计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3313|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 基于配分函数的TST理论计算反应速率,势垒高度的选择问题

[复制链接 Copy URL]

16

帖子

0

威望

903

eV
积分
919

Level 4 (黑子)

本帖最后由 alanzhou 于 2023-3-2 20:44 编辑

各位老师好,最近在采用基于配分函数的TST理论进行反应速率常数计算时,公式为:
其中关于势垒高度,sob老师在基础培训班中给出的是TS与反应物的U(0)之差,也即电子能量+ZPE;
但是我在Truhlar教授关于过渡态理论的论述中(“Generalized Transition State Theory”, D. G. Truhlar, A. D. Isaacson, and B. C.Garrett, in The Theory of Chemical Reaction Dynamics, edited by M. Baer (CRC Press, Boca Raton, FL, 1985), Vol. 4, pp. 65-137.),发现该势垒的描述为:

该表述采用“经典势能”来指势垒。在Truhlar组的Polyrate软件中,"Classical barrier"就是单纯的势能(电子能量)之差,不含ZPE。
于是,我在采用Polyrate进行测试时,采用IVTST-0方法,此时相当于TST(Polyrate Manual Page 53)。通过sob老师的TST计算表格(Tian Lu, TSTcalculator, http://sobereva.com/310),结合Polyrate输出文件中的势垒(Polyrate会同时输出V以及V+ZPE形式的势垒)以及配分函数信息,代入计算298K下的速率常数,发现Polyrate在采用TST计算时确实用的是“Classical barrier",也即电子能量V之差,而不是V+ZPE。Polyrate输入、输出文件及TST Excel表格计算结果测试见文末。
请问各位老师,基于配分函数的TST理论计算反应速率时,势垒高度到底该选择哪个呢?
ch3ofu29tr1.dat (1.61 KB, 下载次数 Times of downloads: 2) ch3ofu29tr1.fu6 (35.84 KB, 下载次数 Times of downloads: 1) ch3ofu29tr1.fu29 (339 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1) TSTcalculator.xlsx (14.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125136

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-3-3 05:37:04 | 只看该作者 Only view this author
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html

表格的注释里写明了

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
alanzhou + 5 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

16

帖子

0

威望

903

eV
积分
919

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-3 09:14:02 | 只看该作者 Only view this author
明白了,谢谢社长回复!!!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 12:49 , Processed in 0.252141 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list