870624836 发表于 2022-3-4 01:14
该方法是不是还能算离子晶体?高斯好像只能算分子晶体。



Gaussian也不是不能算离子晶体,但构造簇模型的时候对边界的考虑很麻烦
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 05:16:02 | 只看该作者 Only view this author
qq870624836 发表于 2022-3-3 23:58
谢谢老师的回复,我在有些文献上看到他们在DFT计算里用delta scf方法(改变电子占据)得到优化后的激发态 ...

delta-SCF在实际中并不好用,局限性非常大,并不是优化激发态的普适性做法
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-3-4 09:31:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-4 05:16
delta-SCF在实际中并不好用,局限性非常大,并不是优化激发态的普适性做法

唉,其实我也知道最好是可以用TDDFT的方法优化激发态。但目前确实没有找到合适的方法,去优化晶体的激发态。而发射光谱我又必须得算,我研究的是发射峰随卤素改变的变化。如果用delta scf得到了优化的激发态构型(这个结构已经证明是可靠的),那我前面提到的计算发射谱的流程是否可行呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-4 19:00:59 | 只看该作者 Only view this author
qq870624836 发表于 2022-3-4 09:31
唉,其实我也知道最好是可以用TDDFT的方法优化激发态。但目前确实没有找到合适的方法,去优化晶体的激发 ...

可以
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发表于 Post on 2022-3-6 17:50:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-3 15:35
这是晶体结构,不用自己建

谢谢 Sob 老师回复。

那晶体结构,是否用到了CP2K 的 SIRIUS 模块? 我看 CP2K  官网上介绍  SIRIUS 是平面波方法,但是安装是可选项。

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发表于 Post on 2022-3-6 17:51:26 | 只看该作者 Only view this author
ChemG 发表于 2022-3-3 13:57
(1)通过实验打单晶解析结构,(2)在晶体数据库中下载已有的晶体cif文件

谢谢回复。

如果没有晶体结构,就只能自己在类似的结构上手动修改了……

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-6 18:02:57 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2022-3-6 17:50
谢谢 Sob 老师回复。

那晶体结构,是否用到了CP2K 的 SIRIUS 模块? 我看 CP2K  官网上介绍  SIRIUS  ...

结构是晶体结构,根本不牵扯自己计算
而且就算要计算,也和SIRIUS没任何直接关系。CP2K自身基于原子中心基函数+平面波作为辅助基算大体系比SIRIUS模块纯粹基于平面波有效率得多
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-6 18:04:06 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2022-3-6 17:51
谢谢回复。

如果没有晶体结构,就只能自己在类似的结构上手动修改了……

晶体结构绝对不是自己手动能随随便便基于其它晶体改出来的
对于没有晶体结构的情况,应当用比如USPEX等晶体结构预测程序去预测,有些情况也可以试图跑动力学退火模拟得到
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发表于 Post on 2022-3-7 13:15:22 | 只看该作者 Only view this author
请教卢老师,下面图片中蓝色箭头指的15//开启激发态计算是怎么在Multiwfn界面中出现的?

我在载入bulk.cif 或者bulk_TDDFT.inp到Multiwfn界面后,出现了如下图所示的界面,没有发现15//开启激发态计算的选项。

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发表于 Post on 2022-3-7 13:19:22 | 只看该作者 Only view this author
不会扣篮的后卫 发表于 2022-3-7 13:15
请教卢老师,下面图片中蓝色箭头指的15//开启激发态计算是怎么在Multiwfn界面中出现的?

我在载入bulk.c ...

你的截图写的足够清楚了,认真再看一遍,你漏了一行。如果还没有,重新下载最新的Multiwfn。

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发表于 Post on 2022-3-7 14:28:03 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2022-3-7 13:19
你的截图写的足够清楚了,认真再看一遍,你漏了一行。如果还没有,重新下载最新的Multiwfn。

谢谢老师,我在最新的Multiwfn找到了15选项。

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发表于 Post on 2022-3-8 15:03:49 | 只看该作者 Only view this author
我用官方预编译的版本算老师的例子,16个核算了几个小时,这算正常速度吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-9 05:04:28 | 只看该作者 Only view this author
qq870624836 发表于 2022-3-8 15:03
我用官方预编译的版本算老师的例子,16个核算了几个小时,这算正常速度吗?

有点长。我的2*2696v3 36核机子只花了1个小时,而且这还是机子里有其它任务在跑的情况下花的时间。
不建议用预编译的psmp版,对于有些任务并行效率很低
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