计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 20 |主题 Threads: 13638|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 求助用gromacs计算AMP吸收CO2的RDF分布后半段从1.5逐渐减低到1 attachment yy2525 2025-11-21 2308 yy2525 2025-11-24 12:48
预览 [GROMACS] 求助packmol填充聚合物长链,输出文件盒子尺寸不对+聚合物链不在盒子内部 shiyuanfan 2025-11-22 5491 shiyuanfan 2025-11-24 12:33
预览 [GROMACS] 求助蛋白质和聚合物链的真空模拟,跑了80ns聚合物大部分仍然是直链 YuniJ 2025-11-23 2384 YuniJ 2025-11-24 09:25
预览 [Material Studio] 求助:MS建立AC盒子后,进行几何优化与退火后煤分子密度大幅度降低 attach_img smeli 2025-5-22 81499 yantianhao 2025-11-23 20:37
预览 [Lammps] 气相沉积模拟:升温区域随着沉积厚度增加而增大 wcce 2024-8-22 1889 飞鱼6699 2025-11-23 19:08
预览 [Material Studio] 周期性碳纳米管孔通道建模问题 attach_img Qing-958 2024-7-9 31783 asss 2025-11-23 16:12
预览 [Material Studio] 模拟离子液体电解液EMIMBF4在夹缝孔多孔炭模型中结构优化出现问题 attach_img asss 2025-11-23 0336 asss 2025-11-23 13:52
预览 [GROMACS] 受体蛋白-配体小分子分子动力学模拟基本流程--根据第14届培训内容整理 attach_img digest heatlevel agree  ...2 lijilo 2024-5-21 2214750 hutaonilu 2025-11-23 11:43
预览 [Lammps] 算CO2的粘度时,Greenkubo用刚性模型计算的粘度结果是负的,数值偏差很大 CO2CCC 2025-11-23 0407 CO2CCC 2025-11-23 09:57
预览 [GROMACS] 用MD构建ZnSO4水溶液盒子+锌金属表面锌金属原子参数怎么设定呢? llssong 2021-11-19 55181 xliu97 2025-11-22 05:40
预览 [Material Studio] 求助将碳量子点的层状石墨烯结构固定,让他成为一个整体做分子动力学的方法 attach_img asdjh 2025-11-21 0399 asdjh 2025-11-21 23:38
预览 [Lammps] 求助:怎么将packmol的pdb文件转化成正确的lammpsdata文件 attachment WUIDHAU 2025-11-21 0468 WUIDHAU 2025-11-21 22:45
预览 [GROMACS] 求助,GPU跑了100ns,报错CUDA #700 zhijiu 2024-3-2 61651 HNUST 2025-11-21 22:37
预览 [Lammps] 经验贴:对于使用packmol+lammps的小白可以进来看看,手把手教使用,保姆级。 attach_img agree mengxiangidea 2022-1-16 811012 WUIDHAU 2025-11-21 22:08
预览 [GROMACS] 求助MD退火模拟,温度没有按照设定降低 attach_img zhijiu 2025-11-21 2371 zhijiu 2025-11-21 19:03
预览 [GROMACS] 求助:如何计算模拟盒子中的分子个数 attach_img Sunshine103 2025-11-21 0376 Sunshine103 2025-11-21 15:30
预览 [Lammps] lammps做周期性体系电场模拟参数设置(求助gfile) Wolf123 2025-11-21 1390 Wolf123 2025-11-21 11:11
预览 [Lammps] lammps做电场模拟时所加电场不生效(求助fix efield命令) 事已至此先睡觉 2023-11-8 93447 Wolf123 2025-11-21 10:36
预览 [GROMACS] 求分享使用Gromacs对含有几千个原子的电解液模型跑NPT预平衡及MD产生相的mdp文件 attachment Wxh18130507355 2025-11-20 6422 Wxh18130507355 2025-11-21 10:09
预览 [Amber] 基于Amber的MCPB.py生成含铁离子金属蛋白的力场参数时,在创建Gaussian输入文件时报错 attach_img 停云云 2025-2-10 31227 停云云 2025-11-21 09:32
预览 [GROMACS] 关于Gromacs计算界面聚合问题分相的问题 attach_img jiushizhege 2025-11-15 4314 sobereva 2025-11-21 04:20
预览 [GROMACS] 含氮原子的有机体系在gaff力场下二面角参数问题 attach_img huangzi 2025-11-19 5379 sobereva 2025-11-21 03:47
预览 [GROMACS] 溶液/溶质分子的力场与主top中Include的力场冲突 attachment Wxh18130507355 2025-11-12 5331 sobereva 2025-11-21 03:36
预览 [综合交流] 在AMBER19SB力场中CMAP项的参数含义是什么? attach_img hfc 2023-6-26 81884 喵星大佬 2025-11-21 02:21
预览 [Lammps] 求助在lammps里怎么构建过氧化氢水溶液 WUIDHAU 2025-11-16 7443 WUIDHAU 2025-11-21 00:30
预览 [GROMACS] 求助gromacs计算带金属离子的蛋白,金属离子力场怎么配 attach_img username 2025-5-30 13955 hutaonilu 2025-11-20 23:30
预览 [GROMACS] GMX中伞式拉伸后生成的pullx文件存在的问题 chenmoya 2025-11-20 0313 chenmoya 2025-11-20 22:56
预览 [GROMACS] GROMACS中伞型采样算法应用详解 attach_img heatlevel agree  ...2 Acee 2023-4-13 1721949 NEW12138 2025-11-20 16:52
预览 [GROMACS] 跑NPT系综4710个原子的电解液体系,mdp文件的参数如何确定? attachment Wxh18130507355 2025-9-8 8769 Wxh18130507355 2025-11-20 10:41
预览 [GROMACS] 求助模拟蛋白质和小分子复合物,rmsd计算中的周期性问题 attach_img lxhpdx 2025-11-19 2392 lxhpdx 2025-11-20 10:17
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-5-13 23:16 , Processed in 0.189843 second(s), 19 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块