碰到一篇稿子，用B3LYP/6–311+G(d)，咋整？

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-9-16 10:13:42

本帖最后由 aaq2800 于 2022-9-17 08:37 编辑

算得B+P小混合团簇，用B3LYP/6–311+G(d)结构优化，有中性的也有负电性的，也没考虑弥散，然后比较了多个异构体的相对能量。用CCSD(T)做单点确认，但却是CCSD(T)/6–311+G(2df)这样的搭配。很多时候看着辛辛苦苦写得那么长一篇稿子，实在不忍心给拒掉

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-10-30 09:08:06

wzkchem5 发表于 2022-10-29 14:22
那就只能找一些证明6–311+G(2df)确实不适合CCSD(T)的benchmark paper了，乃至于自己找一个体系用6–311+ ...

现在疫情严重，居家办公，办公室的服务器关了，没法算啊

牧生 · 发表于 Post on 2022-10-29 16:22:34

如果我遇到这种情况，这次就这样了吧，没有下一次。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-10-29 14:22:00

aaq2800 发表于 2022-10-29 01:29
社长，有比较权威的文献推荐么？我让作者CCSD(T)/may-cc-pVTZ再算一遍，又给作者怼回来了，拒不修改。他 ...

那就只能找一些证明6–311+G(2df)确实不适合CCSD(T)的benchmark paper了，乃至于自己找一个体系用6–311+G(2df)和may-cc-pVTZ算一下，再算一个外推到CBS的结果，证明6–311+G(2df)起码对于这个体系不适用。

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-10-29 08:29:44

sobereva 发表于 2022-9-26 09:56
有极化只是对于几何优化能用的最下限，而单点对基组的要求明显高于几何优化。不同角动量极化函数壳层的数 ...

社长，有比较权威的文献推荐么？我让作者CCSD(T)/may-cc-pVTZ再算一遍，又给作者怼回来了，拒不修改。他的这个体系不大，只有8个原子，文中列出全部的低能异构体用ORCA算的话几个小时就能搞定，他却说要算几个月。作者的回复：
CCSD(T)/6–311+G(2df) is already a large, complex, and reliable calculation. We feel that it is satisfactory for the total energy as used, and for the ranking of structures. Reviewer has not presented any evidence that this is not a satisfactory calculation method. During the planning of these papers, various computational methods were tested. At any given time, one can only achieve a certain level of computational expense and difficulty. The paper involved substantial supercomputer calculations over many months.

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-10-17 07:37:03

wzkchem5 发表于 2022-10-16 16:36
可以说这个级别过时了（不要说这个级别是错的，否则他们会说错的理论级别为什么当年能发出来），让他们用 ...

好的，谢谢大神

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-10-16 16:36:30

aaq2800 发表于 2022-10-16 06:13
修改稿回来了，人家没修改CCSD(T)/6–311+G(2df)，说是为了和以前的工作保持一致。各位大神，咋办呢？帮忙 ...

可以说这个级别过时了（不要说这个级别是错的，否则他们会说错的理论级别为什么当年能发出来），让他们用比如说CCSD(T)/may-cc-pVTZ再算一遍，但是不强求用这个结果替代CCSD(T)/6–311+G(2df)的结果，可以放在SI

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-10-16 13:13:23

修改稿回来了，人家没修改CCSD(T)/6–311+G(2df)，说是为了和以前的工作保持一致。各位大神，咋办呢？帮忙出个主意。

qchem · 发表于 Post on 2022-10-13 15:55:06

CCSD(T)重算一遍结果会有不同吗？

alonewolfyang · 发表于 Post on 2022-10-9 10:15:19

优化团簇结构不带D3矫正吗

aaq2800 · 发表于 Post on 2022-9-27 07:50:55

Qingming 发表于 2022-9-26 09:25
您好，单纯求问第一句，用B3LYP/6–311+G(d)不可以吗？有弥散有极化呀？

几何结构优化是可以，比较单点能量不合适，给了大修

八月的雨季 · 发表于 Post on 2022-9-26 11:10:22

一般这样的我给大修，如果不是结论、作图制表不符合期刊水平直接拒了不太合适，让他们慢慢改吧

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-26 09:56:37

Qingming 发表于 2022-9-26 09:25
您好，单纯求问第一句，用B3LYP/6–311+G(d)不可以吗？有弥散有极化呀？

有极化只是对于几何优化能用的最下限，而单点对基组的要求明显高于几何优化。不同角动量极化函数壳层的数目、极化函数的指数，都直接影响计算精度。

仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336（http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html）

B3LYP算能量如今很难发出去文章，看
坚持使用B3LYP算有机体系能量的人的下场
http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html

Qingming · 发表于 Post on 2022-9-26 09:25:01

您好，单纯求问第一句，用B3LYP/6–311+G(d)不可以吗？有弥散有极化呀？

yflchx · 发表于 Post on 2022-9-16 18:20:15

chands 发表于 2022-9-16 15:04
我自己真的没用CCSD(T)配过Pople基组（正如你说的不合算），CCSD(T)/6–311+G(2df)还好吗，效果如何？看 ...

我读研究生的时候，18年前，CCSD(T)/6-311+G(3df,2p)//B3LYP(或MP2)/6-31+G(d,p)流行度还是比较高的。其中+可以灵活。要考虑到当时的PC机的档次。

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