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楼主 Author: 暖玉生烟
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[新手求助] 求关于高斯计算具体键的键能的方法

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发表于 Post on 2018-5-13 06:11:22 | 只看该作者 Only view this author
曼竹w 发表于 2018-5-12 14:55
sob老师,您好,十个半年又遇到这个问题
第一,算相互作用能,比如2个水分子和一个材料还有一个重金属原 ...

1 是
2 为什么要设为虚原子?不理解你的意思
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发表于 Post on 2018-5-14 09:16:09 | 只看该作者 Only view this author
设置成虚原子算材料的单点能,直接把优化后的复合物结构的片段截关键词加上freq,发现能量变了

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发表于 Post on 2018-5-14 12:59:22 | 只看该作者 Only view this author
曼竹w 发表于 2018-5-14 09:16
设置成虚原子算材料的单点能,直接把优化后的复合物结构的片段截关键词加上freq,发现能量变了

虚原子(X)不可能影响计算的能量
后半句是病句看不懂

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王二葛 + 2 谢谢

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发表于 Post on 2018-5-14 16:00:46 | 只看该作者 Only view this author
老师,我的意思是把复合物的结构优化后,取出片段的能量,关键词只加freq,没有加opt,该结构的能量发生变化,有点不解

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发表于 Post on 2018-5-14 16:05:54 | 只看该作者 Only view this author
曼竹w 发表于 2018-5-14 16:00
老师,我的意思是把复合物的结构优化后,取出片段的能量,关键词只加freq,没有加opt,该结构的能量发生变化 ...


取出片段结构后,要么只算单点,要么opt+freq,直接算个freq毫无物理意义,因为根本不是在当前状态下的极小点
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发表于 Post on 2018-5-14 16:31:25 | 只看该作者 Only view this author
取出片段的坐标,计算单点能的话,电荷要不要变,之前是电中性,然后我发现取出片段结构计算单点能之后,其中两个碳碳键比复合物结构中的碳碳键键长长

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发表于 Post on 2020-2-25 16:58:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-13 06:24
对于打断环上的O-O时,把结构适当调整使两个O远离,此时当做双自由基来算
谈谈片段组合波函数与自旋极化 ...

sob老师好,环上的键打断容易调整使两原子远离,但笼状分子如何调整呢?咋调感觉都有些别扭

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发表于 Post on 2020-2-25 18:49:52 | 只看该作者 Only view this author
任我行天下 发表于 2020-2-25 16:58
sob老师好,环上的键打断容易调整使两原子远离,但笼状分子如何调整呢?咋调感觉都有些别扭

看你具体想算什么键的键能
如果是C-C键,直接用Multiwfn计算拉普拉斯键级去估计键能是最简单省事的,而且可靠。看下文的键级那部分里拉普拉斯键级的介绍
Multiwfn支持的分析化学键的方法一览
http://sobereva.com/471http://bbs.keinsci.com/thread-12488-1-1.html

对笼状体系的其它类型的键,如果没有更具体的信息,很难说怎么设计计算合适。
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liyuanhe211 发表于 2015-11-12 20:58
直接从这个键中间劈两半,分别opt freq,注意多重态设定。

li老师您好,抱歉打扰了,我用两个片段减去主分子得到键解离能,应该用后面archive段落的HF值,还是用Sum of electronic and zero-point Energies的值?谢谢~

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发表于 Post on 2021-1-30 12:06:02 | 只看该作者 Only view this author
Vincentears 发表于 2021-1-30 10:28
li老师您好,抱歉打扰了,我用两个片段减去主分子得到键解离能,应该用后面archive段落的HF值,还是用Sum ...

用当前实际研究温度下的焓求差。焓怎么算这里说了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
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发表于 Post on 2021-1-30 19:39:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-1-30 12:06
用当前实际研究温度下的焓求差。焓怎么算这里说了
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力 ...

谢谢sob老师~

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发表于 Post on 2023-3-27 19:16:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-12 21:47
比如计算双氧水O-O键能,T是温度
1 对HOOH做opt freq,得到H(T)_HOOH
2 对OH做opt freq,自旋多重度设2, ...

sob,你好,想请问一下,BDE是用焓(Sum of electronic and zero-point Energies)来算的,但是有的用电子能量,这个电子能量指的是HF后边的还是Sum of electronic and zero-point Energies零点能,谢谢。还有什么时候可以不用优化的情况,谢谢。

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发表于 Post on 2023-3-28 04:43:03 | 只看该作者 Only view this author
wzy 发表于 2023-3-27 19:16
sob,你好,想请问一下,BDE是用焓(Sum of electronic and zero-point Energies)来算的,但是有的用电 ...

Sum of electronic and zero-point Energies根本就不是焓,这是0K下的内能或者0K下的焓。看下文介绍的Shermo程序的手册的附录部分了解热力学计算常识
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
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跟实验比必须用实际温度下的焓求差。用电子能量只是个粗略的近似
什么时候都得优化,不优化也根本不可能做振动分析算热力学量


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发表于 Post on 2024-4-14 16:05:10 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-11-13 17:00
画个圈就是形象表述啊(-_-),而且我那里说要用GV了,直接去输入文件把指定原子的坐标捞出来分开就 ...

老师 我看了这个帖子后 觉得您是一个灰常灰常有耐心的人
生如逆旅,一苇以航。

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