计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 0|主题 Threads: 13423|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 萘物性模拟时,平衡相模拟正常结束,但产生相模拟出错 attachment yilan 2023-12-1 61210 yilan 2023-12-4 09:04
预览 [Sobtop] sobtop使用mol2文件生成的gro文件超过10000的部分会序列和原子标号之间重合 attach_img tangmengy 2023-12-3 21113 sobereva 2023-12-3 23:51
预览 [GROMACS] 索引组当中的一类原子进行分类时遇到报错 attach_img ngaoo 2023-12-2 2972 ngaoo 2023-12-3 17:10
预览 [GROMACS] mdrun模拟后溶剂的序号变得一样怎么办 attachment Seyilaxa 2023-12-3 42471 Seyilaxa 2023-12-3 13:02
预览 [GROMACS] 求助:如何把.xyz文件转化为.gro文件 attachment 孜宸润泽 2023-12-2 11574 sobereva 2023-12-3 00:22
预览 [GROMACS] 请问只有一个体系的gro文件如何计算体系的密度 姜酱将 2023-12-2 1629 sobereva 2023-12-3 00:21
预览 [GROMACS] 求助无机小分子的charmm力场模拟问题 Riggs-蹊 2023-10-23 91333 Riggs-蹊 2023-12-2 21:25
预览 [粗粒化/DPD] Martni力场官网文件没有要使用的离子或物质参数 attach_img LNN 2023-9-27 61585 LNN 2023-12-2 18:49
预览 [GROMACS] 已解决:Gromacs2020.6编译过程出错 attach_img 含光君 2022-7-5 64409 yixiansheng 2023-12-2 17:28
预览 [GROMACS] pull在使用的时候一定要设置两个group吗 attach_img 姜酱将 2023-12-2 0905 姜酱将 2023-12-2 17:10
预览 [VMD] 在VMD中扩胞后如何保存扩胞后的模型 姜酱将 2023-12-2 22021 姜酱将 2023-12-2 17:01
预览 [GROMACS] gmx跑完蛋白配体复合物的模拟后生成的RMSD值,小分子的Y值波动空间和复合物的不一致 attach_img Ribes 2023-11-29 41339 Ribes 2023-12-2 14:17
预览 [Amber] Amber金属力场中有 元素31Ga的参数吗 Azrael 2023-12-1 2892 Azrael 2023-12-2 12:57
预览 [GROMACS] 求助比较unbound与bound状态下蛋白的各个氨基酸的能量变化 Hailu 2023-12-1 1858 sobereva 2023-12-2 12:27
预览 [综合交流] gmx跑电解质体系的碱金属离子LJ参数选取问题 attach_img wangyueda 2023-11-30 71227 sobereva 2023-12-2 11:03
预览 [GROMACS] gromacs出现Syntax error - File CH4.itp, line 3“错误 attach_img 姜酱将 2023-10-13 32504 sobereva 2023-12-2 11:01
预览 [Sobtop] 求助:sobtop闪退 1009836241 2023-12-2 1957 1009836241 2023-12-2 11:00
预览 [综合交流] 淀粉、蛋白、多酚三者在一定的条件下的分子间相互作用模拟的问题 大王雷 2022-2-26 43473 日月明 2023-12-2 10:54
预览 [GROMACS] 求助:模拟双链短RNA,跑完md后周期性边界条件始终处理不好 attach_img Roosa 2023-9-15 81082 Christ 2023-12-2 05:24
预览 [Lammps] lammps求助 Pair coeff for hybrid has invalid style zbybyby 2023-12-1 01298 zbybyby 2023-12-1 22:38
预览 [蒙特卡罗] 求SGCMC 升温过程中 使用atom/swap 命令交换原子类型,怎么设置温度参数 小咸鱼 2023-12-1 0990 小咸鱼 2023-12-1 15:43
预览 [GROMACS] packmol建模后使用gmx editconf建立盒子并生成gro文件时出错 attach_img zhangfaxue 2023-11-29 41972 zhangfaxue 2023-12-1 15:34
预览 [GROMACS] 关于MPI版gmx因为体系大小的报错问题 lpldtxdy 2023-11-30 31792 lpldtxdy 2023-12-1 14:54
预览 [Lammps] Lammps的in文件中bond_coeff的参数在哪里找 xjw 2021-4-8 49557 事已至此先睡觉 2023-12-1 14:29
预览 [Lammps] 求助,使用lammps输出速度自相关函数,求助计算声子态密度的脚本 LGX 2023-11-30 11617 Lacrimosa 2023-12-1 10:01
预览 [其它程序] How to study an ATPase conformation using molecular dynamics attach_img rpestana94 2021-8-26 65420 rpestana94 2023-12-1 04:00
预览 [Material Studio] msi2lmp导出data文件后只有一种原子类型的问题 liujun 2019-1-23 18428 zbybyby 2023-11-30 21:25
预览 [Lammps] 求助 使用nvt和deform过程中出现错误 attach_img LGX 2022-3-20 54228 Sui1999 2023-11-30 19:48
预览 [Material Studio] material studio如何导入gaff力场 attachment a9471163 2021-9-25 14443 112233zz 2023-11-30 16:58
预览 [GROMACS] 没到现场学习的gromacs小白在安装grace和Amber时好像找不到镜像源 dahai7719 2023-11-29 1912 dahai7719 2023-11-30 15:39
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 04:35 , Processed in 0.203607 second(s), 18 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块