计算晶面上的溶剂可及面积，采用MS软件中的atom volume&surface计算？

caijingtao1993 · 发表于 Post on 2018-1-11 08:49:08

各位大神，我想计算晶面上的溶剂可及面积，但是不知道具体用MS怎么操作？？有人会吗

xylz6188 · 发表于 Post on 2018-1-12 11:30:10

Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >

caijingtao1993 · 发表于 Post on 2018-1-12 12:07:35

xylz6188 发表于 2018-1-12 11:30
Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >

非常感谢，我用了该tools，计算Aacc，也就是溶剂可及表面积，这个采用tools中的atom volume&syrface的connolly surface来计算对吗？关于此则connolly 半径设置为0吗？？还是用solvent task还是both task？？这些参数是怎么设置的？计算晶面面积connolly半径取0？还是直接计算盒子的底面积a*b*sina？那么容积可及面积这些参数怎么取值，求教，大神

xylz6188 · 发表于 Post on 2018-1-12 14:22:03

caijingtao1993 发表于 2018-1-12 12:07
非常感谢，我用了该tools，计算Aacc，也就是溶剂可及表面积，这个采用tools中的atom volume&syrface的con ...

1、是；2、不能为零，至少也得默认值；3、都可以试试，取决于你的研究体系；4、参数最好的办法就是找一个相似的参考体系（有实验数据）一一测试；5、不能取0；这个，你可以试试；6、最好读一下里面的帮助

caijingtao1993 · 发表于 Post on 2018-1-12 18:58:01

xylz6188 发表于 2018-1-12 14:22
1、是；2、不能为零，至少也得默认值；3、都可以试试，取决于你的研究体系；4、参数最好的办法就是找一个 ...

谢谢，幸苦了

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[Crystal] 计算晶面上的溶剂可及面积，采用MS软件中的atom volume&surface计算？

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