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[新手求助] 怎么批量生成高斯输入文件,我需要进行结构优化和频率分析

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楼主
新手在网上搜的很零碎,想问一下大家我现在需要在超算上利用高斯进行结构优化和频率分析,那么我的gjf的输入文件它是应该我自己提前编写再导到超算平台上的。那么我的这个gjf是要怎么编写呢,用记事本编写吗,那有没有可能批量生成不同任务的系列gjf文件呢?
不知道自己有没有表达清楚,希望大佬指点一下,谢谢你们!

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发表于 Post on 2025-9-23 05:01:38 | 只看该作者 Only view this author
自己写个python脚本不就好了

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发表于 Post on 2025-9-23 05:36:51 | 只看该作者 Only view this author
非外行的Gaussian用户基本都是纯手写gjf,用什么文本编辑器随便,只有坐标是用gview创建或从别处获取。(PS:如果Gaussian零基础,十分建议通过北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KEQC)从头系统学学怎么正确使用,免得白走很多弯路。我天天答疑过程中见过太多初学者完全是胡用瞎用,且被乱七八糟信息严重误导)

如果要批量产生gjf文件,参考下文。以类似做法可以把一批诸如xyz/pdb/mol2等格式的结构文件用Multiwfn转成Gaussian输入文件
一键把所有gjf文件转成xyz文件、把所有Gaussian输出文件转成gjf文件的脚本
http://sobereva.com/530http://bbs.keinsci.com/thread-16161-1-1.html

下文的内容可能也和你有关
使用Gaussian时的几个实用脚本和命令
http://sobereva.com/258http://bbs.keinsci.com/thread-190-1-1.html


如果对于shell脚本编写知识基本为零,建议看看下文了解常识
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-23 15:06:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-23 05:36
非外行的Gaussian用户基本都是纯手写gjf,用什么文本编辑器随便,只有坐标是用gview创建或从别处获取。(PS ...

谢谢sob老师的回答 会考虑考虑要不要参加培训班的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-23 15:07:34 | 只看该作者 Only view this author
Huschein 发表于 2025-9-23 05:01
自己写个python脚本不就好了

这个脚本有范例吗,因为真的不太懂,资源也不全,所以可能问的有点蠢

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