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[GROMACS] 二价过渡金属Pt,配体是平面芳香性体系,请问是否有比较合适的力场?

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各位老师好,目前计算的体系是含二价过渡金属Pt,配体是平面芳香性体系,请问是否有比较合适的力场?或者能够直接使用的。

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发表于 Post on 2026-6-1 18:41:00 | 只看该作者 Only view this author
发帖时请选择合适的标题,否则没人知道你问啥也没人愿意回答。都是lv3了
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

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发表于 Post on 2026-6-2 04:40:06 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “gromcas力场选择” 改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2026-6-2 04:42:02 | 只看该作者 Only view this author
sobtop产生拓扑文件,配体GAFF,Pt用UFF,Multiwfn算RESP电荷。参考:
Sobtop主页
http://sobereva.com/soft/Sobtop
使用Sobtop超级方便地创建二茂铁的GROMACS的拓扑文件
http://sobereva.com/635http://bbs.keinsci.com/thread-27803-1-1.html
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
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发表于 Post on 2026-6-2 11:59:33 | 只看该作者 Only view this author
Pt(II)可以参考下面这些文献:
PNAS 2022, 119, e2116543119. DOI: 10.1073/pnas.2116543119
JACS 2025, 147, 24941-24949. DOI: 10.1021/jacs.5c07413
Chem. Sci. 2026, in press. DOI: 10.1039/D6SC00989A

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-6-2 12:09:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-2 04:42
sobtop产生拓扑文件,配体GAFF,Pt用UFF,Multiwfn算RESP电荷。参考:
Sobtop主页
http://sobereva.com/s ...

感谢老师的回答,如果平面Pt体系需要考虑d-d相互作用,uff可能对体系不大合适,不知道是否有更好的方法。

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发表于 Post on 2026-6-2 12:12:43 | 只看该作者 Only view this author
Lmb 发表于 2026-6-2 12:09
感谢老师的回答,如果平面Pt体系需要考虑d-d相互作用,uff可能对体系不大合适,不知道是否有更好的方法。

动力学过程中不需要描述电子结构,仅仅需要拓扑信息和参数能够维持体系配位区域的刚性就够了,我的做法完全能达到此目的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-6-2 12:12
动力学过程中不需要描述电子结构,仅仅需要拓扑信息和参数能够维持体系配位区域的刚性就够了,我的做法完 ...

好的 谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
ziyonchen2 发表于 2026-6-2 11:59
Pt(II)可以参考下面这些文献:
PNAS 2022, 119, e2116543119. DOI: 10.1073/pnas.2116543119
JACS 2025, 1 ...

好的 感谢老师分享

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