轨道耦合常数计算

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-19 19:24:00

我是新手,想计算轨道耦合常数,求相关文献和帖子.拜谢

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-5-19 20:29:39

http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=571&extra=
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=397&extra=
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=233&extra=
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=229&extra=
dalton和ADF应该都能算，高斯也能算，不过高斯有限制，上面的帖子你可以看一看，这是我当时问的。

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-20 08:37:53

小范范1989 发表于 2015-5-19 20:29
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=571&extra=
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod ...

谢谢!我关注的是电子转移前后的轨道耦合常数,或者是轨道转移积分.我做的是D-A分子, 我认为是D的LUMO和A的LUMO轨道的耦合,这个和旋轨耦合是一个概念么?

小范范1989 · 发表于 Post on 2015-5-20 09:26:33

aristotleemma 发表于 2015-5-20 08:37
谢谢!我关注的是电子转移前后的轨道耦合常数,或者是轨道转移积分.我做的是D-A分子, 我认为是D的LUMO和A的 ...

应该不一样，下面是我的理解，不一定正确，还请指正
你关注的是轨道轨道之间的耦合，就像你说的H-L
我做的分子也是D-A分子，但是我关注的是不同态之间涉及到的自旋轨道耦合。
我感觉不一样。其实我也不是很懂啊，见谅。

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-20 10:04:22

小范范1989 发表于 2015-5-20 09:26
应该不一样，下面是我的理解，不一定正确，还请指正
你关注的是轨道轨道之间的耦合，就像你说的H-L
我 ...

你说的是不同电子态之间涉及的自旋轨道耦合，那么这个自旋轨道耦合的定义是什么呢？

sobereva · 发表于 Post on 2015-5-20 17:01:24

LZ说的轨道耦合常数一般叫做电荷转移积分，用在Marcus理论中可以算分子间电荷转移速率，和旋轨耦合完全是两回事。

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-20 19:50:26

sobereva 发表于 2015-5-20 17:01
LZ说的轨道耦合常数一般叫做电荷转移积分，用在Marcus理论中可以算分子间电荷转移速率，和旋轨耦合完全是两 ...

谢谢sob，我现在确实是想计算Marcus理论，看了一些文献，还是没处下手，电荷转移积分用高斯本身是没法计算的吧？是不是需要自己编程计算

sobereva · 发表于 Post on 2015-5-20 20:24:23

J_from_g03程序可以读取高斯的输出文件来算转移积分。

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-21 10:40:13

sobereva 发表于 2015-5-20 20:24
J_from_g03程序可以读取高斯的输出文件来算转移积分。

谢谢sob, 这个程序哪里有？

sobereva · 发表于 Post on 2015-5-21 19:16:28

aristotleemma 发表于 2015-5-21 10:40
谢谢sob, 这个程序哪里有？

网址是http://code.google.com/p/j-from-g03/，但是google code关了，可以在这里下
http://pan.baidu.com/s/1k70aa

这程序没有清楚的手册，得自己折腾。

aristotleemma · 发表于 Post on 2015-5-22 09:28:03

sobereva 发表于 2015-5-21 19:16
网址是http://code.google.com/p/j-from-g03/，但是google code关了，可以在这里下
http://pan.baidu.co ...

谢谢 sob

janeli1995 · 发表于 Post on 2016-11-10 23:50:07

sobereva 发表于 2015-5-21 19:16
网址是http://code.google.com/p/j-from-g03/，但是google code关了，可以在这里下
http://pan.baidu.co ...

老师您好！我用这个code计算热扰动下分子的转移积分。先做MD然后对每个snapshot用这个程序进行计算，其中gaussian计算用的是zindo。但是发现用HOMO和HOMO-1一半估计，均值和标准差比较接近文献，但是用zindo均值误差比用HOMO和HOMO-1一半估计要大很多，标准差就大的离谱了……请问一下出现这种情况的原因是什么呢？MD没达到稳定吗？

wbn · 发表于 Post on 2016-11-11 04:14:27

janeli1995 发表于 2016-11-10 23:50
老师您好！我用这个code计算热扰动下分子的转移积分。先做MD然后对每个snapshot用这个程序进行计算，其中 ...

分子构型的微小变化本来就可能带来 transfer integral 几个数量级的改变，这是很正常的。你看的是哪篇文献？我没用过g_from_g09 这个code，他是什么算法？“用HOMO和HOMO-1一半估计” 这是什么意思？

wbn · 发表于 Post on 2016-11-11 05:04:45

本帖最后由 wbn 于 2016-11-11 05:25 编辑

janeli1995 发表于 2016-11-10 23:50
老师您好！我用这个code计算热扰动下分子的转移积分。先做MD然后对每个snapshot用这个程序进行计算，其中 ...

OK 我看了程序提到的JACS文章, 里面有说 the transfer integral (Jijeff ≡ t) can be estimated as one-half of ∆E12。非常的interesting。我也算过这个东西，但是我之前没看到过这个程序。我也不是很懂这个算法哎。我以前用的这个方法Generalized Mulliken Hush model, （Chem. Phys. Lett. 1996, 249, 15.）特简单。

janeli1995 · 发表于 Post on 2016-11-11 10:24:33

wbn 发表于 2016-11-11 04:14
分子构型的微小变化本来就可能带来 transfer integral 几个数量级的改变，这是很正常的。你看的是哪篇文 ...

您好，谢谢！
Troisi, A., Orlandi, G., Troisi, A., & Orlandi, G. (2006). Dynamics of the Intermolecular Transfer Integral in Crystalline Organic Semiconductors Dynamics of the Intermolecular Transfer Integral in Crystalline Organic Semiconductors. Phys. Chem, (1), 4065–4070. http://doi.org/10.1021/jp055432g
他用的是直接耦合法算的他的variance就相对比较小……我是想复制他的结果的但是MD后发现波动特别巨大…不知道他是怎么做的？文献中说The 18 evaluations of the intermolecular coupling were the slowest part of the procedure that limited the length of the analyzed dynamics to 100 ps，应该就是做了100ps MD的意思？还有我一直没理解的一句话“The volume (and crystal cell parameters) was kept fixed”是说除了体积之外晶体参数也要固定吗？在tinker里面没有找到相应的关键词……

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[综合交流] 轨道耦合常数计算