柔性扫描寻找过渡态问题？

三与三十万 · 发表于 Post on 2021-3-19 09:37:32

请问老师，尝试用柔性扫描的方式寻找过渡态，将优化好的成键的平衡结构进行柔性扫描，结果呈一个上升的曲线，这种是什么原因导致的？谢谢！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-3-19 20:12:57

北大-陶豫发表于 2021-3-19 15:01
给你这几个建议：
（1）为了节约计算量，可以只拿二氢菲核心部分计算，外面那些基团都删掉。算好之后的结 ...

这种体系应该得光照才能关环吧，不然热力学驱动力不足

sobereva · 发表于 Post on 2021-3-19 18:38:38

拿HF/3-21G做计算毫无意义，仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336（http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html）

当前扫描涉及到把键拉断，对于DFT计算必须考虑对称破缺，仔细看里面扫描共价键的例子
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

当前情况有极大概率那个C-C键断裂本身就没有过渡态。

fwz3888 · 发表于 Post on 2021-3-19 16:55:23

如果扫描过程中，显示的几何结构变化与构想的反应方式是一致的，可能说明这个反应没有过渡态。

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2021-3-19 15:01:40

给你这几个建议：
（1）为了节约计算量，可以只拿二氢菲核心部分计算，外面那些基团都删掉。算好之后的结构再加上外面那些基团。甚至只拿一个环己二烯计算也是可以的。
（2）环己二烯的关环是对旋吧，你这个目测像是顺旋？顺旋的话是对称性禁阻的。不懂的话复习一下周环反应和前线轨道理论。

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