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楼主 Author: sobereva
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[CP2K] 使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-21 06:08:01 | 只看该作者 Only view this author
annaqz 发表于 2021-11-20 16:39
社长,Multiwfn 3.8,windows下使用。VASP的POSCAR文件,文件名里有POSCAR,然后拖入Multiwfn,输入cp2k,点 ...
确保用的是官网上最新的Multiwfn。如果确保是最新的,上传POSCAR我看看。

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发表于 Post on 2021-11-22 13:57:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-21 06:08
确保用的是官网上最新的Multiwfn。如果确保是最新的,上传POSCAR我看看。

好的,我再确认一下,谢谢社长!

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发表于 Post on 2021-12-8 10:02:01 | 只看该作者 Only view this author
annaqz 发表于 2021-11-20 16:39
社长,Multiwfn 3.8,windows下使用。VASP的POSCAR文件,文件名里有POSCAR,然后拖入Multiwfn,输入cp2k,点 ...

看看说明呀,怎么用,Multiwfn写的很清楚了http://sobereva.com/587

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发表于 Post on 2021-12-8 10:52:08 | 只看该作者 Only view this author
nianbin 发表于 2021-12-8 10:02
看看说明呀,怎么用,Multiwfn写的很清楚了http://sobereva.com/587

嗯,我研究了。感谢回复。

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发表于 Post on 2021-12-16 11:10:49 | 只看该作者 Only view this author
社长,能给Multiwfn增加个功能实现Gromacs输入文件的自动制作吗,这样会非常方便

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-16 14:44:32 | 只看该作者 Only view this author
lilf 发表于 2021-12-16 11:10
社长,能给Multiwfn增加个功能实现Gromacs输入文件的自动制作吗,这样会非常方便

这没必要,本来mdp也不难写,而且在模板文件基础上修改也很简单(诸如北京科音分子动力学与GROMACS培训班http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html里对常见几类问题都给了mdp,通常实际计算时候改几行即可)
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发表于 Post on 2021-12-16 19:59:34 | 只看该作者 Only view this author
社长,请教一下,要是想对基底的下层原子进行固定,在Multiwfn创建输入文件时应该怎么操作呢?

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发表于 Post on 2021-12-17 08:55:54 | 只看该作者 Only view this author
annaqz 发表于 2021-12-16 19:59
社长,请教一下,要是想对基底的下层原子进行固定,在Multiwfn创建输入文件时应该怎么操作呢?

进行opt任务的时候选项9就是设置原子坐标固定啊
自由发挥,野蛮生长

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发表于 Post on 2021-12-17 11:39:38 | 只看该作者 Only view this author
丁越 发表于 2021-12-17 08:55
进行opt任务的时候选项9就是设置原子坐标固定啊

哦哦。好的,明白了。我去研究一下,非常感谢!!!

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发表于 Post on 2022-1-5 09:52:12 | 只看该作者 Only view this author
<用GFN1-xTB方法跑含有216个水的盒子的动力学>
请问老师,为什么跑出来的xyz轨迹文件在VMD中不显示盒子和周期性呢,pbc box 和 periodic都无效,谢谢老师
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-5 10:02:56 | 只看该作者 Only view this author
一条君 发表于 2022-1-5 09:52
请问老师,为什么跑出来的xyz轨迹文件在VMD中不显示盒子和周期性呢,pbc box 和 periodic都无效,谢谢老 ...

xyz里本来就不含盒子信息,看此文了解格式定义
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobereva.com/477
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发表于 Post on 2022-1-5 13:34:11 | 只看该作者 Only view this author
一条君 发表于 2022-1-5 09:52
请问老师,为什么跑出来的xyz轨迹文件在VMD中不显示盒子和周期性呢,pbc box 和 periodic都无效,谢谢老 ...

试试:
pbc set {a b c} -all
pbc box
pbc wrap -all

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-1 03:23:03 | 只看该作者 Only view this author
本文介绍的Multiwfn产生CP2K输入文件的功能已经支持了TDDFT算激发态,见《使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态》(http://sobereva.com/634
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发表于 Post on 2022-3-6 22:25:56 | 只看该作者 Only view this author
老师,Multiwfn创建CP2K输入文件中,Run type没有Band这个选项么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-6 23:40:29 | 只看该作者 Only view this author
liudong123 发表于 2022-3-6 22:25
老师,Multiwfn创建CP2K输入文件中,Run type没有Band这个选项么?

目前没有,以后可能加入。支持的任务类型以后会越来越多。
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