计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 201|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Quantum ESPRESSO] 将QE生成的电荷密度.cube文件加载到Multiwfn中做拓扑分析时报错

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

84

eV
积分
98

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
将QE生成的电荷密度.cube文件加载到Multiwfn中,选择2拓扑分析,依次2,3,4,下一步8生成键径时出现以下错误:Error: You must at least locate one (3,-1) CP before trying to generate topology paths!
Press ENTER button to continue该怎么解决呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-10-12 11:12:08 | 只看该作者 Only view this author
仔细看下文搞清楚支持什么输入文件格式
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://sobereva.com/379http://bbs.keinsci.com/thread-6020-1-1.html

对于cube文件,只能用格点数据插值方式做拓扑分析,没法直接选电子密度。仔细看下文第3节
使用Multiwfn结合CP2K做周期性体系的atom-in-molecules (AIM)拓扑分析
http://sobereva.com/717http://bbs.keinsci.com/thread-46927-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

14

帖子

0

威望

84

eV
积分
98

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-12 15:52:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-12 11:12
仔细看下文搞清楚支持什么输入文件格式
详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换
http://s ...

谢谢社长,我再研究研究。

3621

帖子

3

威望

1万

eV
积分
18425

Level 6 (一方通行)

第一原理惨品小作坊

4#
发表于 Post on 2024-10-13 10:49:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 卡开发发 于 2024-10-13 11:00 编辑
r.wang 发表于 2024-10-12 15:52
谢谢社长,我再研究研究。

你应该用pp.x的plot_num=21,价电子密度是赝势算出来赝电子密度,可能会出现假的NCP之类的问题,另外cube的网格要更细一些。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。
本周忙

14

帖子

0

威望

84

eV
积分
98

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-29 09:55:31 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2024-10-13 10:49
你应该用pp.x的plot_num=21,价电子密度是赝势算出来赝电子密度,可能会出现假的NCP之类的问题,另外cube ...

您好,如何用plot_num=21的.cube文件做拓扑分析呢?

3621

帖子

3

威望

1万

eV
积分
18425

Level 6 (一方通行)

第一原理惨品小作坊

6#
发表于 Post on 2024-10-29 20:27:06 | 只看该作者 Only view this author
r.wang 发表于 2024-10-29 09:55
您好,如何用plot_num=21的.cube文件做拓扑分析呢?

或许你可以试试AIM-UC.
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。
本周忙

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 06:52 , Processed in 0.160068 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list