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楼主 Author: sobereva
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[量化理论] 优化长程校正泛函w参数的简便工具optDFTw

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-5 08:03:10 | 只看该作者 Only view this author
ZHANGZY 发表于 2020-5-4 23:18
求助:
对MN12SX函数使用optdftW时,出现了错误:
Cannot do LC of positive exchange functional values ...

这是泛函不是函数
此泛函是短程高HF成份而长程HF成分为0,和一般的长程校正泛函明显不同,optDFTw不适合这种情况
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-5-7 19:14:07 | 只看该作者 Only view this author
多谢,我再试试scanDFTw

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发表于 Post on 2020-6-28 12:17:06 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,你好,我看你举的例子是LC-wPBE,我想问下针对一些自定义的LC泛函,如LC-PBE0,程序是否还适用?我推测程序应该也是先把关键词转化成IOP,然后调控IOP里的W值去做优化,如果IOP自定义的话我担心会不会出问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-29 01:01:55 | 只看该作者 Only view this author
I10140317 发表于 2020-6-28 12:17
sob老师,你好,我看你举的例子是LC-wPBE,我想问下针对一些自定义的LC泛函,如LC-PBE0,程序是否还适用?我 ...

程序自动在模板文件的关键词基础上增加对3/107和3/108的设置。
如果对于LC-PBE0你只需要优化w参数,可以用此程序,把下文里提到的LC-PBE0自定义方法中除了IOp(3/107=0300000000,3/108=0300000000) 都写上即可。
在Gaussian中自定义范围分离泛函的方法
http://sobereva.com/550http://bbs.keinsci.com/thread-17256-1-1.html
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发表于 Post on 2020-10-27 10:22:23 | 只看该作者 Only view this author
sob老师好,请问可否提供optDFTw的源代码?我最近想把orca和optDFTw结合起来用,如果能有optDFTw的源代码的话,我做一个适用于orca的optDFTw版本应该不麻烦,顺便也能给大家用。如果不方便公开源代码的话,也可以私下给。谢谢!
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2020-10-27 10:56:58 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-27 10:22
sob老师好,请问可否提供optDFTw的源代码?我最近想把orca和optDFTw结合起来用,如果能有optDFTw的源代码的 ...

源代码不是在压缩包里面已经有了吗?

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发表于 Post on 2020-10-27 15:02:40 | 只看该作者 Only view this author
让你变成回忆 发表于 2020-10-27 10:56
源代码不是在压缩包里面已经有了吗?

好吧,只在g09的那个压缩包里有,我之前只看了g16的压缩包。
谢谢!
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2020-11-1 16:15:44 | 只看该作者 Only view this author
我把optDFTw的ORCA版写完了,并且还增加了对于非中性体系,以及自旋多重度不是1的体系的支持(因此除了提供ORCA版的optDFTw以外,我还更新了G09和G16版的optDFTw)。注意对于自旋多重度不是1的体系,程序假定其得到电子和失去电子后自旋多重度都比原来少1,而不是比原来多1。这个假设一般是成立的,但也有例外,如果碰到例外情况可以手动修改源代码解决。

使用方法:
G09和G16:同sob老师主楼的使用方法
ORCA:需要在PATH环境变量中添加ORCA的路径,对于并行计算还需设定LD_LIBRARY_PATH等并行计算需要的环境变量。总之需要设定的参数和单独跑ORCA是相同的。程序调用方式和高斯的情况相同,但模板输入文件应命名为template.inp而非template.gjf。

如果使用中遇到问题,欢迎回复本帖反馈。

optDFTw-orca-windows.rar (245.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 57) optDFTw-orca-linux.tar.bz2 (325.31 KB, 下载次数 Times of downloads: 98)


optDFTw-g16-windows.rar (245.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

optDFTw-g16-linux.tar.bz2 (325.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 54) optDFTw-g09-windows.rar (245.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

optDFTw-g09-linux.tar.bz2 (325.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)



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Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-10-28 19:37:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 I10140317 于 2021-10-28 19:39 编辑

sob老师,您好!我想请教一下,如果要考虑溶剂效应(隐式溶剂模型)计算吸收光谱,是应该在基态加上溶剂效应优化w,然后算TDDFT;还是应该在气相优化w,然后在TDDFT增加相应的溶剂关键词?哪种计算方式可能更合理一些?因为优化w的原理是Koopmanns定理,我不太清楚如果用溶剂模型的话,Koopmans定理是不是依旧成立的?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-10-29 06:58:03 | 只看该作者 Only view this author
I10140317 发表于 2021-10-28 19:37
sob老师,您好!我想请教一下,如果要考虑溶剂效应(隐式溶剂模型)计算吸收光谱,是应该在基态加上溶剂效 ...

看这篇里的讨论DOI: 10.1002/jcc.26101
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发表于 Post on 2021-10-29 13:35:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 I10140317 于 2021-10-29 16:13 编辑
sobereva 发表于 2021-10-29 06:58
看这篇里的讨论DOI: 10.1002/jcc.26101

sob 老师,谢谢您的回复!我看了您发的这篇文章,文章涉及到优化C0和C1两个参数,但是这两个参数主要是用于调控percent of Long Range HF exchange,也就是beta参数,是仅跟泛函相关的,文章中得到了LC-BLYP等泛函的参数。如果我想用其他该文章中没有拟合的泛函,如LC-wPBE等,那么可不可以通过气相optDFTw优化得到w后,固定w,再用类似optDFTw的算法优化beta参数即可?而不用去管C0和C1的参数。

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发表于 Post on 2021-12-27 20:39:16 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,调节w值,做单点的初始结构需要什么样的结构,需要基态优化结构去做吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-28 21:34:23 | 只看该作者 Only view this author
张业文 发表于 2021-12-27 20:39
请问老师,调节w值,做单点的初始结构需要什么样的结构,需要基态优化结构去做吗?

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发表于 Post on 2021-12-29 20:26:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 张业文 于 2021-12-29 20:27 编辑

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2022-11-11 10:48:39 | 只看该作者 Only view this author
卢老师您好,我想计算一个Cl2阴离子自由基的性质(Cl自由基和Cl离子耦合而成),文献中表明这个体系LC-wPBE范围分离泛函描述的挺好,我如果想要优化w参数,对于这种自由基体系调控w的标准还是满足Koopmans定理吗?麻烦卢老师~

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