Tinker非标准残基力场参数补充问题

frederic · 发表于 Post on 2026-7-7 17:29:21

各位老师、同学们好：

我需要使用openmolcas+tinker联用对BLUF蛋白做QM/MM计算，由于Tinker默认的Amber力场参数中并不包含非标准残基FMN,这部分的力场参数需要我手动补充，但不知道该怎么做。在网上搜索没有任何相关的说明或者分享，Tinker的手册也相当于什么都没有说明。请问是直接改写Tinker的prm文件还是在key文件中补充？如果改写prm文件是否需要添加全新的原子种类？还有什么注意事项吗？

十分感谢大家分享经验！

Huschein · 发表于 Post on 2026-7-9 04:13:25

这里有做法和转换工具

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.4c01463

frederic · 发表于 Post on 2026-7-14 18:08:03

本帖最后由 frederic 于 2026-7-14 18:09 编辑

Huschein 发表于 2026-7-9 04:13
这里有做法和转换工具

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.4c01463

老师您好，我尝试按照github上的说明编译程序，但是却得到这样的结果：

请问您有什么解决方法吗，谢谢

frederic · 发表于 Post on 2026-7-15 14:31:11

frederic 发表于 2026-7-14 18:08
老师您好，我尝试按照github上的说明编译程序，但是却得到这样的结果：

打扰老师了，问题解决了，有关内容我已经简单整理提交到issue了。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[其它程序] Tinker非标准残基力场参数补充问题