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楼主 Author: sobereva
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[量化理论] 谈谈量子化学中基组的选择

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发表于 Post on 2023-5-9 07:17:34 | 只看该作者 Only view this author
老师,请问:
1.在计算同一个体系时,不同任务可以使用不同的方法吗?
2.文中最低可接受级别是针对所有任务吗?
3.若是优化使用b3lyp/6-31g*,能量计算用其他更先进的方法,把基组增加两个档次,是基于6-31g*,还是基于该方法的最低可接受级别?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 21:57:37 | 只看该作者 Only view this author
limen 发表于 2023-5-9 07:17
老师,请问:
1.在计算同一个体系时,不同任务可以使用不同的方法吗?
2.文中最低可接受级别是针对所有任 ...

1 看具体什么任务
通常只有几何优化、振动分析、跑IRC必须严格用相同基组
2 否
3 最低可接受级别是有可能发文章的底限,但非要用底限就如同穿破衣烂衫上街,会糟严重歧视,而且像样的商场都进不去
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发表于 Post on 2023-5-10 23:20:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-10 21:57
1 看具体什么任务
通常只有几何优化、振动分析、跑IRC必须严格用相同基组
2 否

老师,也就是说不同计算任务之间可以用不同的方法,比如优化用b3lyp,能量用后HF方法?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 23:35:00 | 只看该作者 Only view this author
limen 发表于 2023-5-10 23:20
老师,也就是说不同计算任务之间可以用不同的方法,比如优化用b3lyp,能量用后HF方法?

司空见惯的组合

诸如此文介绍的carbon文章,DFT优化,DLPNO-CCSD(T)算单点
理论设计由18碳环与锂原子构成的电场可控的光学开关
http://sobereva.com/630http://bbs.keinsci.com/thread-27232-1-1.html
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发表于 Post on 2023-5-11 12:21:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-10 23:35
司空见惯的组合

诸如此文介绍的carbon文章,DFT优化,DLPNO-CCSD(T)算单点

谢谢,老师

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发表于 Post on 2023-6-1 20:24:17 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2021-3-9 15:38
什么是双电离,是指电离掉两个电子的苯分子?那样的话电离掉的应该是π电子,σ键键级应该不受影响,为什 ...

很喜欢你的signature,尤其是最后一句

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发表于 Post on 2023-6-2 13:55:58 | 只看该作者 Only view this author
超限制抱怨 发表于 2023-6-1 20:24
很喜欢你的signature,尤其是最后一句

这段话原本是Accelerator在他的微信公众号仿写的《生活在树上》,但后来公众号莫名其妙404了,咱也不知道咱也不敢问……

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现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2023-6-10 00:52:26 | 只看该作者 Only view this author
请问以下情况计算水平是否合适?
体系:小分子体系,负离子,9-10个原子,涉及C、H及S(或O,或OS都有)
(1)优化:M06-2X-D3/6-311+G**
M06-2X-D3与B3LYP-D3(BJ)相比,因涉及到TS计算,是否前者更靠谱?基组6-311+G**是否足够?
(2)单点能:CCSD(T)/def2-QZVPP
CCSD(T)是否合适?基组是否需要调整,如aug-cc系列?

以前没涉及过这种小分子体系的计算,请指教!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-10 07:16:50 | 只看该作者 Only view this author
gengle 发表于 2023-6-10 00:52
请问以下情况计算水平是否合适?
体系:小分子体系,负离子,9-10个原子,涉及C、H及S(或O,或OS都有)
...

如果有的原子上负电荷很集中,算单点的时候需要给相应原子带弥散。其它没问题
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发表于 Post on 2023-6-10 09:02:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-10 07:16
如果有的原子上负电荷很集中,算单点的时候需要给相应原子带弥散。其它没问题

多谢Sob老师。

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发表于 Post on 2023-6-10 11:11:28 | 只看该作者 Only view this author
卢老师,您好,您在《通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性》(http://sobereva.com/216)一文中的第二节计算苯的 NMR ,示例的基组是6-31+G*。学生不是特别理解为什么要加弥散函数,因为您经常强调不需要加弥散函数的时候就别加弥散函数。如果将基组换成 def2-SVP 是否也合理呢。
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
School of Electronic Science and Engineering (National Model Microelectronics College)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-10 17:38:52 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-6-10 11:11
卢老师,您好,您在《通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性》(http://sobereva.com/216)一文 ...

被计算的位置偏离原子核较远
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发表于 Post on 2023-6-11 17:59:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-10 17:38
被计算的位置偏离原子核较远

感谢卢老师的回答,还想问一下如果在b97-2/def2SVP的级别下计算,一个20原子左右共轭稠环的ICSS,是否也可行呢
KimariYB, Postgraduate, XiaMen University
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 10:40:41 | 只看该作者 Only view this author
kimariyb 发表于 2023-6-11 17:59
感谢卢老师的回答,还想问一下如果在b97-2/def2SVP的级别下计算,一个20原子左右共轭稠环的ICSS,是否也 ...

不是不行,但这么小的体系,没有理由不用更好点的基组
另外,B97-2相对来说适合算核化学位移(取决于原子核位置的磁屏蔽张量),这不意味着它计算ICSS有什么好处。用这样冷门的泛函还得给别人解释,还不如用诸如B3LYP、wB97XD这些常用的
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发表于 Post on 2023-8-16 16:20:58 | 只看该作者 Only view this author
请教各位老师,对于溶液中的硫酸盐的形成机理的计算(20个原子左右),主要为氢转移的过程,在PWPB95-D3/def2-TZVPP//ωB97X-D3/def2-SVP水平下计算是否合理、够用?谢谢。

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