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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖(旧版,已关帖)

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发表于 Post on 2017-11-18 12:06:47 | 只看该作者 Only view this author
老师,
1 请问用什么方法可以在高斯中将两个轨道的电子互换?比如将6sigma和5pi?
2 具有相同对称性的轨道中的电子占据可互换吗?
谢谢

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5087#
发表于 Post on 2017-11-20 15:48:59 | 只看该作者 Only view this author
大家下午好,请问计算荧光时,所用的泛函和方法要与计算紫外吸收用的泛函和方法保持一致么?

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5088#
发表于 Post on 2017-11-20 20:09:01 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师:
您好,我是一名在读的研究生,是计算量子化学的初学者,想请教您一个问题,如果我想研究光催化剂的催化机理,以及通过理论计算评估光催化剂性能,哪些性质是必须计算的!谢谢!

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5089#
发表于 Post on 2017-11-21 12:36:55 | 只看该作者 Only view this author
对于吸附能计算,阅读的很多文章都是采用内能去计算吸附能的,而为什么没有用吉布斯自由能去计算吸附能呢?不是特别理解,还望懂得的老师指点一下,多谢多谢!

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5090#
发表于 Post on 2017-11-21 23:32:44 | 只看该作者 Only view this author
sob老师您好!我想请问下您是否处理过octopus软件得到的电荷密度分布?如何利用编程处理傅立叶变换将octopus的结果时域(t)转化为频域(w)的?学生了解到matlab中fft可以处理时域转频域,但假设计算10000次deltaT,计算1个位置r的时就要将td.XXX文件调用1000次,N个点就是10000*N次,手动处理数据太大了,学生解决不了问题。学生想请教sob老师是怎么解决的,方便的话您能否提供下编辑程序供给学生学习呢?
你生而有翼,为何竟愿一生匍匐前进,形如虫蚁?-——贾拉尔•阿德丁•鲁米

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5091#
发表于 Post on 2017-11-22 16:34:12 | 只看该作者 Only view this author
sob老师你好。
一个分子分解后产生单自由基,此时自旋多重度是2,这时我直接写命令b3lyp/6-31g* 高斯会自动调整成开壳层也就是Ub3lyp去计算是吧。

然后这个单自由基继续分解,变成双自由基,即有两个未成对的电子,此时自旋多重度为1,我如果直接写b3lyp/6-31g*进行优化,这两个未成对的电子会不会成键呢,导致我算的不是一个双自由基结构,而是一个普通的成键结构呢。

如果是这样的话,如何写命令才能使得这个结构保持双自由基的状态,而不是在优化过程中成键。

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发表于 Post on 2017-11-23 08:36:38 | 只看该作者 Only view this author
老师,NBO 6.0 在什么地方可以购买?另外,multiwfn在windows和linux平台下的文件是可以共享的,还是格式有差异,不可以互用?

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5093#
发表于 Post on 2017-11-23 13:02:39 | 只看该作者 Only view this author
各位老师好,我最近在尝试使用Gaussian的BOMD关键词,
个人感觉Gaussian的手册上说的不是很详细。
请问有没有哪里有更加具体的说明或输入文件范例?

目前遇到的主要问题是Simanneal关键词的使用,还请各位老师赐教。

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发表于 Post on 2017-11-23 15:55:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Theor_Comp 于 2017-11-23 15:58 编辑

老师,你好!我想计算与系间窜越有关的S1和T1之间的能隙。采用以下哪种方式更合理?他们分别代表什么?多谢。
(1)# opt b3lyp/6-31g(d,p)
         0  1
         structure 1         # td=(nstates=6,50-50)
        0   1
        structure 1
         之后用E(S1)-E(T1)
(2)# opt b3lyp/6-31g(d,p)
         0  3
         structure 2
         得到T1结构下的总能量T1
  # opt td b3lyp/6-31g(d,p)
         0  1
         structure 3
         得到S1结构下的总能量S1
        之后用S1-T1

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发表于 Post on 2017-11-24 08:35:57 | 只看该作者 Only view this author

过渡态错误

新手小白,在找过渡态期间,出现错误看不懂,需要怎么改正

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 12:04:42 | 只看该作者 Only view this author
wy_sweet 发表于 2017-11-24 08:35
新手小白,在找过渡态期间,出现错误看不懂,需要怎么改正

上传较大文本文件时一定要记得压缩以节约论坛空间
去掉所有IOp,都是完全多余而且添乱的。如果还不行,改用更新的G09修订版或G16
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 13:20:11 | 只看该作者 Only view this author
steven 发表于 2017-11-16 10:23
老师 HF是完完全全考虑了交换相关,还是很大程度地考虑了交换相关?
应该仅是很大程度地考虑了交换相关对 ...

对于HF波函数来说完全考虑了交换相关,但是这个交换相关能和真实波函数的交换相关能是不同的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 13:20:35 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-11-17 23:18
老师,问一个弱弱的问题,请问win版gaussian默认核数和内存是多少?
我的电脑是八个核,我修改了核数报错 ...

Gaussian windows 32bit版最多只能4核并行
默认单核
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-25 13:21:08 | 只看该作者 Only view this author
1188542uu 发表于 2017-11-17 20:46
老师,我在计算吸附的过程中,使用的是B3LYP/6-311G(d,p)的计算水平优化,现在审稿人提出让我使用“disper ...

乱谈DFT-D
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如果是物理吸附,优化和单点都得重算
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李丝丝 发表于 2017-11-16 22:17
老师,在进行sobMECP 时,出现如下所示的错误,试了好几遍都是,我的输入文件在压缩包里,由于知道的少之又 ...

Input_Header_A和Input_Header_B文件必须放到当前目录
而且你机子里没正确安装g09,导致没法调用
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