计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1567|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 模拟水表面张力,与实验值差别较大

[复制链接 Copy URL]

18

帖子

0

威望

1429

eV
积分
1447

Level 4 (黑子)

本帖最后由 五好先森 于 2023-9-6 20:31 编辑

我用Gromcas模拟298K,1atm下水(spc/e模型)的表面张力,为60 mN/m,与社长的文章(https://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract29166.shtml)中结果相符,但是都明显小于实际测量值(~70 mN/m)。

但是有些文献中用LAMMPS,能得到非常接近实际值的水表面张力,如:https://doi.org/10.1021/jp048773n,该文献用的是F3C水模型。

请问,利用Gromacs能获得更准确的表面张力结果吗?是不是我只能改学LAMMPS了。

16

帖子

0

威望

1978

eV
积分
1994

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-9-6 22:39:20 | 只看该作者 Only view this author
http://bbs.keinsci.com/thread-25479-1-1.html
不同水模型对表面张力的重现性有差异

18

帖子

0

威望

1429

eV
积分
1447

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-7 08:34:16 | 只看该作者 Only view this author
thou 发表于 2023-9-6 22:39
http://bbs.keinsci.com/thread-25479-1-1.html
不同水模型对表面张力的重现性有差异

多谢提点。我主要关注油水界面张力,看来得多尝试几种水模型了。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-9-8 01:33:16 | 只看该作者 Only view this author
直接用OPC就完了,算各种属性都很好
跟程序本身毫无关系,而GROMACS效率远高于LAMMPS,毫无换LAMMPS的意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

18

帖子

0

威望

1429

eV
积分
1447

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-8 08:44:51 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-8 01:33
直接用OPC就完了,算各种属性都很好
跟程序本身毫无关系,而GROMACS效率远高于LAMMPS,毫无换LAMMPS的意义

社长好,我换了OPC水模型计算水的表面张力,298 K、1 atm条件下结果为73.49 mN/m,基本符合实验值(~70 mN/m),比SPC/E更准确。但是用OPC水模型计算的298 K、1 atm条件下水-正癸烷界面张力为58.00 mN/m,与实验值(51.98 mN/m)的偏差大于SPC/E水模型计算结果(52.21 mN/m)。

这让我感到有些纠结,当既要关注油-水界面张力又要关注水表面张力的情况下,担心统一都用OPC会导致界面张力偏差较大,能不能分情况使用两种模型啊?这样做又害怕会被质疑。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2023-9-8 14:37:27 | 只看该作者 Only view this author
五好先森 发表于 2023-9-8 08:44
社长好,我换了OPC水模型计算水的表面张力,298 K、1 atm条件下结果为73.49 mN/m,基本符合实验值(~70 m ...

如果确信误差就是来自于水模型而不是其它因素,也可以尝试OPC3或TIP4P-FB,看是否有更均衡的描述
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

18

帖子

0

威望

1429

eV
积分
1447

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-8 19:36:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-8 14:37
如果确信误差就是来自于水模型而不是其它因素,也可以尝试OPC3或TIP4P-FB,看是否有更均衡的描述

明白明白,多谢社长。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 07:44 , Processed in 0.257874 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list