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[ORCA] orca安装时openmpi编译错误

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麻烦各位老师帮忙看一下,万分感谢!
centos7版本的Linux,但是服务器不能使用yum命令,通过网上教程上传rpm包安装好了gcc,系统里面有gfortran。但是还是无法成功编译openmpi:checking for perl... noconfigure: error: "Open MPI requires perl. Aborting"

1.JPG (218.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

已经安装gcc和gfortran

已经安装gcc和gfortran

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发表于 Post on 2023-7-3 18:50:58 | 只看该作者 Only view this author
提示得很明白,Open MPI requires perl. Aborting  缺少perl

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-3 21:56:35 | 只看该作者 Only view this author
PoorChaos 发表于 2023-7-3 18:50
提示得很明白,Open MPI requires perl. Aborting  缺少perl

嗯嗯,但是我先去网上查了一下,但是不知道该下载哪一个Perl文件

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发表于 Post on 2023-7-4 07:28:25 | 只看该作者 Only view this author
http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html
不过,可能需要源码编译安装singularity。

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发表于 Post on 2023-7-4 08:51:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-7-4 08:54 编辑

从你的截图看不出来有gfortran。最好再运行一下
which gfortran
gfortran --version
另外,如果你这机器可以重装系统,不妨新装一个(因为连十分基础的perl都没有、gcc还是刚通过rpm包安装的,基本上就是当初安装时 装的是去掉大量选项的精简阉割版),新装一个系统多花的半小时~1小时,远比你在老系统里解决问题省时得多(因为你之后还会碰到很多问题)。
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发表于 Post on 2023-7-4 15:26:53 | 只看该作者 Only view this author
服务器能联网吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-5 15:55:20 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2023-7-4 08:51
从你的截图看不出来有gfortran。最好再运行一下
which gfortran
gfortran --version

好的,谢谢你,我问问导师能不能重新装一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-5 15:58:02 | 只看该作者 Only view this author

用的校园网,好像没办法通外网,所以也用不了yum命令,我昨天本来按照网上的rpm方法准备把缺少的依赖安装好的,但是rpm方法好麻烦,就没装好

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-5 16:00:22 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2023-7-4 07:28
http://bbs.keinsci.com/thread-26418-1-1.html
不过,可能需要源码编译安装singularity。

谢谢!但是实验室的服务器没办法用yum命令。。

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发表于 Post on 2023-7-5 16:08:56 | 只看该作者 Only view this author
morningya 发表于 2023-7-5 16:00
谢谢!但是实验室的服务器没办法用yum命令。。

非root编译安装singularity/apptainer.
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发表于 Post on 2023-7-5 16:12:03 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2023-7-5 16:13 编辑

你都有root了,还不能联网,这就很费解了。建议问问管理员如何联网。

大概率是你没在服务器上登录校园网。

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发表于 Post on 2023-7-5 16:25:32 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2023-7-5 16:12
你都有root了,还不能联网,这就很费解了。建议问问管理员如何联网。

大概率是你没在服务器上登录校园网 ...

看样子应该不是超算,系统是中文的红帽子,估计是很他们实验室自己的小工作站,然后很久之前的学生(已经毕业了)安装的系统,也没有什么管理员。

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发表于 Post on 2023-7-5 16:45:18 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2023-7-5 16:25
看样子应该不是超算,系统是中文的红帽子,估计是很他们实验室自己的小工作站,然后很久之前的学生(已经 ...

是啊,小工作站应该是可以联网的。

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发表于 Post on 2024-3-11 09:36:05 | 只看该作者 Only view this author
请问各位老师,我在服务器上安装的ORCA5.0.3,算完之后有这个输出的文件,里面有说有一些错误,我不懂安装和Linux系统的知识,只会简单操作,但是用这个安装的软件又能进行计算,想请老师们帮忙看看安装的有没有问题,算的结果是否可靠能用?

slurm-5765388.out

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