计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 1 |主题 Threads: 13423|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 请问为什么我计算出来的组内的Coul-SR是正的,而LJ-SR是负的? UTM 2023-3-16 21825 chemistry93 2023-12-18 10:57
预览 [GROMACS] Gromacs 在编辑mdp文件时关于coulombtype 的问题 张玉飞 2023-12-17 11084 sobereva 2023-12-18 00:59
预览 [NAMD] 使用MolAICal基于NAMD模拟结果计算小分子和蛋白MM/GBSA的教程 MolAICal 2020-8-12 910328 MolAICal 2023-12-17 17:47
预览 [GROMACS] 请问各位老师gromacs中进行升温退火的作用是什么? 邱美佳 2020-11-6 916298 一条君 2023-12-16 17:46
预览 [GROMACS] Gromacs联用Plumed后运行速度巨慢求助 attachment RAL 2023-12-15 31414 RAL 2023-12-16 16:42
预览 [粗粒化/DPD] gromacs粗粒化求助 attach_img 一个小瓜皮 2020-7-19 139291 zdworld 2023-12-16 15:31
预览 [Lammps] 求助:gromacs中itp文件对应到in文件中出错 sj12138 2023-12-14 4971 sj12138 2023-12-16 14:57
预览 [GROMACS] 在作gmx do_dssp命令时老是出现错误提示怎么解决? WWWYYYQQQ 2022-10-18 52943 ys_song 2023-12-16 09:42
预览 [GROMACS] gmx hhond 计算非N/O元素作为氢键受体的氢键数时出错 attach_img yilan 2023-12-15 42419 sobereva 2023-12-15 22:24
预览 [GROMACS] 使用gmx hbond统计氢键数目出现错误 attach_img 二饼妹 2021-11-25 65522 yilan 2023-12-15 21:07
预览 [VMD] VMD里输入指令topo retypedihedral报错求助 attach_img Olive.Lv 2023-12-15 51657 sobereva 2023-12-15 20:28
预览 [GROMACS] 进行添加离子操作时,出现与LJ-14相关的定义的报错 attach_img ngaoo 2023-12-14 41673 ngaoo 2023-12-15 19:08
预览 [综合交流] 关于角度分布函数的理解问题 a-Student 2023-12-15 01002 a-Student 2023-12-15 17:03
预览 [Amber] 求助,跑GaMD时蛋白结构发生变化 attach_img 路过的一只 2020-5-27 17303 Christ 2023-12-15 13:09
预览 [GROMACS] GROMACS均相体系产生相模拟压力变化过大 attach_img wangyueda 2023-12-14 41142 wangyueda 2023-12-15 12:52
预览 [Material Studio] 求助:如何用MS同时导出多帧文件 wanzongliang 2023-12-14 21260 wanzongliang 2023-12-15 11:52
预览 [GROMACS] 运行gmx_mpi grompp -f em.mdp -c complex_SOL.gro -p topol.top -o em.tpr 报错 attach_img z1065480896 2023-12-15 11118 sobereva 2023-12-15 11:49
预览 [分子对接] MGLTools 的 prepare_ligand4.py将小分子批量转为pdbqt格式,转出来特别奇怪... attach_img rina_gamesh 2023-12-14 21624 rina_gamesh 2023-12-15 10:10
预览 [GROMACS] 求助:关于gmx trjorder命令的使用 七堇阳 2023-12-14 0813 七堇阳 2023-12-14 21:55
预览 [分子对接] 使用MolAICal 进行分子对接 attach_img digest agree  ...2 MolAICal 2021-10-17 2012483 MolAICal 2023-12-14 15:58
预览 [GROMACS] 小分子插入构建好的细胞膜后,用sobtop生成相应的小分子itp,最小化的时候报错 attach_img yangyuan 2023-12-1 31252 盐豆子 2023-12-14 15:14
预览 [GROMACS] 求助:能量最小化后小分子中的键发生错配 attach_img 芮啦 2023-12-14 21023 芮啦 2023-12-14 13:44
预览 [综合交流] 请问该如何确定一个分子第一溶剂化层中的溶剂分子数量? UTM 2023-12-11 41438 泰然汪汪汪 2023-12-14 13:34
预览 [NAMD] 求助,模拟结果中出现结构部分缺失 attach_img 啊哈哈哈 2023-12-14 01469 啊哈哈哈 2023-12-14 09:52
预览 [蛋白质建模] 关于peptiderbuilder生成短肽时两端结构问题 attachment bdx 2023-12-8 1965 对抗路达摩 2023-12-13 13:42
预览 [Material Studio] 蛭石晶胞同构置换后,用forcite模块clayff力场分配力场和电荷,不呈电中性 attach_img MatSrookie 2023-6-12 32462 slxc920113 2023-12-12 15:32
预览 [GROMACS] 请问gromacs的rdf命令里-seltype后面各种关键字都表示什么? attach_img UTM 2023-12-12 21311 UTM 2023-12-12 10:54
预览 [程序/脚本开发] 简单神经网络教程 attach_img heatlevel agree sky 2022-10-8 84857 nusiew 2023-12-12 10:37
预览 [GROMACS] 请问可否计算溶质分子周围一定距离内的溶剂分子之间的相互作用? attach_img UTM 2023-12-10 4860 UTM 2023-12-11 10:58
预览 [GROMACS] 求助基于GROMACS和MatLab计算平均滞留时间问题 attach_img ZHTao 2023-12-8 11555 sobereva 2023-12-9 05:43
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 07:29 , Processed in 0.245544 second(s), 18 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块