使用sobMECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点

Freeman · 发表于 Post on 2022-1-24 14:51:00

sobereva 发表于 2022-1-20 22:37
不是非得有guess(read)，这只不过是让sobMECP运行像普通的Gaussian优化一样，每一步读取上一步收敛的波函 ...

社长您好。可以正常运行了，以下是运行中遇到的问题。
优化到某个点就开始振荡。这个点的S0/S1 gap已经很小了，我就以它为起点，再开一个优化任务，步长调成0.000500。但是优化完全是朝着反方向进行的。

(base) [yzhangnn@login-0 sobMECP]$ grep State ReportFile
Energy of First State: -913.3140316190
Energy of Second State: -913.3140222100
Energy of First State: -913.3141242030
Energy of Second State: -913.3139641900
Energy of First State: -913.3142225020
Energy of Second State: -913.3138938610
Energy of First State: -913.3142930820
Energy of Second State: -913.3138421970
Energy of First State: -913.3143875760
Energy of Second State: -913.3137692700
Energy of First State: -913.3144722690
Energy of Second State: -913.3137019970
Energy of First State: -913.3144550870
Energy of Second State: -913.3137119090
Energy of First State: -913.3145141190
Energy of Second State: -913.3136749680
Energy of First State: -913.3145143560
Energy of Second State: -913.3136808920
Energy of First State: -913.3145192510
Energy of Second State: -913.3136830340
Energy of First State: -913.3145278840
Energy of Second State: -913.3136832340

复制代码

请问有什么参数可以用来帮助它收敛吗？至少不要让它越优化，gap越大。

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-24 18:33:15

Freeman 发表于 2022-1-24 14:51
社长您好。可以正常运行了，以下是运行中遇到的问题。
优化到某个点就开始振荡。这个点的S0/S1 gap已经 ...

可能是初始Hessian不好所致
可以从更早一些的结构作为起始结构试试

lianghuashou · 发表于 Post on 2022-3-8 19:26:45

sob老师，我刚刚安装测试了sobMECP，我的编译器是ifort，编译之后，用软件自带的例子做测试，用了Pt_coord 和 FeO的例子， prepare.sh 和 runfirst.sh 都可以正常运行，但是运行runMECP.sh的时候，报错信息为@: Expression Syntax. 此外没有其他的报错信息。检查了runMECP的文件，没有编程基础，不知道哪里有语法错误
还请sob老师帮忙看下

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-9 04:52:05

lianghuashou 发表于 2022-3-8 19:26
sob老师，我刚刚安装测试了sobMECP，我的编译器是ifort，编译之后，用软件自带的例子做测试，用了Pt_coord ...

我不知道你怎么运行的
这是csh脚本，当前运行环境必须有csh

好兄弟 · 发表于 Post on 2022-3-25 12:22:48

老师我之前运行sobMECP时都能正常运行，但我没注意sobMECP在后台运行时又运行了一个，导致之后运行时就出现了如下报错，自己尝试解决未果，希望老师能帮我排查下原因，教授我解决方案

Job0_A.log (62.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

Job0_B.log (103.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-25 15:43:23

好兄弟发表于 2022-3-25 12:22
老师我之前运行sobMECP时都能正常运行，但我没注意sobMECP在后台运行时又运行了一个，导致之后运行时就出现 ...

重算

好兄弟 · 发表于 Post on 2022-3-25 15:57:34

sobereva 发表于 2022-3-25 15:43
重算

我重算了依然不行，，，

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-25 16:02:28

好兄弟发表于 2022-3-25 12:22
老师我之前运行sobMECP时都能正常运行，但我没注意sobMECP在后台运行时又运行了一个，导致之后运行时就出现 ...

log文件看不出问题
之前的文件彻底清理干净，先把帖子里的例子跑出来再说

好兄弟 · 发表于 Post on 2022-4-10 10:51:03

老师您好，在输出五个yes得到mecp下结构后，是否还需要通过查看某些数值等方式去验证是否计算的是正确的mecp下的结构？

sobereva · 发表于 Post on 2022-4-11 00:26:31

好兄弟发表于 2022-4-10 10:51
老师您好，在输出五个yes得到mecp下结构后，是否还需要通过查看某些数值等方式去验证是否计算的是正确的mec ...

达到收敛标准，而且肉眼看上去这结构就是你想要的，就够了。

柚子 · 发表于 Post on 2023-4-4 16:51:32

风影月瞳发表于 2018-5-2 10:21
谢谢老师，已经搞定，我的高斯版本里TD能量项的关键词是TD-HF/TD-DFT，改一下就正常了。

请问要改成什么呀？我也遇到了同样的问题。

柚子 · 发表于 Post on 2023-4-4 16:58:28

sui 发表于 2021-3-16 14:46
请问Sob老师，我运行了测试文件没有问题，算自己的文件时提示
ProgFile Exists - OK
First Input OK

遇到了相同问题，请问您是怎么解决的？

柚子 · 发表于 Post on 2023-4-4 17:12:12

好兄弟发表于 2022-3-25 12:22
老师我之前运行sobMECP时都能正常运行，但我没注意sobMECP在后台运行时又运行了一个，导致之后运行时就出现 ...

请问这个问题是怎么解决的呀？

yejlyejl · 发表于 Post on 2023-6-11 22:21:38

sob老师，请教一下：
如果你使用了sobMECP发表了文章，请在文中以这种格式引用：Tian Lu, sobMECP program, http://sobereva.com/286 (accessed month day, year)

这里的accessed month day, year指的是那个时间？是“First release: 2015-Mar-18 Last update: 2022-May-27”中的 2022-May-27？

sobereva · 发表于 Post on 2023-6-12 10:42:16

yejlyejl 发表于 2023-6-11 22:21
sob老师，请教一下：
如果你使用了sobMECP发表了文章，请在文中以这种格式引用：Tian Lu, sobMECP program ...

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[综合交流] 使用sobMECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点