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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 比SMD算溶解自由能更好的溶剂模型uESE的使用

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发表于 Post on 2022-12-12 01:55:57 | 只看该作者 Only view this author
对于cp2k,是不是也可以用B3LYP/def2-TZVP优化以后产生molden文件,再用Multiwfn算CM5后产生uESE的输入文件
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-14 18:14:27 | 只看该作者 Only view this author
linqiaosong 发表于 2022-12-12 01:55
对于cp2k,是不是也可以用B3LYP/def2-TZVP优化以后产生molden文件,再用Multiwfn算CM5后产生uESE的输入文件

可以是可以
不过uESE只针对分子体系,用CP2K计算效率很低
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-12-30 17:22:32 | 只看该作者 Only view this author
请问一下直接用uESE计算Cl-的溶解自由能,但是输出文件没报错也没计算,是什么原因?

202212301721431213..png (126.48 KB, 下载次数 Times of downloads: 25)

202212301721431213..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-31 00:48:25 | 只看该作者 Only view this author
BUCTtyl 发表于 2022-12-30 17:22
请问一下直接用uESE计算Cl-的溶解自由能,但是输出文件没报错也没计算,是什么原因?

具体问开发者
我只能说算这个没意义,单原子离子的溶解自由能不依靠显式溶剂模型肯定算不准
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-9-26 18:07:10 | 只看该作者 Only view this author
现在文中提到的下载链接、以及原作者在其发表文章中提到的.es结尾的链接都打不开了,是否有人可以分享一份?与此同时我也在向原作者询问,如有结果也将分享给大家。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 04:05:53 | 只看该作者 Only view this author
Accelerator 发表于 2023-9-26 18:07
现在文中提到的下载链接、以及原作者在其发表文章中提到的.es结尾的链接都打不开了,是否有人可以分享一份 ...

http://sobereva.com/attach/593/uESE,xESE.zip
这是我写帖子时候的程序版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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