性能翻倍？RTX4090科学计算之经典MD模拟全面测试

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-11-7 12:05:04

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-11-7 12:10 编辑

sss668800 发表于 2022-11-7 10:33
非常感谢楼主，话说UP主51972首发评测4090时测试分子动力学软件，是不是没有和你合作？
因为51972评测4090 ...

我是看到51972的RTX4090首发评测做了MD测试，才主动联系他帮忙提供硬件。做视频就不是我的事情了，51972最近有其他项目在忙，大概率没时间给这个benchmark做视频。

你说的是图1吧？纯E-Core，通过gmx mdrun自带的-pinoffset和-pinstride指定就行了，例如用前8个E-Core，GPU-resident模式：gmx mdrun -v -deffnm md -ntmpi 1 -ntomp 8 -pin on -pinoffset 16 -pinstride 1 -bonded gpu -update gpu

12代带GPU跑GMX非常不合适，买来这么用的人都是大冤种。

13700K/KF完全不推荐，还不如3999的7950X，后者还能跑量化。

sss668800 · 发表于 Post on 2022-11-7 15:37:40

Entropy.S.I 发表于 2022-11-7 12:05
我是看到51972的RTX4090首发评测做了MD测试，才主动联系他帮忙提供硬件。做视频就不是我的事情了，51972 ...

明白了，非常感谢

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-11-7 16:56:16

本帖最后由喵星大佬于 2022-11-7 16:57 编辑

如果有空是不是可以加入LAMMPS相关的测试。这应该算是使用人数最多的MD软件了(看引用的话)。不知道LAMMPS的GPU加速怎么样，之前据说是结果不是很稳定

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-11-7 17:04:59

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-11-7 17:09 编辑

喵星大佬发表于 2022-11-7 16:56
如果有空是不是可以加入LAMMPS相关的测试。这应该算是使用人数最多的MD软件了(看引用的话)。不知道LAMMPS的 ...

有LAMMPS测试啊，不过我不熟悉这软件，只简单跑了一下。4090跑ReaxFF/C还有Bug。另外，有公社的朋友说这软件GPU加速跑出来的结果（一些统计性质）和纯CPU计算对不上。

喵星大佬 · 发表于 Post on 2022-11-7 17:13:33

Entropy.S.I 发表于 2022-11-7 17:04
有LAMMPS测试啊，不过我不熟悉这软件，只简单跑了一下。4090跑ReaxFF/C还有Bug。另外，有公社的朋友说这 ...

是我瞎了。。。后面图没仔细看

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-11-7 17:16:01

喵星大佬发表于 2022-11-7 17:13
是我瞎了。。。后面图没仔细看

建议仔细看全文…自我感觉这篇文章信息密度应该是比较高的…

Acee · 发表于 Post on 2022-11-9 12:15:50

naoki 发表于 2022-10-31 19:04
打算买的3个GPU节点都是4090*2+7R32*2，现在准备重新考虑下CPU了

服务器cpu+4090确实发挥不出最大的性能

Sam_Wang · 发表于 Post on 2022-11-11 21:28:11

即使性能再好，如果不能够调用资源，根本没有任何意义！所以，没有必要去追求高配置的硬件，炒作没有任何意义！

Picardo · 发表于 Post on 2022-11-27 08:27:20

请教一下，我看有人说7950问题很多，包括4条内存的时候开机自检极慢，我看有说400秒的，还有的人说有掉显卡驱动现象。前面那个等等还好，后面这个听起来挺吓人

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-11-27 12:22:33

Picardo 发表于 2022-11-27 08:27
请教一下，我看有人说7950问题很多，包括4条内存的时候开机自检极慢，我看有说400秒的，还有的人说有掉显卡 ...

第一个问题更新BIOS即可解决。第二个问题属无稽之谈，GPU驱动与CPU无关；“掉驱动”在NVIDIA GPU上极少见，互联网上炒作的此种现象多为AMD GPU。

Picardo · 发表于 Post on 2022-11-27 13:48:01

Entropy.S.I 发表于 2022-11-27 12:22
第一个问题更新BIOS即可解决。第二个问题属无稽之谈，GPU驱动与CPU无关；“掉驱动”在NVIDIA GPU上极少见 ...

了解，谢谢。等我装的时候看看13900和7950哪个性价比高

tiantian365 · 发表于 Post on 2022-11-28 14:53:41

请教一下楼主，同时满足gaussian、ORCA和GMS的CPU选择AMD还是intel？AMD的话现阶段5950X+B550M性价比真的高；intel的话上铂金CPU+C621主板的性价比太低了。谢谢！

Entropy.S.I · 发表于 Post on 2022-11-28 21:02:17

本帖最后由 Entropy.S.I 于 2022-11-28 21:12 编辑

tiantian365 发表于 2022-11-28 14:53
请教一下楼主，同时满足gaussian、ORCA和GMS的CPU选择AMD还是intel？AMD的话现阶段5950X+B550M性价比真的高 ...

1. 是gmx不是gms
2. 7950X+B650性价比更高
3. 硬要把量化机子和经典MD机子凑成1台，选7950X+RTX 4090即可
4. 仔细阅读本文

tiantian365 · 发表于 Post on 2022-11-29 10:11:30

Entropy.S.I 发表于 2022-11-28 21:02
1. 是gmx不是gms
2. 7950X+B650性价比更高
3. 硬要把量化机子和经典MD机子凑成1台，选7950X+RTX 4090即 ...

非常感谢，懂了

yihanxu · 发表于 Post on 2022-12-22 14:39:32

老师我想请教一下，ReaxFF/C和ReaxFF是一回事吗？那如果RTX4090+Intel i7-13700KF,跑ReaxFF/C是不是也可以，只是不能用GPU加速而已？

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[硬件评测] 性能翻倍？RTX4090科学计算之经典MD模拟全面测试