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楼主 Author: yezhonghua
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[Dalton] dalton计算磷光速率问题

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发表于 Post on 2018-3-16 05:52:14 | 只看该作者 Only view this author
Dalton在给出磷光速率(寿命是其倒数)的时候之所以自动除以3,八成可能是考虑到体系不可能同时占三重态的三个子态、同时从三个子态发射,因此把算出来的相当于总k的结果自动除了3。研究磷光的文献里一般也都是把三个子态的k取平均(假定高温极限的情况)
Dalton直接给出的k和Dirac做二分量计算给出的三个子态的平均的k相当,也体现了此结论。
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发表于 Post on 2018-3-16 07:17:49 | 只看该作者 Only view this author
柒月小鱼 发表于 2018-1-18 10:24
我目前想用MOMAP再计算一次辐射速率 目前我还有一些问题没有解决 但是根据Dalton给出的跃迁偶极矩 我大胆 ...

你好,你说的这个:“根据Dalton给出的跃迁偶极矩”
你是通过什么脚本(.dal)计算的呢?基于的结构是T1的吧?
谢谢
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发表于 Post on 2018-11-6 16:12:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 blueyangliu 于 2018-11-6 16:25 编辑
sobereva 发表于 2018-3-16 05:52
Dalton在给出磷光速率(寿命是其倒数)的时候之所以自动除以3,八成可能是考虑到体系不可能同时占三重态的 ...

老师能给个使用ECP核电荷近似的磷光速率计算文件吗?*.dal.Dalton现在支持哪些原子的ECP基组。
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发表于 Post on 2018-11-6 16:31:16 | 只看该作者 Only view this author
可能没啥用。
我是采用如下的方式得到*mol文件。

假定高斯的计算结果文件是XX.log

babel -i g09 XX.log -o xyz XX.xyz   #无论是G16还是g09计算的,都是这个指令。
然后去dalton/tools目录下面,
应该有以下的东西,
aces2dalton  distances  FChk2HES  labread  xyz2dalton
把这几个链接到自己的bin目录, 比如 mkdir ~/bin
ln -s xyz2dalton ~/bin
然后
xyz2dalton < XX.xyz > XX.mol
打开XX.mol天上坐标就可了。
这个时候,不要去管坐标是埃还是au了。

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发表于 Post on 2018-11-6 16:57:50 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2018-11-6 16:31
可能没啥用。
我是采用如下的方式得到*mol文件。

你说这个是转成.mol文件吧。Multiwfn就可以,刚查到。还没试过。选主菜单100功能,再找找
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发表于 Post on 2018-11-7 00:09:11 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2018-11-6 16:31
可能没啥用。
我是采用如下的方式得到*mol文件。

最简单的方法是把.fch/pdb/xyz/mol/wfn/molden等含有结构信息的文件载入Multiwfn,进入主功能100的子功能2,用相应选项转换出Dalton的输入文件,把默认的关键词改一下就能算了
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发表于 Post on 2018-11-7 00:13:06 | 只看该作者 Only view this author
blueyangliu 发表于 2018-11-6 16:12
老师能给个使用ECP核电荷近似的磷光速率计算文件吗?*.dal.Dalton现在支持哪些原子的ECP基组。
TD.dal (138 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 43) bzq2acac.mol (2.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 26) TD_bzq2acac.out (160.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)
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发表于 Post on 2018-11-7 09:36:06 | 只看该作者 Only view this author
blueyangliu 发表于 2018-11-6 16:57
你说这个是转成.mol文件吧。Multiwfn就可以,刚查到。还没试过。选主菜单100功能,再找找

我们的公共服务器, 没有部署
Multiwfn。
当然我晓得, 你说的程序能搞定这个事情。
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发表于 Post on 2018-11-7 09:59:38 | 只看该作者 Only view this author

使用ECP之后,针对金属,能否同时考虑相对论效应?
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abin 发表于 2018-11-7 09:59
使用ECP之后,针对金属,能否同时考虑相对论效应?

你用相对论赝势自然而然就考虑了标量相对论效应
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sobereva 发表于 2018-11-7 23:49
你用相对论赝势自然而然就考虑了标量相对论效应

dalton手册Chapter 17提到,
The Effective Core Potential approach of Pitzer and Winter [125] is available for single- point calculations by asking for ECP as the basis set for the chosen element. So far, only a limited set of elements is covered by the basis set library. .... The corresponding spin-orbit operators are not implemented.

没有搞清楚这里提到的spin-orbit operators, 这个算符和大家需要计算的旋轨耦合矩阵元(SOCME, 比如T1 --> S0的SOCME)有相关性吗?

翻了下手册没有看明白。
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发表于 Post on 2018-11-8 08:10:59 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2018-11-8 07:52
dalton手册Chapter 17提到,
The Effective Core Potential approach of Pitzer and Winter [125] is a ...

先定义了旋轨耦合算符才能计算旋轨耦合矩阵元
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发表于 Post on 2018-11-8 09:51:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-8 08:10
先定义了旋轨耦合算符才能计算旋轨耦合矩阵元

大神,有兴趣写个专题,总结整理一下吗?
对于新手来说,程序的选项越多,功能越多,反而越复杂。
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发表于 Post on 2018-11-9 02:48:59 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2018-11-8 09:51
大神,有兴趣写个专题,总结整理一下吗?
对于新手来说,程序的选项越多,功能越多,反而越复杂。

几个月前就打算专门写一个Dalton算磷光的帖子,后来诸事繁多,一直没时间弄,近期也抽不出时间。不过早晚会写的
Dalton程序开发者开发时就没打算把这程序给新人用,光是输入文件坐标的复杂程度就挺奇葩。其实官方多写一些tutorial,把这程序独特优势让大家可以轻易触及到,程序流行程度得有现在好几倍。
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发表于 Post on 2018-11-9 09:22:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-11-9 02:48
几个月前就打算专门写一个Dalton算磷光的帖子,后来诸事繁多,一直没时间弄,近期也抽不出时间。不过早晚 ...

个人愚见,dalton是给专家使用的。
没有一定的量化基础,几乎看不懂那个程序手册在讲什么东西。
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