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[综合讨论] 计算离子从晶体中溶解到溶液相中体系能量的变化,该用什么方法来处理

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各位老师好,

       我想请教一下我想模拟晶体中的一种离子溶解到溶液相过程中, 能量的变化情况。这个时候应该该怎么考虑,是用AIMD吗?还是传统的静态计算(我感觉静态计算没法处理溶液体系)?还有哪个软件能可以实现这个过程。

谢谢老师。

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发表于 Post on 2023-4-2 04:03:26 | 只看该作者 Only view this author
设计个热力学循环。晶体先解离成气态离子(假设是离子晶体),能量变化通过晶格能体现。然后气态离子进入溶液相,通过溶解自由能体现。这两个量都是可以理论计算的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2023-4-4 17:58:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-2 04:03
设计个热力学循环。晶体先解离成气态离子(假设是离子晶体),能量变化通过晶格能体现。然后气态离子进入溶 ...

sob老师,我的也在计算这个过程,我的晶体是个盐,我是这样想的,整个溶解过程是,晶胞中的离挣脱束缚到真空自由状态(这属于晶格能),然后从真空自由状态溶进溶剂中(前后能量变化属于溶剂化能)。在高斯中我i没有发现能计算晶胞总能量的,所以我用MS计算的晶格能=(晶胞总能量-自己分别画的优化后的两种离子的能量)/晶胞中阴阳离子对数,然后打算用高斯计算真空自由状态的离子在溶剂中的能量,我打算画出离子来,按着您之前发的溶解自由能的模板中的1,3,4步骤计算出离子在真空和溶剂下的能量,然后阴阳离子能量的变化加和处理就得到该物质的溶剂化能,不知道这么做可以吗。
现在不知道咋给离子里面的某个原子加上电荷

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发表于 Post on 2023-4-5 06:47:32 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai123 发表于 2023-4-4 17:58
sob老师,我的也在计算这个过程,我的晶体是个盐,我是这样想的,整个溶解过程是,晶胞中的离挣脱束缚到 ...

原理上可以。但注意靠SMD算离子体系的溶解自由能精度不理想,至少不如用uESE
比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用
http://sobereva.com/593http://bbs.keinsci.com/thread-22879-1-1.html

给某原子加电荷毫无意义。注意看此文最后一节
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82
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发表于 Post on 2023-4-5 10:17:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-5 06:47
原理上可以。但注意靠SMD算离子体系的溶解自由能精度不理想,至少不如用uESE
比SMD算溶解自由能更好的溶 ...

sob老师,我看了您说的uEsE、模型,但在结尾处看到适用于电荷为1的离子,我的两种离子电荷都是2,所以用SMD跟用uEsE是不是就说不上谁好谁坏了
还有双杂化溶剂模型有文章参考吗

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发表于 Post on 2023-4-5 14:47:16 | 只看该作者 Only view this author
可以用Slow-growth方法模拟

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发表于 Post on 2023-4-6 06:37:24 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai123 发表于 2023-4-5 10:17
sob老师,我看了您说的uEsE、模型,但在结尾处看到适用于电荷为1的离子,我的两种离子电荷都是2,所以用S ...

没听说过什么双杂化溶剂模型

不要光看总的净电荷,还要看体系大小、净电荷的分布。倘若总的净电荷为2,但净电荷在大范围摊开,SMD也不会多差。反之,1价单原子离子,任何隐式溶剂模型都算不准,必须杂化溶剂模型。
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