计算两个分子之间的氢键能疑问

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计算两个分子之间的氢键能，是两个分子分别优化，然后放到一起优化，用复合物的能量减去两个分别优化的分子的能量，还是直接把两个分子放到一起优化，再把优化好的复合物中两个分子单独抠出来直接计算单点能，用复合物的能量减去这两个分子的能量，用的级别是b3lyp-D3/6-31g（dp），需要做BSSE校正吗

牧生

透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度：一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513（http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html）


使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）

wal

如果你用gaussian的话，可以直接用counterpoise考虑bsse，就能得到结合能。如果你是打算用结合能当作氢键键能的话，就不需要再做别的计算了

sobereva

仔细看
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733（http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html）
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46


注意Gaussian的counterpoise任务直接给出的是相互作用能，不是结合能。仅当变形能非常小的时候近似等价。

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sobereva 发表于 2026-8-22 10:59
仔细看
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733（http://bbs.keinsci.com/thre ...

好的，谢谢老师，已经用基于键临界点的电子密度方法直接算出来了