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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn使用咨询] 简单Multiwfn使用问题和波函数分析问题答疑专贴

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-15 00:41:33 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-1-14 21:39
我在使用Multiwfn做周期性进行吸附界面的两个片段间NAdO分析,已经成功得到结果,但目前的问题是NAdO轨道数 ...

“片段1中贡献了70%的D基函数” 这种描述语义不明。是片段1的D基函数对这个NAdO贡献了70%,还是NAdO里面所有D基函数的贡献中这个片段贡献了70%,或是其它什么。我也看不懂你的最终目的
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发表于 Post on 2026-1-21 01:26:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-15 00:41
“片段1中贡献了70%的D基函数” 这种描述语义不明。是片段1的D基函数对这个NAdO贡献了70%,还是NAdO里面 ...

感谢老师的回复,我的表述确实有点不清楚,这个问题已经自行解决了。

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发表于 Post on 2026-1-21 01:38:09 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,VMD拖入AIM分析产生的path.pdb之后,有方法能在VMD中显示所有的键径序号吗,体系太大在Multiwfn里面看得太卡了,使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示) - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元您的这篇博文说了VMD中显示所有键临界点序号的方法,但好像没有说显示键径序号的方法。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-22 15:31:32 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-1-21 01:38
请问老师,VMD拖入AIM分析产生的path.pdb之后,有方法能在VMD中显示所有的键径序号吗,体系太大在Multiwfn ...

自己在VMD里用查询模式查询你感兴趣的键径的序号 ,下文文末说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html

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发表于 Post on 2026-1-24 01:29:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-22 15:31
自己在VMD里用查询模式查询你感兴趣的键径的序号 ,下文文末说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM ...

好的,感谢老师。

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发表于 Post on 2026-1-24 01:42:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2429783189 于 2026-1-24 02:20 编辑

想请问老师几个关于电荷密度差分析的问题,在我的设置中,蓝色区域代表电子密度耗散,黄色区域代表电子密度聚集
1对于Zn-O键,电荷密度差发现Zn周围一圈蓝色等值面,与Zn配位的所有O周围都是一圈黄色等值面为主,这能否说明作用是静电吸引离子键为主。
2对于O-H.....O(O-H是氢键供体)这一氢键,供体O-H键内部有靠近O的黄色等值面,H上有蓝色等值面,能否说明O-H被极化,H上正电增多呢?上述特征是否是氢键的典型特征呢?
3如果氢键受体O和氢键供体上的H之间还有显著黄色等值面,能否说明氢键有一定共价性呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-24 13:33:33 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-1-24 01:42
想请问老师几个关于电荷密度差分析的问题,在我的设置中,蓝色区域代表电子密度耗散,黄色区域代表电子密度 ...

避免用“电荷”这个词,有歧义,下文第8节说了
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html
我假定你说的是电子密度差

一律贴图说事,并且图中要能反映出分子结构
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发表于 Post on 2026-1-24 16:18:42 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 2429783189 于 2026-1-25 21:11 编辑
sobereva 发表于 2026-1-24 13:33
避免用“电荷”这个词,有歧义,下文第8节说了
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.c ...

抱歉老师,指的确实是电子密度差。下面两张图分别是前面提到的Zn-O键和氢键的电子密度差图。蓝色(深蓝色)指电子耗散,黄色指电子聚集。


202601241618297750..png (91.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202601241618297750..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-25 15:39:58 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-1-24 01:42
想请问老师几个关于电荷密度差分析的问题,在我的设置中,蓝色区域代表电子密度耗散,黄色区域代表电子密度 ...

1 只能说Zn失了不少电子,但是什么键光看这个没法确定。建议按照下文说的用Multiwfn做AIM拓扑分析进一步确认
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html

2 被极化是肯定的。H的原子电荷应该变得更正了。符合

3 多多少少会有,通过ETS-NOCV分析可以明确考察这一点
使用Multiwfn通过ETS-NOCV方法深入分析片段间的轨道相互作用
http://sobereva.com/609http://bbs.keinsci.com/thread-24439-1-1.html
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sobereva 发表于 2026-1-25 15:39
1 只能说Zn失了不少电子,但是什么键光看这个没法确定。建议按照下文说的用Multiwfn做AIM拓扑分析进一步 ...

十分感谢老师百忙之中抽出时间解答,还想额外问一下老师,我已经通过AIM确定问题1中的Zn-O键是离子键特征为主了,那么能否说我的图中Zn-O那种电荷转移特征会增强O-Zn之间的静电吸引相互作用进而与AIM的结论相互印证呢?
另外,在氢键一图的电荷密度差中,氢键受体O和氢键供体上的H之间的黄色等值面,可以理解成是受体O上的孤对电子向H发生了离域造成的吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-25 19:00:24 | 只看该作者 Only view this author
2429783189 发表于 2026-1-25 17:12
十分感谢老师百忙之中抽出时间解答,还想额外问一下老师,我已经通过AIM确定问题1中的Zn-O键是离子键特征 ...

1 可以
2 氧的孤对电子被带正电的氢所极化而产生一定偏移,并且一定程度也来自于轻微的O...H之间的共价作用
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发表于 Post on 2026-1-25 21:11:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-25 19:00
1 可以
2 氧的孤对电子被带正电的氢所极化而产生一定偏移,并且一定程度也来自于轻微的O...H之间的共价 ...

受益匪浅,十分感谢老师的耐心解答。

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发表于 Post on 2026-2-4 23:37:49 | 只看该作者 Only view this author
请问sob老师,Multiwfn绘制二维NICS平面图,可以再通过别的软件进一步绘制更高质量的图片吗

202602042337283646..png (18.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-5 03:24:44 | 只看该作者 Only view this author
chengziyao 发表于 2026-2-4 23:37
请问sob老师,Multiwfn绘制二维NICS平面图,可以再通过别的软件进一步绘制更高质量的图片吗

明明Multiwfn直接就能绘制出来
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发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
请问老师,Multiwfn能绘制激发态的LOL-pi等值面或平面填色图吗?我看有文章讨论了ESIPT过程中的LOL-pi变化,但我搜了一圈论坛,发现激发态芳香性和共轭好像不能用LOL-pi来讨论。

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