求助：使用VMD加载xtc文件出现问题

wanzongliang · 发表于 Post on 2023-10-27 15:25:12

请问一下各位老师，我对自己的体系进行了300ns的平衡模拟，期间没有报错正常运行，将得到的xtc文件载入VMD之后出现了如图的情况，有人知道这是什么原因应该如何解决吗

Yaocy · 发表于 Post on 2023-10-27 16:15:47

本帖最后由 Yaocy 于 2023-10-27 16:16 编辑

如果你是想问这些特别长的键怎么处理的话，在VMD中设置：Graphic -> Representations -> Drawing Method -> DynamicBonds。

wanzongliang · 发表于 Post on 2023-10-27 16:33:29

Yaocy 发表于 2023-10-27 16:15
如果你是想问这些特别长的键怎么处理的话，在VMD中设置：Graphic -> Representations -> Drawing Method -> ...

是的，非常感谢

snljty2 · 发表于 Post on 2023-10-27 17:07:15

wanzongliang · 发表于 Post on 2023-10-30 11:30:31

snljty2 发表于 2023-10-27 17:07
看 http://bbs.keinsci.com/thread-20047-1-1.html 的3楼。

完全明白了万分感谢

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[GROMACS] 求助：使用VMD加载xtc文件出现问题