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[综合交流] 金属与水和有机物配位以及力场描述的疑问

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各位老师好根据我的理解,GROMACS 使用的力场中,是无法描述金属离子与水分子之间显式的配位键,例如无法描述Li+-4H2O,Co2+-6H2O。它们之间的相互作用是由非键项描述,并且通过配位数的计算能够得到金属离子周围第一水合层内水分子的平均数目,但Li/Co和H2O之间的主要相互作用也就是静电吸引作用,所以是否现有的力场是可以描述金属离子在水溶剂下的表现,出来配位键的成键情况,那么主要描述的是什么表现呢?如果想表现水合离子,例如Li+-4H2O,Co2+-6H2O,是否在初始建模的时候就应该以该结构体现。例如,我如果要模拟金属水合物在有机溶剂中的表现,例如与有机溶剂阴离子的作用情况,是否就应该将Li+-4H2O,Co2+-6H2O与有机相放在一起?

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