关于pKa的计算问题

蛋蛋 · 发表于 Post on 2022-1-4 19:36:04

sobereva 发表于 2018-8-29 18:50
气相自由能用CBS-QB3。用M05-2X是为了结合SMD溶剂模型得到比较好的溶解自由能，这里说了
谈谈隐式溶剂模 ...

老师您好，我看了您的输入文件，气相没有优化频率关键词；溶解自由能只是写了smd，我看到没有加溶剂呀，请问这样算的合理嘛

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-5 00:52:43

蛋蛋发表于 2022-1-4 19:36
老师您好，我看了您的输入文件，气相没有优化频率关键词；溶解自由能只是写了smd，我看到没有加溶剂呀， ...

搞清楚热力学组合方法是怎么回事，CBS-QB3本身自动就做优化和振动分析

把此文一个字一个字仔细看了
使用Multiwfn预测晶体密度、蒸发焓、沸点、溶解自由能等性质
http://sobereva.com/337（http://bbs.keinsci.com/thread-3571-1-1.html）

Qing · 发表于 Post on 2022-4-14 18:58:25

sob老师，我想请问一下，如果我想计算有机物如苯甲酸在正十二烷溶剂中的pKa，计算过程是否和您帖子中甲酸在水中pKa的过程一致，只需把计算过程中所有的溶剂替换成正十二烷就可以了？谢谢老师！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-4-14 19:18:42

Qing 发表于 2022-4-14 11:58
sob老师，我想请问一下，如果我想计算有机物如苯甲酸在正十二烷溶剂中的pKa，计算过程是否和您帖子中甲酸在 ...

这种非极性溶剂里的pKa没有明确定义，因为不存在稳定的溶剂化质子。得先确认你要算的量有明确定义，才能算

Qing · 发表于 Post on 2022-4-14 19:25:26

wzkchem5 发表于 2022-4-14 19:18
这种非极性溶剂里的pKa没有明确定义，因为不存在稳定的溶剂化质子。得先确认你要算的量有明确定义，才能 ...

好的，谢谢老师！

csu-77 · 发表于 Post on 2023-10-18 18:08:22

请教sob老师一个问题，按照综述——“Theoretical Calculations of AcidDissociation Constants: A Review Article”中的公式去计算pKa时（下图1），Gsol(HA)的数值代表的是HA在溶剂下的溶解自由能吧？按照HA的溶解自由能去算的时候，得到的值为29.64，而P204在煤油中的实际pKa通常在3至5之间，本人的计算结果如图2所示，几何优化和振动分析采用的是B3LYP/6-311G*，计算单点能用的是B3LYP/6-311++G**，是因为泛函和基组选择的不当导致的嘛？

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[综合交流] 关于pKa的计算问题