实验为主体的组里，转到计算化学方向是否可行？

kevin

楼主，你的情况跟我类似，说说我的感觉吧，
第一个问题：你们组里懂计算的人有多少，懂到什么程度。
我的状态就是，我的导师实验出身，不懂计算，只是可以把握一下文章思路，有一个师姐，但是和我同时起步，平时的交流只能算是讨论，导师利用他的关系找到一个计算出身的老师，但是离着几千公里，只能网络求助，而且也不好意思太频繁。
第二个问题：你所谓的摸到了门槛，是个什么意思，感觉自己能算几个过渡态了？毕竟才一个半月。好在你是要读博士的，钻研的时间还有很多。如果没人能指导细节的东西的话，可能很快你就达到了瓶颈了（个人经验）。
第三个问题：发文章的话，一般来说还是计算+实验，至少其中一个为主，纯理论的话，没有好的idea,档次高的一般不好发。
所以，请楼主慎重考虑。
一家之谈，仅供参考。祝好

wrtgcn

kevin 发表于 2017-3-6 19:47
楼主，你的情况跟我类似，说说我的感觉吧，
第一个问题：你们组里懂计算的人有多少，懂到什么程度。
我的 ...

1.你说的情况跟我太像了。我们组有个师兄懂一点点，最开始学的时候他给我很多帮助，但是他毕竟主要做实验的，计算只停留在操作gview上。老师是实验方面的完全不懂计算，只是感觉现在的文章一般都结合一下理论计算才对这个略有兴趣。其实她也是联系了人教我的，但毕竟离得远，我也不好意思追着问。况且那个组学的也很粗，好多exploring chemistry with electronic那本书上的问题他们都说不清。
2.门槛指大致能顺利使用高斯部分功能吧。看了sob老师的博客，会用自定义机组会用赝势，可以做预测活性位点的图了。（过渡态我照着书学的，还相当不到位）
3.我也是上网看了很多，发现许多人都表示计算相比实验只难而不简单，但发文章的时候往往做实验的容易发，而且发的好。
不知你现在的情况如何，是否顺利？

wrtgcn

小范范1989 发表于 2017-3-6 18:55
问题是，如果你在实验组搞点计算，你们的文章应该还是以实验为主吧。如果这样的话，你做了一点计算，但是实 ...

谢谢。

wrtgcn

冰释之川 发表于 2017-3-6 19:01
个人还是觉得自己动手做点实验，再加上理论计算，会比较容易发高IF的期刊

谢谢老师。

kevin

wrtgcn 发表于 2017-3-6 20:47
1.你说的情况跟我太像了。我们组有个师兄懂一点点，最开始学的时候他给我很多帮助，但是他毕竟主要做实验 ...

不是很顺利，年前两篇文章都悲剧了，一篇都没有送审，这就是我说的瓶颈吧，好好研究了审稿人的意见，也做了很多咨询，还在努力中，也想过出路的问题，但是自己还是想要在这里搞出点名堂（可能不服气吧）。
楼主如果非常有意愿的话，就换方向吧，不过劝楼主不要放弃实验，哪怕是自己不做，也懂实验是怎么回事儿，到时候请同门顺带做个简单的验证，给人个二作就好了。
祝楼主一切顺利！

wrtgcn

kevin 发表于 2017-3-6 21:09
不是很顺利，年前两篇文章都悲剧了，一篇都没有送审，这就是我说的瓶颈吧，好好研究了审稿人的意见，也做 ...

谢谢你了。也祝一切顺利！

bnulk

一万多的机器太不够用了，发文章需要计算数据的时候，磨不出来，很惨很惨的。

wrtgcn

bnulk 发表于 2017-3-6 23:09
一万多的机器太不够用了，发文章需要计算数据的时候，磨不出来，很惨很惨的。

如果想要做计算用，大概要多少预算的配置呢？姑且假设就我一个人用吧。

agent99

想做计算最好懂点理论，而不是只会用高斯算个反应，不然以后出路太窄。在（大部分）实验组里做计算的问题就是大家只看你跑出来的结果和实验是否对的上，对不上就换个方法再试试或者干脆就不用这些计算结果，没人和你探讨理论层面的东西，这样对你的计算研究没啥好处，久而久之你很容易就变成个高斯操作工。

liyuanhe211

wrtgcn 发表于 2017-3-6 23:36
如果想要做计算用，大概要多少预算的配置呢？姑且假设就我一个人用吧。

跟你所在的组做的实验有关。我在有机合成组算些反应，自己一个人用，基本能把价值共8W(政府采购)的三台机器填满，这还是实验和计算一块做的时候，只做计算就会有大量时间在等。

那丢失的

冰释之川 发表于 2017-3-6 19:01
关于实验计算两手抓，你可以多和3楼的liyuanhe211李大博士交流交流，人家现在就是两手抓。关于计算化学入门 ...

实验和理论两手抓这是大势所趋吧，我们做实验的，找人合作做计算，这样文章好发多了。

wrtgcn

liyuanhe211 发表于 2017-3-7 02:24
跟你所在的组做的实验有关。我在有机合成组算些反应，自己一个人用，基本能把价值共8W(政府采购)的三台机 ...

就我一个人用的话找老师买3台这样配置的机器不太可能，除非让她感觉到说我在这方面确实能出来成果。但我现在只是刚接触到了一点皮毛，也不知道自己能到什么程度。另外3台机子也没地方放。我希望是再经过一段时间的学习后，至少能在这方面自己写得出文章来（水一点的也可以），再提出把主机升到2~3W左右的配置。哎，边走边看吧。谢谢李老师了。

wrtgcn

agent99 发表于 2017-3-7 01:36
想做计算最好懂点理论，而不是只会用高斯算个反应，不然以后出路太窄。在（大部分）实验组里做计算的问题就 ...

我还想学vasp，这样周期体系也能算了。不过眼下高斯都还用不透。看了一些计算的文章，个人感觉也没有用到太深的理论，也就是把一些常见的能算的参数计算了一下（键长键角各种能量），把掺杂的原子换个几组，就直接说结论了，当然其意义一般是落在已有实验结果的体系下延展。
不过我看的非常少，所以只能说是一个粗浅的个人感受。

cherubic

个人觉得，如果出发点只是逃避实验的话，并不太推荐留在实验组里转行计算。首先在实验组里做计算，导师很难给予太多理论上的指引，遇到具体问题也很难找到人有效讨论。如果仅仅满足拿高斯当黑箱，即使算出了与实验符合的结果，也往往不知其所以然，对自己的职业发展并不太好；实际上计算中总会遇到各种各样的问题，如果没有人指引，全靠自己琢磨，也很有挫败感，其实并不比折腾实验轻松多少。
如果确定要转计算方向的话，要确定自己是真正喜欢计算，而且要找一个做理论的导师作为co-advisor。

wrtgcn

cherubic 发表于 2017-3-7 23:44
个人觉得，如果出发点只是逃避实验的话，并不太推荐留在实验组里转行计算。首先在实验组里做计算，导师很难 ...

嗯.也在考虑直接换到做计算的组里。