MAPLE: 机器学习力场计算化学平台

ljc050512

Huschein 发表于 2026-2-3 09:49
目前正在考虑支持MACE-MPA 可能会在后面几个月内加入

嗯嗯，也期待UMA尽早拿到权限

Huschein

ljc050512 发表于 2026-2-3 14:16
是的老师NEB部分没问题，可能是后续优化TS的部分有点问题。
此外，我在scan文件夹里，输入 python 2d.py ...

plot是后处理的事情哈 MAPLE暂时不会考虑后处理的事情 如果后面MAPLE发展的还不错的话我们会考虑做一个MAPLEtoolkit来专门处理MAPLE的输出文件 这个脚本只是我当时用起来方便随便写的哈 如果你有需求可以自己去改一下

ljc050512

Huschein 发表于 2026-2-4 02:27
plot是后处理的事情哈 MAPLE暂时不会考虑后处理的事情 如果后面MAPLE发展的还不错的话我们会考虑做一个MA ...

好的，谢谢老师！

ljc050512

老师您好，下载了您更新的MAPLE-v.0.1.1，安装的时候还是显示安装的是0.1.0。
此外，尝试跑example\ts\neb的inp1.inp，会出现老版本的报错：
ImportError: cannot import name 'RFO' from 'maple.function.dispatcher.ts.algorithm.PRFO'
麻烦您指点一下

Huschein

ljc050512 发表于 2026-2-8 08:24
老师您好，下载了您更新的MAPLE-v.0.1.1，安装的时候还是显示安装的是0.1.0。
此外，尝试跑example\ts\neb ...

这个bug我记得我已经修了 不知道为什么还是没变 你只需要refine=tsneb改成refine=cineb就可以 tsneb就是在cineb之后对hei再做一次ts搜索

ljc050512

按照老师您的指导，在inp文件里进行了相应的修改，#ts(method=neb,refine=cineb)，得到的out文件在附件里，里面大概的内容是：先进行了NEB，然后进行了CINEB refinement，给出INFORMATION ABOUT SADDLE POINT，结束。貌似没出现对hei再做一次ts搜索。麻烦老师帮我看看

Huschein

ljc050512 发表于 2026-2-8 20:38
按照老师您的指导，在inp文件里进行了相应的修改，#ts(method=neb,refine=cineb)，得到的out文件在附件里， ...

没啥问题 不是挺好的吗

ljc050512

老师，MAPLE给出的例子中的neb里面的inp1输出文件的结构是在CINEB refinement，给出INFORMATION ABOUT SADDLE POINT之后，并没有结束。而是还进行了“Transition State Search (TS) with RS-PRFO”的过程。

yxdd98

1、您好，我想使用uma模型，运行后会提示ImportError: fairchem-core is not installed. Please install it first. 但我其实已经通过pip安装了fairchem-core，pip list里也有，因此想问下可能的原因与解决办法。
【已解决】是缺少pkg_resources模块，通过以下命令解决python -m pip install --force-reinstall "setuptools==80.9.0"

2、汇报一个小问题，我用的是python3.12，运行ts/prfo下的文件会报错No module named 'lib2to3'，发现是3.12版本已经移除该模块，重装为3.11解决，因此安装指南里>=3.9的说法可能有点小问题。

3、还想问一下，如果我手里已经有了uma的pt文件，是也放到model文件夹下就可以了吗？我试了一下，发现还是会向网站请求uma使用许可，然后就任务失败。

Huschein

yxdd98 发表于 2026-2-9 12:55
1、您好，我想使用uma模型，运行后会提示ImportError: fairchem-core is not installed. Please install it ...

1. 感谢提供解决方案
2. 好的 我来配一下3.12环境 然后修改一下指南
3. uma是不可以的 目前uma用的是fairchem的calculator 所以就回带有检测功能 最好的办法就是自己写一个calculator 但是fairchem的写的太深了 所以我没有专门再写一个

Huschein

ljc050512 发表于 2026-2-9 07:48
老师，MAPLE给出的例子中的neb里面的inp1输出文件的结构是在CINEB refinement，给出INFORMATION ABOUT SADD ...

这部分衔接可能没有做好 我再去改一次bug 如果你想这么做的话 直接cineb之后把ci结构拿出来单独做prfo是一样的效果

yxdd98

Huschein 发表于 2026-2-10 00:55
1. 感谢提供解决方案
2. 好的 我来配一下3.12环境 然后修改一下指南
3. uma是不可以的 目前uma用的是fa ...

感谢您的回复，还想请教下MAPLE有关于各项命令的help文档嘛，虽然我基于example能运行一些计算，但比如我想设置其他溶剂甚至是混合溶剂（隐式或者显式），就不太清楚目前MAPLE支持哪些了（虽然之前在其他帖子您提到应该是支持了挺多溶剂的）

Huschein

yxdd98 发表于 2026-2-10 01:35
感谢您的回复，还想请教下MAPLE有关于各项命令的help文档嘛，虽然我基于example能运行一些计算，但比如我 ...

https://www.maplechem.org/ 这是教程官网 但是最近又是春节 人力有限 我们还没有把所有东西都更新上来
目前你可以根据example里面的设置来暂时试用一下 我们预计三月份结束前能把全部的网页做好

隐式溶剂我不建议用 这些不是对model专门参数化的 其次我的GB实现也很潦草 但是MAPLE支持了显式溶剂建模 你可以尝试一下这个模块

Huschein

yxdd98 发表于 2026-2-10 01:35
感谢您的回复，还想请教下MAPLE有关于各项命令的help文档嘛，虽然我基于example能运行一些计算，但比如我 ...

可以参考最新的MAPLE网站 https://www.maplechem.org/index.html

ljc050512

Huschein 发表于 2026-2-10 00:56
这部分衔接可能没有做好 我再去改一次bug 如果你想这么做的话 直接cineb之后把ci结构拿出来单独做prfo是 ...

好的，谢谢老师