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楼主 Author: lei234
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[新手求助] 有关过渡态的疑惑

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发表于 Post on 2016-10-9 22:56:23 | 只看该作者 Only view this author
珊珊来迟 发表于 2016-10-9 16:39
恩恩,好的sob老师,我先做IRC看看。
不过sob老师还有一个问题,您说的U(0)是指输出文件中Sum of electr ...

U(0)对应Sum of electronic and zero-point Energies
电子能垒、内能能垒、焓能垒、自由能垒都叫势垒,用哪个取决于拿它讨论什么
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发表于 Post on 2023-12-6 19:21:03 | 只看该作者 Only view this author
请问老师,我找到一个过渡态,虚频-1015,Infrared 4380,过渡态结构走完IRC,IRC两端结构拿出来优化,优化出来的结构单点能确实比过渡态低,但加上热力学校正后焓和自由能反而比过渡态高了。请问可能是什么原因呢?涉及到阴离子,优化用的是b3lyp/6-31g(d),单点能用的是b3lyp/ma-TZVP

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发表于 Post on 2023-12-7 02:41:18 | 只看该作者 Only view this author
Kamistry 发表于 2023-12-6 19:21
请问老师,我找到一个过渡态,虚频-1015,Infrared 4380,过渡态结构走完IRC,IRC两端结构拿出来优化,优化 ...

老生常谈的问题,电子能垒低的时候这极其正常,说明这不是化学意义上的过渡态

B3LYP算能量早过时了
仔细看
坚持使用B3LYP算有机体系能量的人的下场
http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html

简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html

谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

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发表于 Post on 2023-12-7 10:14:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-7 02:41
老生常谈的问题,电子能垒低的时候这极其正常,说明这不是化学意义上的过渡态

B3LYP算能量早过时了

不好意思老师,本来想写所有关键词的,后来改的时候把em=gd3bj删了忘标出来了,优化和单点能用的其实是B3LYP-D3(BJ)。

不是化学意义上的过渡态的意思是这一步实际是无能垒过程吗?在能量折线图上只需直接连接吗?

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发表于 Post on 2023-12-8 05:58:38 | 只看该作者 Only view this author
Kamistry 发表于 2023-12-7 10:14
不好意思老师,本来想写所有关键词的,后来改的时候把em=gd3bj删了忘标出来了,优化和单点能用的其实是B3 ...



能量折线图如果用电子能量,过渡态照常标上;如果用自由能,上一个极小点直接连接下一个极小点
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