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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 使用sobMECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点

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发表于 Post on 2018-5-1 21:23:07 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我运行CH2和FeO+的完美进行,但是跑激发态S1和T1的交叉时候总出现
ProgFile Exists - OK
First Input OK
Problem with the ab initio Job.
cat: AddtoReportFile: No such file or directory
Step Number 0 -- MECP not yet converged
,去看ab_initio里看到S1的能量没提取出来,试了g09和g16两个版本都是同样的错误,提取S1能量的代码是这样的
{
        if ($3 == "E(TD-HF/TD-KS)") {
                print $5
        }
}
,对于代码我基本不懂,求解?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-1 21:56:24 | 只看该作者 Only view this author
风影月瞳 发表于 2018-5-1 21:23
sob老师,我运行CH2和FeO+的完美进行,但是跑激发态S1和T1的交叉时候总出现
ProgFile Exists - OK
First  ...

去网上找点资料看看awk命令的语法就懂了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2018-5-2 10:21:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-5-1 21:56
去网上找点资料看看awk命令的语法就懂了

谢谢老师,已经搞定,我的高斯版本里TD能量项的关键词是TD-HF/TD-DFT,改一下就正常了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-2 14:32:29 | 只看该作者 Only view this author
风影月瞳 发表于 2018-5-2 10:21
谢谢老师,已经搞定,我的高斯版本里TD能量项的关键词是TD-HF/TD-DFT,改一下就正常了。

G16净瞎改...
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发表于 Post on 2018-8-17 09:28:07 | 只看该作者 Only view this author
使用了sobMECP,请问文献该如何引用?是不是引用Tian Lu, Feiwu Chen, Multiwfn: A multifunctional wavefunction analyzer, J. Comput. Chem., 33, 580-592 (2012)就可以了,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-17 10:55:12 | 只看该作者 Only view this author
ter20 发表于 2018-8-17 09:28
使用了sobMECP,请问文献该如何引用?是不是引用Tian Lu, Feiwu Chen, Multiwfn: A multifunctional wavefu ...

Tian Lu, sobMECP program, http://sobereva.com/286 (accessed 月 日, 年)

等以后有空,打算彻底重写一遍sobMECP代码,支持更多程序、功能和选项,作为个独立程序发表
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发表于 Post on 2018-8-17 11:06:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-17 10:55
Tian Lu, sobMECP program, http://sobereva.com/286 (accessed 月 日, 年)

等以后有空,打算彻底重写 ...

谢谢Sob!

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发表于 Post on 2018-8-17 12:09:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-3-21 03:16
自旋翻转可以说有两种形式:
(1)两个态势能面相距较远,比如磷光发射,这种情况适用于Fermi golden规 ...

有个问题请教Sob,以卡宾CH2的MECP计算为例,单重态计算时为何不考虑用unrestricted DFT来描述开壳层的单重态双自由基的情况 (singlet diradical)?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-17 21:54:59 | 只看该作者 Only view this author
ter20 发表于 2018-8-17 12:09
有个问题请教Sob,以卡宾CH2的MECP计算为例,单重态计算时为何不考虑用unrestricted DFT来描述开壳层的单 ...

是应该这样考虑,更得当
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本帖最后由 ter20 于 2018-8-19 07:24 编辑
sobereva 发表于 2018-8-17 10:55
Tian Lu, sobMECP program, http://sobereva.com/286 (accessed 月 日, 年)

等以后有空,打算彻底重写 ...

同时引用了MECP,sobMECP和Multiwfn,Sob麻烦看一下是否合适,谢谢 (请忽略具体文献格式)!
The crossing point (CP) was obtained with the minimum energy crossing point (MECP) method [1] as implemented in the sobMECP module [2] in the Multiwfn 3.3.9 program package[3]

[1] Harvey, Theor Chem Acc (1998) 99:95-99
[2] Tian Lu, sobMECP program, http://sobereva.com/286, (accessed on 12 July 2017)
[3] Tian Lu, Feiwu Chen, Multiwfn: A multifunctional wavefunction analyzer, J. Comput. Chem. (2012), 33, 580-592

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-19 11:34:37 | 只看该作者 Only view this author
ter20 发表于 2018-8-19 07:22
同时引用了MECP,sobMECP和Multiwfn,Sob麻烦看一下是否合适,谢谢 (请忽略具体文献格式)!
The crossin ...

sobMECP并不是Multiwfn的组成部分,不需要引(这么引的话怕是有人会说洒家以非正当方式赚引用)

1、2都没问题,说成sobMECP program就行了,不用module这个词
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发表于 Post on 2018-8-19 13:46:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-19 11:34
sobMECP并不是Multiwfn的组成部分,不需要引(这么引的话怕是有人会说洒家以非正当方式赚引用)

1、2 ...

好的,明白了,期待sobMECP早日发表,这样全球用户都可以使用了,非常有用的程序包!

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发表于 Post on 2018-8-29 13:13:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-8-17 21:54
是应该这样考虑,更得当

就之前那个open-shell singlet diradical的问题,我测试了我自己的体系,发现用默认sobMECP程序 (即triplet/closed-shell singlet)得到的singlet态,做波函数稳定性测试,出现了RHF->UHF instability。我手动改了Input_Head_A的关键字为guess(mix,always),得到了另一组结果,比默认程序得到结构的能量低。所以我建议大家在用sobMECP时可以根据自己体系的特征,确定是否需要考虑用开壳层单重态,纯属个人观点,希望Sob指正。

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发表于 Post on 2018-8-30 08:30:14 | 只看该作者 Only view this author
这里的MECI可以用软件求得吗?
http://bbs.keinsci.com/thread-10688-1-1.html

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-30 15:29:50 | 只看该作者 Only view this author
loovfnd 发表于 2018-8-30 08:30
这里的MECI可以用软件求得吗?
http://bbs.keinsci.com/thread-10688-1-1.html

那篇文中是一个特例,直接通过一维势能面扫描就能得到
考虑多维的时候才需要考虑用sobMECP
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