计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2266|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助高斯优化含金属的小分子的问题

[复制链接 Copy URL]

2

帖子

0

威望

77

eV
积分
79

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,高斯优化含金属的小分子时出现了问题,还请各位老师解惑,感谢!
输入文件如下:

%nproc=20
%chk=ru.chk
#HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) opt


ru

0 2
O                 -3.53750000    0.68600000   -6.99070000
O                 -0.64080000    8.14490000    0.98080000
O                 -6.17870000    0.26150000   -6.35420000
O                  0.74010000    8.30680000    3.35320000
O                 -0.76590000   -2.16690000   -0.32980000
O                 -0.30720000   -0.07320000    1.26710000
C                 -3.29600000    0.21450000   -3.37660000
C                  0.15480000    4.62450000    1.54320000
C                 -0.53440000    0.19370000   -0.52850000
C                 -2.92630000    0.44560000   -4.70150000
C                 -0.34880000    5.78160000    0.94900000
C                 -3.89650000    0.46140000   -5.70360000
C                 -0.15170000    7.02090000    1.55810000
C                 -4.63570000   -0.00090000   -3.05370000
C                  0.85530000    4.70660000    2.74660000
C                 -2.36610000    0.19940000   -2.41610000
C                 -0.03400000    3.43670000    0.95930000
C                 -5.23630000    0.24610000   -5.38070000
C                  0.54880000    7.10290000    2.76150000
C                 -1.08670000   -0.97160000   -0.88160000
C                 -0.22200000    1.12110000    1.10660000
C                 -5.60590000    0.01490000   -4.05580000
C                  1.05220000    5.94590000    3.35580000
C                 -2.01660000   -0.95650000   -1.84210000
C                 -0.03130000    2.32140000    1.69660000
C                 -2.15250000    0.87680000   -7.09520000
C                 -1.30740000    7.84120000   -0.21460000
H                 -0.16920000    0.75800000   -1.39930000
H                 -1.86980000    0.61530000   -4.95620000
H                 -0.90120000    5.71680000    0.00000000
H                 -4.92720000   -0.18320000   -2.00880000
H                  1.25240000    3.79410000    3.21520000
H                 -1.88860000    1.13790000   -2.09810000
H                 -0.19140000    3.37700000   -0.12770000
H                 -6.66240000   -0.15500000   -3.80120000
H                  1.60460000    6.01070000    4.30480000
H                 -2.49410000   -1.89500000   -2.16010000
H                  0.12620000    2.38110000    2.78370000
H                 -7.04170000    0.09400000   -5.93940000
H                  1.24320000    8.16230000    4.17220000
H                 -1.88180000    1.05920000   -8.15930000
H                 -1.85210000    1.75490000   -6.48080000
H                 -1.62430000   -0.03180000   -6.72870000
H                 -1.69960000    8.77810000   -0.66970000
H                 -0.59800000    7.35490000   -0.92100000
H                 -2.15330000    7.14970000   -0.00210000
C                 -4.95330000   -2.29010000    1.47320000
C                 -4.05880000   -3.28360000    1.48560000
C                 -2.75110000   -3.00570000    1.49810000
N                 -2.36170000   -1.80730000    1.49810000
C                 -2.93230000   -1.06200000    0.65760000
C                 -3.87440000   -1.56230000   -0.14850000
C                 -1.71200000   -3.84710000    1.49810000
C                 -1.70000000   -5.16910000    1.29930000
C                 -0.54450000   -5.84070000    1.33930000
C                  0.13070000   -5.25940000    2.31450000
C                  0.31540000   -3.94850000    2.12760000
N                 -0.63280000   -3.23190000    1.70940000
C                 -1.10040000   -1.22000000    5.93780000
C                 -2.02740000   -1.30580000    4.97820000
C                 -1.66030000   -1.52950000    3.71220000
N                 -0.44070000   -1.65950000    3.42350000
C                  0.20460000   -2.43750000    4.17570000
C                 -0.41300000   -3.05190000    5.18990000
C                  0.77930000   -2.35380000   -0.67570000
C                  1.14640000   -2.57750000   -1.94170000
C                  2.44230000   -2.68310000   -2.25330000
C                 -0.69790000   -4.04860000   -1.67680000
C                 -1.20300000   -3.08800000   -0.89590000
N                 -0.44020000   -2.22390000   -0.38700000
Ru                -0.44050000   -1.94170000    1.51830000
H                 -5.84250000   -1.99580000    2.05000000
H                 -4.39870000   -4.32980000    1.48560000
H                 -2.65540000    0.00020000    0.58700000
H                 -4.02090000   -1.58130000   -1.23850000
H                 -2.64070000   -5.70440000    1.10270000
H                 -0.22900000   -6.68300000    0.70610000
H                  0.50490000   -5.80160000    3.19550000
H                  1.29530000   -3.49550000    2.33890000
H                 -0.82760000   -0.51900000    6.74050000
H                 -3.09210000   -1.19240000    5.23030000
H                  1.27620000   -2.61120000    3.99790000
H                 -0.51820000   -4.10040000    5.50540000
H                  0.38220000   -2.67470000   -2.72690000
H                  3.50400000   -2.50500000   -2.47940000
H                 -1.14370000   -4.98980000   -2.03080000
H                 -2.28440000   -3.05220000   -0.69780000

C H O N 0
6-31g*
****
Ru 0
lanl2dz
****

Ru 0
lanl2dz
****

报错如下:
Symbolic Z-matrix:
Charge and multiplicity card seems defective:
Charge is bogus.
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
ru                                                                              












   ?
Error termination via Lnk1e in /home/tim/software/g09/l101.exe at Fri Aug 19 13:00:01 2022.

附件是输入和输出文件。

ru.gjf

5.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

ru.log

5.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

150

帖子

0

威望

3921

eV
积分
4071

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2022-8-19 21:17:15 | 只看该作者 Only view this author
#行和标题行之间的空行多了

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
blueBLUE + 1 谢谢

查看全部评分 View all ratings

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

3#
发表于 Post on 2022-8-19 22:44:58 | 只看该作者 Only view this author
不能用HF,简谈量子化学计算中DFT泛函的选择 http://sobereva.com/272
关键词test多余
用赝势基组要用关键词 genecp
结构不合理,配体是少了氢吗?怎么还有两个原子挨一起了?
电荷数和自旋多重度检查一下。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +2 收起 理由
Reason
blueBLUE + 2 谢谢老师!我构建的结构确实有一点问题,感.

查看全部评分 View all ratings

ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2022-8-19 23:10:16 | 只看该作者 Only view this author
估计又是antechamber产生的(很不像话)的输入文件
关键词一塌糊涂,好好看下文
详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入
http://sobereva.com/60

HF算过渡金属配合物纯粹是搞笑,仔细看简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

到时候Gaussian还会提示缺过渡金属的半径,用Multiwfn算RESP电荷就没这问题。

如果目的是算分子动力学模拟用的原子电荷,仔细看
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果)
http://sobereva.com/476http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html

溶剂下的模拟强烈建议用RESP2(0.5),看
RESP2原子电荷的思想以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/531http://bbs.keinsci.com/thread-16190-1-1.html


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

2

帖子

0

威望

77

eV
积分
79

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-24 17:02:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-8-19 23:10
估计又是antechamber产生的(很不像话)的输入文件
关键词一塌糊涂,好好看下文
详解Gaussian中混合基组 ...

谢谢sob老师!刚学习gauss优化,还是个小白

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 21:46 , Processed in 0.214027 second(s), 30 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list