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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格

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发表于 Post on 2020-6-4 00:55:47 | 只看该作者 Only view this author
The leaping arc at your finger
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发表于 Post on 2020-8-29 11:11:10 | 只看该作者 Only view this author
老师我可以问下液相反应速率常数单位(s-1·m-1),m是什么,怎么得来的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-30 13:59:43 | 只看该作者 Only view this author
zhuahui 发表于 2020-8-29 11:11
老师我可以问下液相反应速率常数单位(s-1·m-1),m是什么,怎么得来的

那是M,即mol/L。不要写成小写,会跟米混淆
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2020-9-5 17:10:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-30 13:59
那是M,即mol/L。不要写成小写,会跟米混淆

谢谢老师

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发表于 Post on 2021-4-14 09:33:31 | 只看该作者 Only view this author
Sob老师,请教一下液相速率表格里,速率单位为什么是(s-1·m-1),按照表格里的计算公式,kBT/h,按理说单位应该是s-1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 12:47:00 | 只看该作者 Only view this author
科研界的小学生 发表于 2021-4-14 09:33
Sob老师,请教一下液相速率表格里,速率单位为什么是(s-1·m-1),按照表格里的计算公式,kBT/h,按理说单 ...

单位取决于单分子还是双分子,跟是不是液相没关系
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发表于 Post on 2021-4-14 14:21:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-4-14 12:47
单位取决于单分子还是双分子,跟是不是液相没关系

谢谢sob老师,单分子应该是s-1,但是双分子的时候单位为什么要选mol/L而不是mol/cm3或者其他摩尔体积单位呢,就是这块有点疑惑

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-14 15:27:32 | 只看该作者 Only view this author
科研界的小学生 发表于 2021-4-14 14:21
谢谢sob老师,单分子应该是s-1,但是双分子的时候单位为什么要选mol/L而不是mol/cm3或者其他摩尔体积单位 ...

标准态浓度是1 M
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发表于 Post on 2021-4-14 16:30:37 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2021-4-14 16:44:11 | 只看该作者 Only view this author

Sob老师,再请教一下,这个公式对于表面反应是不是也一样适用?

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发表于 Post on 2021-5-24 20:18:56 | 只看该作者 Only view this author
文中提到“如果计算自由能的时候已经考虑了转动对称性则kTST公式中就不需要考虑σ了”。请问sob老师,是否有相应的文献提到过这样类似的结论。谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-24 20:30:13 | 只看该作者 Only view this author
Norman 发表于 2021-5-24 20:18
文中提到“如果计算自由能的时候已经考虑了转动对称性则kTST公式中就不需要考虑σ了”。请问sob老师,是否 ...

根本就不需要什么文献,这是最基本的逻辑
难道还能允许double-counting的事发生?
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发表于 Post on 2021-5-27 14:15:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-24 20:30
根本就不需要什么文献,这是最基本的逻辑
难道还能允许double-counting的事发生?

嗯,谢谢sob老师。
我在使用完整的Skodje-Truhlar方法计算透射系数时发现 正向势垒<0。。计算级别是B3LYP-D3BJ/6-311++g**,SMD。反应是放热反应,自由能垒为40KJ/mol。这意味着这个反应不适合用TST理论计算?正向势垒的计算是 [TS的U(0)] - ∑[反应物的U(0)]吧?

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发表于 Post on 2021-5-27 20:04:45 | 只看该作者 Only view this author
Norman 发表于 2021-5-27 07:15
嗯,谢谢sob老师。
我在使用完整的Skodje-Truhlar方法计算透射系数时发现 正向势垒

对,势垒<0的话过渡态理论就不适用了。当然前提是你确实算对了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-5-28 18:07:23 | 只看该作者 Only view this author

U(0)类似这种趋势。G(T)的变化时是TS>反应物、TS>产物。我计算反应速率常数只是看它们数量级上的差别,TST也无法应用吗?

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