计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 427|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 过渡金属铜配合物结构优化泛函用B3LYP还是PBE0?

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

45

eV
积分
49

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
#
两种体系均为含一个铜的配合物(A和B),开壳层,70~80个原子,主要想看铜的mulliken电荷值。
此前在dmol3里进行过结构优化,用了PBE泛函,DNP基组,ECP赝势处理,Grimme DFT-D色散校正,计算出来A的铜电荷值小于B。
后来装了gaussian,尝试如下:B3LYP泛函,Cu用lanl2dz基组,其他主族原子碳之类的都是6-31g(d)基组,加了Grimme DFT-D3(BJ)色散校正,结构优化完之后发现A的铜电荷值和B差不多。然后我用b3lyp泛函下优化出的结构换成PBE0泛函单独算了一次单点能,发现A和B铜的电荷值还是差不多。
请问如果在gaussian里用PBE0泛函重新优化该结构并计算铜mulliken电荷值是否合适?且dmol3的结果是否靠谱呢?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2025-12-8 17:58:03 | 只看该作者 Only view this author
beeeest 发表于 2025-12-8 16:51
sob老师,我在gaussian中用PBE0泛函、Cu用SDD基组、配体原子用6-31g*基组优化结构后,用gaussian算了铜mu ...

不能,你预期的趋势很可能根本不对。而且本来拟合静电势电荷就很不适合算配合物里的中心金属的原子电荷,原子被包埋得很深,拟合的数值不稳定性通常很大
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4

帖子

0

威望

45

eV
积分
49

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-8 16:51:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-4 11:53
正经量子化学内行几乎没人用Dmol3
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/5 ...

sob老师,我在gaussian中用PBE0泛函、Cu用SDD基组、配体原子用6-31g*基组优化结构后,用gaussian算了铜mulliken电荷、hirshfeld电荷、CM5电荷,用multiwfn算了铜ADCH电荷、MK(ESP)电荷、hirshfeld电荷,但只有MK(ESP)电荷符合原本预期的趋势,请问可以用这个电荷作为结果吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2025-12-4 14:45:49 | 只看该作者 Only view this author
beeeest 发表于 2025-12-4 13:53
sob老师,那能否我在结构优化时Cu用SDD配体用6-31g*,计算单点能的时候再把配体原子基组换成6-311g*?

凑合
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4

帖子

0

威望

45

eV
积分
49

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-4 13:53:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-4 11:53
正经量子化学内行几乎没人用Dmol3
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/5 ...

sob老师,那能否我在结构优化时Cu用SDD配体用6-31g*,计算单点能的时候再把配体原子基组换成6-311g*?

4

帖子

0

威望

45

eV
积分
49

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-4 13:25:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-4 11:53
正经量子化学内行几乎没人用Dmol3
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/5 ...

好的感谢sob老师!

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
124668

管理员

公社社长

楼主
发表于 Post on 2025-12-4 11:53:08 | 只看该作者 Only view this author
正经量子化学内行几乎没人用Dmol3
为什么我非常不建议购买和使用D摩3量子化学程序
http://sobereva.com/508

PBE0优化,如果分子内弱相互作用显著且体系是柔性,再加DFT-D3(BJ)。Cu用SDD(甭用过时的lanl2DZ),配体用6-311G*。参考
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html

另外,Mulliken电荷的基组敏感性很强,在意它的大小本身就是没意义的事,看下文了解原子电荷的相关知识
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!
http://sobereva.com/714http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html
用主流的如ADCH电荷(Multiwfn可计算,见手册4.7.2节)、NPA等电荷更有意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-23 23:51 , Processed in 0.253933 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list