计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (180) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 11 |主题 Threads: 12697|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 求助:Gromacs模拟Zn金属和电解液的界面快照 attach_img xjw 2024-9-12 7834 xjw 2025-5-14 07:34
预览 [综合交流] 求助:有没有可以代替H++网站的其它工具? attach_img 卡卡-14 2025-4-27 4343 卡卡-14 2025-5-14 02:18
预览 [GROMACS] 求助 gromacs 插入分子链长度超过溶剂盒子边界是否会对动力学模拟产生较大影响 attach_img sarphuart 2025-5-13 1172 sobereva 2025-5-14 00:40
预览 [GROMACS] 求助amber14SB和charmm36力场 md.mdp文件问题 attach_img FHFH 2022-12-26 143437 sobereva 2025-5-13 23:36
预览 [GROMACS] 求助,用plumed计算的Metadynamics如何判断自由能是否收敛? lnz 2022-5-19 83151 JCenter 2025-5-13 20:53
预览 [GROMACS] 含二氧化硅的盐溶液冻结模拟与冰拼接后能量最小化不收敛 attach_img CB2024 2025-5-13 3187 CB2024 2025-5-13 17:26
预览 [VMD] 求助 VMD 中 Gromacs MD 轨迹播放分子链穿越盒子边界的跳跃问题怎么解决 attach_img sarphuart 2025-5-12 4605 sarphuart 2025-5-13 17:16
预览 [GROMACS] 关于配体随机分布在盒子里研究其与蛋白质的相关问题 hutaonilu 2025-5-11 7343 hutaonilu 2025-5-13 16:23
预览 [分子对接] AutoDock vina官网的windows版本下载不了,点击下载链接后出现乱码,想知道哪里能下载 waka 2025-4-23 3994 Loading0760 2025-5-13 16:19
预览 [GROMACS] gromacs跑完动力学后用gmxMMPBSA软件进行残基能量分解遇到问题 attach_img lmtt 2025-5-10 3347 student0618 2025-5-13 15:05
预览 [GROMACS] GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法(支持GPU加速) attach_img digest heatlevel agree  ...23456..8 sobereva 2019-1-4 105136344 樊樊樊 2025-5-13 14:50
预览 [Lammps] lammps运行在弛豫过程中报错 Bond atoms 4812 4815 missing on proc 7 at step 1 attachment huangzi 2025-3-24 6700 huangzi 2025-5-13 11:00
预览 [GROMACS] 求助:如何基于VMD FFTK生成的par和psf文件进行后续Gromacs分子动力学模拟 Benyuan 2025-5-13 0237 Benyuan 2025-5-13 10:54
预览 [Amber] 求助蛋白质-配体体系进行长时模拟后,配体周围水分子出现远离配体问题 Muby 2025-5-12 4200 Muby 2025-5-13 10:12
预览 [Amber] 求助MMPBSA计算蛋白质-蛋白质结合能为正值 HDW98 2025-5-11 4316 HDW98 2025-5-13 05:32
预览 [GROMACS] 求助:分子动力学模拟高温晶体容易散架怎么办 Lisy 2025-5-12 1199 sobereva 2025-5-13 01:49
预览 [GROMACS] 求助:对反胶束进行拉伸模拟设置的拉伸的分子个数与实际不一致的问题 attach_img xliu97 2025-5-13 0221 xliu97 2025-5-13 01:39
预览 [GROMACS] 求助使用gmx spatial命令计算了SDF,使用VMD查看时候感觉有点丑 attach_img raku 2025-5-11 11357 raku 2025-5-12 22:00
预览 [GROMACS] 在gromacs中计算乙腈的扩散系数与文献差距较大 attachment ljc2877437407 2025-5-12 1210 sobereva 2025-5-12 20:53
预览 [Lammps] 新手小白求助:lammps模拟不报错却不运行 attach_img 杨星元 2024-12-29 1668 18388361795 2025-5-12 20:42
预览 [Material Studio] 请问用MS中Forcite模块计算缓蚀剂分子在Fe(110)的吸附能出现不收敛,该怎么解决 attach_img 暴躁兔子Zz_ 2023-10-19 31630 暴躁兔子Zz_ 2025-5-12 17:04
预览 [GROMACS] 导出的itp文件没有位置限制,在执行NVT步骤时出现报错 attach_img bling莹莹子 2025-5-11 6308 bling莹莹子 2025-5-12 15:34
预览 [GROMACS] 关于GROMACS模拟过程中,参数不会设定的问题 attach_img phosphorescence 2024-4-23 51447 超音速emooo 2025-5-12 15:30
预览 [GROMACS] 用Gromacs做纯离子液体的VACF,请教一下参照文献参数做出来的曲线为什么不平滑 attach_img zy12 2025-5-11 9240 zy12 2025-5-12 12:07
预览 [GROMACS] 求助:如何对高分子侧基构建索引文件 Lisy 2025-5-11 2249 Lisy 2025-5-12 09:52
预览 [GROMACS] 使用MMGBSA方法计算稳定蛋白质-配体体系自由结合能大于零 attach_img AxiEJohn 2025-5-11 3357 18217265596 2025-5-12 09:16
预览 [GROMACS] Gromacs GPU版本无法正常运行 任佛儿A 2023-12-23 41164 raku 2025-5-11 21:21
预览 [GROMACS] -ntomp核心数怎么选择让模拟速度更快?运行时发现80核预计运行时间比40核多一年左右 Wqyin 2025-5-10 6391 Wqyin 2025-5-11 15:59
预览 [GROMACS] 计算二元水醇溶液体系的相互作用能符号与现实情况相悖该怎么解决 attach_img Pekky 2025-5-9 5455 Pekky 2025-5-11 12:35
预览 [Amber] 安装ambertools18时在make install报错 attach_img 2877321934 2024-5-7 61113 2877321934 2025-5-10 21:49
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-13 15:32 , Processed in 0.224682 second(s), 17 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块