计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

  [复制链接 Copy URL]

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4981#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-25 19:03:07 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2026-1-25 16:44
老师,您好,我在做D/I分析的时候,发现过渡态的ΔE(int)特别负,然后ΔE(strain)没有那么大,导致ΔE&#450 ...

电子能垒不可能是负数。要么数据弄错了,要么算错了,要么参考能量的选取有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

84

帖子

0

威望

303

eV
积分
387

Level 3 能力者

4982#
发表于 Post on 2026-1-26 14:22:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2026-1-26 16:49 编辑

老师好,我正在计算某镧系离子与某气体的反应路径,一条完整的路径已经找到。不过当前仍存在两个极小点结构没有找到与其连接的过渡态,已经尝试了各种初猜,calcall以及结合小步长优化。想请教老师:会不会某些极小点结构并不是想要寻找的反应路径中的中间体?

168

帖子

0

威望

644

eV
积分
812

Level 4 (黑子)

4983#
发表于 Post on 2026-1-26 16:18:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-25 19:03
电子能垒不可能是负数。要么数据弄错了,要么算错了,要么参考能量的选取有问题

老师,如果ΔE(int)=E(ab)-E(a)-E(b),a,b片段都不优化直接算单点能量,那确实ΔEǂ算出来的是负数,如果减去优化后a,b的单点能,那算出来是正数。
后来我看有人说计算ΔE(int)也需要考虑ΔE(strain),我又用ΔE(int)=E(ab)-E(a)-E(b)+ΔE(strain)算了一遍也是正数,但是就是ΔE(int)=E(ab)-E(a)-E(b)算出来的ΔE(int)很负,我用的是M05-2X-D3/6-311++G(d,p)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4984#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-26 18:13:42 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2026-1-26 14:22
老师好,我正在计算某镧系离子与某气体的反应路径,一条完整的路径已经找到。不过当前仍存在两个极小点结构 ...

这需要结合几何结构判断可能性
某些情况也可以以这两个结构作为端点用ORCA或CP2K做NEB,通过给出的路径和能量变化评估是否中间还有什么有意义的结构(过渡态或重要的中间体)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4985#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-26 18:14:59 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2026-1-26 16:18
老师,如果ΔE(int)=E(ab)-E(a)-E(b),a,b片段都不优化直接算单点能量,那确实ΔEǂ算出来的是负数, ...

谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html
认真把上文看了,搞清楚概念,一项一项拆清楚,总能明白是怎么回事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

84

帖子

0

威望

303

eV
积分
387

Level 3 能力者

4986#
发表于 Post on 2026-1-26 19:42:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-26 18:13
这需要结合几何结构判断可能性
某些情况也可以以这两个结构作为端点用ORCA或CP2K做NEB,通过给出的路径 ...

感谢sob老师回复

458

帖子

0

威望

1707

eV
积分
2165

Level 5 (御坂)

4987#
发表于 Post on 2026-1-27 18:08:14 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,Multiwfn手册4.A.9提供了一个以二聚体为例的,基于gaussian和multiwfn计算激子耦合能(exciton coupling energy)的完整流程。尽管激子耦合能主要以库伦耦合为主导,但也有少部分非库伦项。请问应该如何基于计算出的TrEsp,利用multiwfn计算库伦耦合(Jcoul)呢?

1万

帖子

0

威望

9849

eV
积分
22083

Level 6 (一方通行)

4988#
发表于 Post on 2026-1-27 18:45:39 | 只看该作者 Only view this author
化小白 发表于 2026-1-25 16:44
老师,您好,我在做D/I分析的时候,发现过渡态的ΔE(int)特别负,然后ΔE(strain)没有那么大,导致ΔE&#450 ...

在这个论坛搜负活化能、负能垒、无垒反应,有大量讨论
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4989#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-28 03:02:41 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2026-1-27 18:08
老师您好,Multiwfn手册4.A.9提供了一个以二聚体为例的,基于gaussian和multiwfn计算激子耦合能(exciton c ...

手册那一节已经说了,基于TrESP电荷让Multiwfn根据库仑公式计算片段间的作用能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

9

帖子

0

威望

69

eV
积分
78

Level 2 能力者

4990#
发表于 Post on 2026-1-28 20:36:55 | 只看该作者 Only view this author
想请教一下各位老师,纯有机分子红外/振动分析的计算,针对3-quanta的应该怎么做?Gaussian和orca好像只能做到基频和2-quanta的非谐振计算;对3-quanta进行计算,免费的软件/方法我只找到nwchem的VSCF,它的计算结果靠谱吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4991#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-29 03:46:51 | 只看该作者 Only view this author
haos423 发表于 2026-1-28 20:36
想请教一下各位老师,纯有机分子红外/振动分析的计算,针对3-quanta的应该怎么做?Gaussian和orca好像只能 ...

此问题应该单独发主题帖
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

84

帖子

0

威望

303

eV
积分
387

Level 3 能力者

4992#
发表于 Post on 2026-2-3 16:25:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2026-2-3 16:29 编辑

各位老师好,体系含过渡金属,发现存在势能面交叉。我用sobMECP程序在赝势基组下找到了MECP点,但我最终想用全电子相对论基组展现更为精确的电子能量。但是我发现用较高级别计算MECP结构的电子能量后,两个态的电子能量会存在差异,并不是非常接近。我查阅了一些找到MECP结构后换高级别算电子能量的文献,也并没有具体说明用的是哪个态的电子能量,在此想请教一下各位老师有没有什么建议。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4993#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-3 16:52:30 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2026-2-3 16:25
各位老师好,体系含过渡金属,发现存在势能面交叉。我用sobMECP程序在赝势基组下找到了MECP点,但我最终想 ...

可以先用便宜级别做MECP预搜索,然后直接用较好级别进一步搜MECP,然后就不再重新算单点
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

84

帖子

0

威望

303

eV
积分
387

Level 3 能力者

4994#
发表于 Post on 2026-2-3 18:10:00 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2026-2-3 18:18 编辑
sobereva 发表于 2026-2-3 16:52
可以先用便宜级别做MECP预搜索,然后直接用较好级别进一步搜MECP,然后就不再重新算单点

感谢sob老师回复,我最开始尝试过这个操作,但是单点能我想用全电子基组进行X2C标量计算,我尝试在sobMECP输入文件中加入int=dkhso,但是会报错l1,好像不支持int=dkhso。请教sob老师有没有什么解决办法

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125120

管理员

公社社长

4995#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-2-4 05:45:19 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2026-2-3 18:10
感谢sob老师回复,我最开始尝试过这个操作,但是单点能我想用全电子基组进行X2C标量计算,我尝试在sobMEC ...

语义不明,说清楚是自己算单点时候还是用sobMECP搜索MECP的时候
直接给完整gjf文件,并且直接说清楚文字报错提示,问l1报错不说具体内容这种事是外行人才干的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-16 23:44 , Processed in 0.292970 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list