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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 使用Dushin分解重组能和计算Huang-Rhys因子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-4 20:52:48 | 只看该作者 Only view this author
ZHANGZY 发表于 2017-8-4 19:17
sobereva老师,我注意到,您在这个例子中算T1的frequency,不是按照激发态频率分析计算的,而是利用T1态的 ...

如果你是指为什么不用0 1结合TD=triplet来优化和算频率而用0 3结合UKS来做,是因为后者便宜得多,而且原理上结果更好,因为轨道是对三重态优化的,而前者只是基于单重态轨道产生的三重态信息
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2018-4-18 10:45:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,您好。ΔQi 的值能大道10-33吗?

In dushin, the vibrational modes C:\123.png

 ΔQi represents the displacement along the i-th normal mode coordinate between the equilibrium positions of the charged state and the neutral state

123.png (10.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 446)

123.png

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发表于 Post on 2018-4-18 20:29:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,您好。
我坐tdopt+freq 写入opt=z-matrix。发现计算最后,振动相关内坐标定义发生改变与最初的定义相差很远,导致我利用dushin计算重组能时,没法计算(supplem.geom显示 内坐标不匹配)。
请问有什么好的办法固定opt和freq的内坐标形式?

supplem.geom

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发表于 Post on 2019-4-30 19:26:01 | 只看该作者 Only view this author
老师,您好,我按照您说的方法进行计算,在计算过渡金属的时候都没有问题,但是在计算有机分子的时候,输出数据都是0,这是什么原因导致的呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-1 06:23:10 | 只看该作者 Only view this author
胖嘟嘟123 发表于 2019-4-30 19:26
老师,您好,我按照您说的方法进行计算,在计算过渡金属的时候都没有问题,但是在计算有机分子的时候,输出 ...

没细节没法说,自行检查输出信息搞清楚,尝试变化不同计算条件
这和是过渡金属体系还是有机体系没有直接关系
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发表于 Post on 2019-7-23 11:37:51 | 只看该作者 Only view this author
卢老师,又没有可能算出来的重组能是0呢,假如算的是S1-T1之间的重组能。

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发表于 Post on 2019-7-23 11:39:52 | 只看该作者 Only view this author
凉白开 发表于 2019-7-23 11:37
卢老师,又没有可能算出来的重组能是0呢,假如算的是S1-T1之间的重组能。

补充照片

picture.png (10.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 460)

picture.png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-23 18:59:02 | 只看该作者 Only view this author
凉白开 发表于 2019-7-23 11:37
卢老师,又没有可能算出来的重组能是0呢,假如算的是S1-T1之间的重组能。

在有人回复前,补充图片的时候请直接编辑原先帖子,而非单独发新帖子。

原理上不可能,毕竟S1和T1极小点不同
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发表于 Post on 2019-7-23 21:24:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-23 18:59
在有人回复前,补充图片的时候请直接编辑原先帖子,而非单独发新帖子。

原理上不可能,毕竟S1和T1极小 ...

谢谢卢老师的回答,我以后注意,这波操作有点菜鸟,哈哈

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发表于 Post on 2019-7-23 21:26:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-23 18:59
在有人回复前,补充图片的时候请直接编辑原先帖子,而非单独发新帖子。

原理上不可能,毕竟S1和T1极小 ...

所以,这有可能是个计算操作问题,是吗,卢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-24 22:23:49 | 只看该作者 Only view this author
凉白开 发表于 2019-7-23 21:26
所以,这有可能是个计算操作问题,是吗,卢老师

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发表于 Post on 2019-7-25 10:26:47 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢卢老师!

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发表于 Post on 2019-11-15 07:08:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ZHANGZY 于 2019-11-15 08:54 编辑

sobereva老师,
QM/mm FREQ算出的fch 和 log ,在应用dushin的时候,说是 “too many atoms, increase M”。
把m调高到10000
重新编译DUSHIN,编译通过
结果计算时,segment 错误,该如何处理?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-16 13:12:46 | 只看该作者 Only view this author
ZHANGZY 发表于 2019-11-15 07:08
sobereva老师,
QM/mm FREQ算出的fch 和 log ,在应用dushin的时候,说是 “too many atoms, increase M” ...

我没试过,可能其它有些地方由于是固定长度的数组,也需要相应地修改
得调试代码
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发表于 Post on 2020-4-3 00:13:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yvette 于 2020-4-3 11:43 编辑

sob老师,dushin提取基态S0和激发态S1的重组能使,DOS界面运行dushin.exe报错:int defn changed for coord   50
S1的优化构型是基于S0的优化构型做的TD优化,可还是出现这种错误,该怎么修改呢?谢谢

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