Thiel的MNDO程序开源了，可做OM2/MRCI等计算

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-3 03:23:05

biogon 发表于 2022-6-2 20:57
可能是，我看别人文章里说的mndo电荷，不知具体是什么

半经验方法的原子电荷，诸如AM1电荷等，直接这么说的时候都是默认指基于半经验级别的密度矩阵算的Mulliken电荷。直接用Gaussian就能算。

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-3 03:25:30

RAL 发表于 2022-6-2 13:12
然而精度有点感人

sTDA-xTB这种东西比较适合的是sTDA都算不动的巨大体系，诸如诸如Grimme有篇JACS文章是算整个蛋白质的ECD的，能定性正确就够了。如果只是好几百个原子的程度，用sTDA/sTDDFT基于DFT轨道来算毫无压力，sTDA-xTB就没用处了。

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-3 03:30:01

(TD)-DFTB级别下也有个跑非绝热动力学程序
DFTBaby：https://www.dftbaby.chemie.uni-wuerzburg.de

wxhwbh · 发表于 Post on 2022-6-3 10:38:23

sobereva 发表于 2022-6-3 03:30
(TD)-DFTB级别下也有个跑非绝热动力学程序
DFTBaby：https://www.dftbaby.chemie.uni-wuerzburg.de

这玩意我们测过，精度还不如OM2/MRCI，还容易出各种问题

itpfeng · 发表于 Post on 2022-9-12 04:10:05

1楼的链接打不开啊

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-9-12 15:24:50

itpfeng 发表于 2022-9-11 21:10
1楼的链接打不开啊

我已经说了，“如因网络问题，国内无法访问这个网站的话，我可以代为填写表单，需要私信我提供您的（1）姓名、（2）详细通讯地址、（3）邮箱、（4）是否仅供您课题组内的计算机使用，如果不是的话，列出所有拟安装MNDO的计算机（例如您所在院系的集群）。”

cxh19990601 · 发表于 Post on 2022-10-13 22:24:28

请问一下mndo可以设置并行嘛，应该如何设置？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-10-14 02:26:10

cxh19990601 发表于 2022-10-13 15:24
请问一下mndo可以设置并行嘛，应该如何设置？

应该是可以的，有一个mplib关键字。
https://mndo.kofo.mpg.de/input.php

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-11-28 16:31:11

这个玩意可以算大体系的CD光谱么

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-28 18:41:17

喵星大佬发表于 2022-11-28 09:31
这个玩意可以算大体系的CD光谱么

手册里没搜到。但是Grimme的sTDA-xTB支持算CD光谱

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-11-29 01:44:34

wzkchem5 发表于 2022-11-28 18:41
手册里没搜到。但是Grimme的sTDA-xTB支持算CD光谱

这是有个单独的程序还是有别的程序支持这种做法

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-29 03:11:37

喵星大佬发表于 2022-11-28 18:44
这是有个单独的程序还是有别的程序支持这种做法

https://github.com/grimme-lab/stda

鬼隐 · 发表于 Post on 2023-7-25 09:53:17

本帖最后由鬼隐于 2023-7-25 10:31 编辑

王老师，你好！
我拿到了mndo的gitea账号，but我clone mndo代码后发现无法通过编译，（起初是一些字符串数组构造器问题，隐式类型转换，etc 太trivial不放截图了），我手动修了7-8份源码文件之后还是一直在出编译error。我想可能是我用的gcc版本太新，过于严格。于是换docker centos:7.9 x86_64 （gcc gfortran 485），依然是无法通过编译。现在应该是你们组在管这份代码，是否可以请你push一下组内的大佬们修修bug，or 放出mndo2019的源码（gitea上只有两个commit，我无法revert）。
顺便一提，INSTALL里的安装方法也是不完整的，应该先

automake --add-missing
autoconf

复制代码

其在这里提到mndo repo descrip

我在BIN看到有mndo2020 ifort mkl的静态二进制文件
但是运行之后屏幕显示的是mndo2019.

顺带一问，gitea上是否可以commit，开个branch pr 然后merge main那种。

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建议所有人放弃ifort，这种奇怪的bug兼容性只会教坏小朋友。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-7-25 15:32:53

鬼隐发表于 2023-7-25 02:53
王老师，你好！
我拿到了mndo的gitea账号，but我clone mndo代码后发现无法通过编译，（起初是一些字符串数 ...

感谢反馈！现在负责MNDO的是我们组的Dr. Axel Koslowski，邮箱是koslowski[at]kofo.mpg.de，可以直接和他联系

muuu2333 · 发表于 Post on 2023-9-21 23:55:39

能算含有过渡金属的配合物体系的激发态吗

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