VASP5.4.4/内存报错+VASPKIT+CentOS7下装Materials Studio 8.0

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-12 22:52:57

问题是这样的

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-12 23:01:13

枝江向大头发表于 2022-3-12 22:52
问题是这样的

这个问题已经解决了这个是因为之前的时候2019的mpi找不到自己的库，我写了环境变量，改用2015忘记注释掉了

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-12 23:30:58

老师您好现在有个新的问题我所使用的服务器是双CPU的，之前使用MPI2019的时候是如果我输入mpirun -np 32 会将32个进程平均分配给两个CPU，一边十六个进程。MPI2015我这样做的时候会把所有进程按照CPU序号分配，全部分配给了一个CPU，另一个空闲。这样由于内存的原因速度较慢。请问有什么办法可以将进程像之前一样分配给两个CPU呢

wypkdhd · 发表于 Post on 2022-3-13 15:29:24

枝江向大头发表于 2022-3-12 23:30
老师您好现在有个新的问题我所使用的服务器是双CPU的，之前使用MPI2019的时候是如果我输入mpirun -np 32 ...

说实话，你这个问题我从来没注意到过，如果是这样，我估摸只能换2018或者openmpi了，就和超算平台一样。我完全么考虑过这个问题，因为我服务器基本上双路共40个核心，平时都超过一路的提法。

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-13 18:04:01

wypkdhd 发表于 2022-3-13 15:29
说实话，你这个问题我从来没注意到过，如果是这样，我估摸只能换2018或者openmpi了，就和超算平台一样。 ...

2018的IMPI也不会内存溢出是么

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-13 18:05:18

枝江向大头发表于 2022-3-13 18:04
2018的IMPI也不会内存溢出是么

这个新版本的IMPI的内存溢出是bug还是什么机制造成的呢，按理说新版本应该更好用一点

wypkdhd · 发表于 Post on 2022-3-14 09:00:50

枝江向大头发表于 2022-3-13 18:04
2018的IMPI也不会内存溢出是么

超算品台基本上都是2018，就是刘博编译vasp6的那个帖子，我帖子最头处引用了。

wypkdhd · 发表于 Post on 2022-3-14 09:01:53

枝江向大头发表于 2022-3-13 18:05
这个新版本的IMPI的内存溢出是bug还是什么机制造成的呢，按理说新版本应该更好用一点

不知道，我去谷歌搜索过，就是有这个问题，但是好像intel oneAPI没问题。

枝江向大头 · 发表于 Post on 2022-3-16 17:18:31

wypkdhd 发表于 2022-3-14 09:01
不知道，我去谷歌搜索过，就是有这个问题，但是好像intel oneAPI没问题。

oneAPI不好用么我看公社里基本都是用XE2020及以往的版本，我们组里是个AMD的服务器只能用19版本之前的速度才快。

snljty · 发表于 Post on 2022-3-16 17:24:35

snljty 发表于 2022-3-10 17:20
这个我倒是确定没弄错，不管是看$PATH还是which mpicc或者which mpirun之类的结果...顺便您太谦虚了

换了几个别的2015版本的不同子版本的Intel Parallel Studio XE MPI，全都有这个问题无法使用。不清楚是不是和系统有关。系统是大约半个月前的CentOS 8 Stream。

lcyir · 发表于 Post on 2022-4-9 10:47:05

老师您好，我用oneapi成功编译完vasp5.4.4，只能运行简单的单点能计算，体系稍微复杂一点就entering main loop不动了（cpu已调用）。我同学用同样分方法编译可以正常运行，我们不同的地方是cpu，他是intel 我是amd r7 5800h，请问是因为amd不支持mkl库吗

wypkdhd · 发表于 Post on 2022-4-11 10:38:29

lcyir 发表于 2022-4-9 10:47
老师您好，我用oneapi成功编译完vasp5.4.4，只能运行简单的单点能计算，体系稍微复杂一点就entering main ...

AMD编译请通过微信搜索或者论坛内的帖子，编译方法不同于intel。微信搜索肯定有，我前几天还看到来着。关键词就是amd vasp

lcyir · 发表于 Post on 2022-4-13 12:58:23

wypkdhd 发表于 2022-4-11 10:38
AMD编译请通过微信搜索或者论坛内的帖子，编译方法不同于intel。微信搜索肯定有，我前几天还看到来着。关 ...

感谢老师回复~ 已经按照您的建议，根据 http://bbs.keinsci.com/thread-25445-1-1.html 成功编译并运行十分感谢

xiaobaibai · 发表于 Post on 2022-8-17 11:13:45

您好，为什么安装完mpi2015 输入which mpiexec 出来是这样的/opt/intel/compilers_and_libraries_2019.1.144/linux/mpi/intel64/bin/mpiexec

abin · 发表于 Post on 2022-8-17 12:18:27

如果不想自己费功夫，
这里有下载了用的。

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如有需要, 请自行下载.

自由分享, 无需解锁 https://pan.baidu.com/s/18Q1hcop9JvNVEra8NVCULg?pwd=m9jm
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支持Intel和AMD处理器.

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