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[新手求助] 求助优化氢键体系理论方法选择

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老师好,如优化氢键体系复合物,可否选用b3lyp-d3bj/aug-cc-pvtz理论水平进行结构优化与频率计算,然后用mp2/aug-cc-pvtz理论水平计算能量呢?

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发表于 Post on 2022-5-19 21:04:25 | 只看该作者 Only view this author
如果是有机电中性体系,B3LYP-D3(BJ)/6-31G**优化,RI-PWPB95-D3(BJ)/def2-TZVPP级别计算单点即可。如果体系较小,可以B3LYP-D3(BJ)/6-311G**优化,RI-PWPB95-D3(BJ)/def2-QZVPP计算单点能。看卢老师博文
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
谈谈量子化学中基组的选择
谈谈弥散函数和“月份”基组
各种后HF方法精度简单横测
详谈Multiwfn产生ORCA量子化学程序的输入文件的功能
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍

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发表于 Post on 2022-5-19 22:13:36 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP-D3(BJ)/6-311G**优化就足够
再好点基组换成def2-TZVPP,再高就绝对没任何意义了
用MP2不如用revDSD-PBEP86-D3(BJ),耗时高不了多少,整体精度更好
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-20 16:01:28 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-5-19 21:04
如果是有机电中性体系,B3LYP-D3(BJ)/6-31G**优化,RI-PWPB95-D3(BJ)/def2-TZVPP级别计算单点即可。如果体 ...

好的我仔细阅读一下,谢谢您

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-20 16:05:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-19 22:13
B3LYP-D3(BJ)/6-311G**优化就足够
再好点基组换成def2-TZVPP,再高就绝对没任何意义了
用MP2不如用revDSD ...

先谢谢老师给予建议,当时想着是后hf需要用好一点的基组,为保持基组一致,已经用aug-cc-pvtz基组优化完毕,下面能量计算准备看一下老师的建议

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-20 16:11:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-19 22:13
B3LYP-D3(BJ)/6-311G**优化就足够
再好点基组换成def2-TZVPP,再高就绝对没任何意义了
用MP2不如用revDSD ...

老师还有一个问题,我的体系是中性有机体系,原子总数在20个左右,我在阅读文献过程发现有些文献采用了mp2方法去优化结构作为对比,但是现在我时间上紧迫一点,可以不在用mp2方法去优化结构作为对比了吗?在写文章时说明b3lyp-d3bj方法优化弱相互作用的结构是可靠的,并附上相关文献可以吗?

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发表于 Post on 2022-5-20 16:13:14 | 只看该作者 Only view this author
MP2,No
DFT-D3,Yes

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发表于 Post on 2022-5-20 16:18:19 | 只看该作者 Only view this author
luckylife 发表于 2022-5-20 16:05
先谢谢老师给予建议,当时想着是后hf需要用好一点的基组,为保持基组一致,已经用aug-cc-pvtz基组优化完 ...

MP2优化的结构比不上B3LYP-D3(BJ)的,但是耗时反倒增加了很多。后HF需要更大的基组也主要只跟基组zeta数和极化函数的角动量有关,和弥散函数没啥关系。算单点能比优化级别低原理上是不合理的,不管是方法还是基组。

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发表于 Post on 2022-5-21 04:10:52 | 只看该作者 Only view this author
luckylife 发表于 2022-5-20 16:11
老师还有一个问题,我的体系是中性有机体系,原子总数在20个左右,我在阅读文献过程发现有些文献采用了mp ...

用MP2是傻子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-21 19:08:12 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师的解答

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-21 19:09:14 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-5-20 16:18
MP2优化的结构比不上B3LYP-D3(BJ)的,但是耗时反倒增加了很多。后HF需要更大的基组也主要只跟基组zeta数 ...

谢谢您,很详细

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-21 19:09:59 | 只看该作者 Only view this author

谢谢您

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