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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn+VMD绘制片段贡献的跃迁偶极矩矢量

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发表于 Post on 2022-2-11 23:14:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-11 01:23
-用 to 替换,逗号用空格替换

谢谢社长解答!

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发表于 Post on 2022-7-21 12:14:52 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,按照您的帖子流程,
18   //电子激发分析功能
1    //空穴-电子分析
Azobenzene.out   //Gaussian输出文件
1    //选第一激发态
5    //将跃迁偶极矩进行分解
1    //跃迁电偶极矩
当前目录下得到了trdipcontri.txt,将trdipcontri.txt拷到VMD目录下,并将帖子中的loaddip.tcl文件拷入VMD文件夹下,启动VMD,将pdb文件导入,然后在VMD的文本窗口运行source loaddip.tcl命令执行,结果显示couldn't execute "C:\Users\wenjing\Desktop\loaddip.tcl": no such file or directory,可能是我自己的操作问题,但不知是哪里出了问题,麻烦sob老师了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-21 17:59:13 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-7-21 12:14
老师您好,按照您的帖子流程,
18   //电子激发分析功能
1    //空穴-电子分析

VMD启动后文本窗口输入pwd,显示的目录在哪,tcl脚本就放到哪
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-10-6 14:32:00 | 只看该作者 Only view this author
set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]
set endx [expr $cenx+$fragdx/2]
set endy [expr $ceny+$fragdy/2]
set endz [expr $cenz+$fragdz/2]
将$fragdz改为比如2*$fragdz,就可以让箭头长度变为之前两倍。是加减号后面的$fragdz都改为2*$fragdz,才表示键长变为两倍嘛?

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发表于 Post on 2022-10-6 14:32:03 | 只看该作者 Only view this author
set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]
set endx [expr $cenx+$fragdx/2]
set endy [expr $ceny+$fragdy/2]
set endz [expr $cenz+$fragdz/2]
将$fragdz改为比如2*$fragdz,就可以让箭头长度变为之前两倍。是加减号后面的$fragdz都改为2*$fragdz,才表示键长变为两倍嘛?

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发表于 Post on 2022-10-6 19:17:31 | 只看该作者 Only view this author
静静子 发表于 2022-10-6 14:32
set begx [expr $cenx-$fragdx/2]
set begy [expr $ceny-$fragdy/2]
set begz [expr $cenz-$fragdz/2]

把/2删了。

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发表于 Post on 2022-10-13 16:44:47 | 只看该作者 Only view this author

好的,感谢

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