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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 使用Dushin分解重组能和计算Huang-Rhys因子

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-4 05:31:10 | 只看该作者 Only view this author
I10140317 发表于 2023-11-3 18:29
重组能算法跟势能面相对位置是否相关呢?看论坛里面的帖子,如果是四点法的话好像适用于左图,如果是两点法 ...

右图情况依然是(E2-E4) + (E3-E1)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2024-4-1 23:27:25 | 只看该作者 Only view this author
I got the following error after running the dushin.exe from windows- 'Microsoft Windows [Version 10.0.19045.4170]
(c) Microsoft Corporation. All rights reserved.

C:\Users\HP>cd C:\Dushin_win32_bin\Dushin_win

C:\Dushin_win32_bin\Dushin_win>dushin
Enter ifcurve (0=recti, 1=orth curvi, 2=apprx curvi, -1 = skip
And atom ordering flag, 0= never changes, 1= use the first order thenceforth,
  2= deduce it (does read on fail), 3= always read it
Reading file:
./S0_freq.out

  Entering Gaussian System, Link 0=g09

Gaussian format, type: g94, g98, g03= F F F
  Normal termination of Gaussian 09 at Sun Mar 31 02:12:06 2024.
cant determine energy type

C:\Dushin_win32_bin\Dushin_win>'

Can u pls help?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-3 02:19:48 | 只看该作者 Only view this author
Abhijit@123 发表于 2024-4-1 23:27
I got the following error after running the dushin.exe from windows- 'Microsoft Windows [Version 10. ...

The old version of Dushin has poor compatibility with certain output file of Gaussian. There are newer and modified versions of Dushin in this forum, which may work, but I don't have relevant experience.
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发表于 Post on 2024-4-21 00:35:55 | 只看该作者 Only view this author
I am getting the following error when running DUSHIN- "  UNMAPPED #2 atom            1           6
TRYING LOCATION ONLY--- READ IN ORDER
forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 5, file C:\Dushin_win32_bin\Dushin_win\dushin.dat
Image              PC        Routine            Line        Source
dushin.exe         004C3330  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         0048A516  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         00478722  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         00477A64  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         00458360  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         0045627A  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         0043B495  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         00401F33  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         004C45F3  Unknown               Unknown  Unknown
dushin.exe         004ADF6E  Unknown               Unknown  Unknown
KERNEL32.DLL       7775FCC9  Unknown               Unknown  Unknown
ntdll.dll          77A47C5E  Unknown               Unknown  Unknown
ntdll.dll          77A47C2E  Unknown               Unknown  Unknown"

Can anyone help me?

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发表于 Post on 2024-5-10 01:25:34 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,您好,我照着您写的吡啶的教程,算了一遍,最后使用Dushin输出重组能这些信息的时候,得到的out文件里,直输出到“The point group of the molecule is C2V
”这一行,后面就没有了,是什么原因呢?我拿您的吡啶文件,能输出全部信息。为了判断是我的fch文件还是out文件有问题,我挨个和您文件里的fch和out文件替换了,发现是我的out有问题,我的fch文件搭配您的out文件,也能输出全部信息。这是什么原因导致的?盼复

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发表于 Post on 2024-7-10 18:57:55 | 只看该作者 Only view this author
请问一下各位老师,如果window系统没有Fortran编译器,那么就会出现dushin闪退--打不开的现象呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-10 23:19:28 | 只看该作者 Only view this author
heidou 发表于 2024-7-10 18:57
请问一下各位老师,如果window系统没有Fortran编译器,那么就会出现dushin闪退--打不开的现象呢

命令行下运行
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发表于 Post on 2024-7-11 11:07:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 heidou 于 2024-7-11 11:09 编辑

sob老师,非常感谢您!
我在网上查询了命令行下运行的方法:以下是我的操作
1.将dushin的文件移入program Files--C 盘 (之前是在D盘直接复制到C 盘的)
2.将在命令提示符下输入start c:\program files\dushin\dushin.exe
结果:显示系统找不到文件C:\Users\manli\Desktop\图片1

图片1.png (297.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 55)

图片1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-11 15:40:33 | 只看该作者 Only view this author
heidou 发表于 2024-7-11 11:07
sob老师,非常感谢您!
我在网上查询了命令行下运行的方法:以下是我的操作
1.将dushin的文件移入progr ...

别放在有空格的路径下,自找麻烦
https://www.youtube.com/watch?v= ... xT4JbMu&index=1这套视频了解点命令行运行的基本常识
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发表于 Post on 2024-7-11 16:03:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-11 15:40
别放在有空格的路径下,自找麻烦
看https://www.youtube.com/watch?v=MBBWVgE0ewk&list=PL6gx4Cwl9DGDV6 ...

非常感谢sob老师

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发表于 Post on 2024-7-21 18:25:08 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,请问我在命令提示符下运行dushin时,输入 start dushin.exe为什么依旧出现闪退的情况呢

图片1.png (117.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 59)

dushin文件

dushin文件

图片2.png (5.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

命令提示符的输入内容

命令提示符的输入内容

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-23 03:39:53 | 只看该作者 Only view this author
heidou 发表于 2024-7-21 18:25
各位老师,请问我在命令提示符下运行dushin时,输入 start dushin.exe为什么依旧出现闪退的情况呢

仔细看3.2节

另外,写start完全多余
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发表于 Post on 2024-7-24 09:11:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-7-23 03:39
仔细看3.2节

另外,写start完全多余

收到,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2024-12-16 09:03:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,您好,我按照上述dushin方法计算金属配合物的重组能,结果输出是0,不知道哪里出错了。想请您看下。用吡啶作为例子测试没有问题。

202412160900194982..png (70.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

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发表于 Post on 2024-12-17 08:11:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva老师,您好,我按照上述方法使用Dushin分解金属配合物的重组能,但是输出的结果为0,想请您看下哪里出错了,输入文件和结果如下。

202412170810115869..png (169.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

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