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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 简单量子化学问题答疑专帖

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-18 04:57:00 | 只看该作者 Only view this author
Neil-中 发表于 2025-12-17 21:48
卢老师在这篇帖子(详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入 - 思想家公社的门口:量子化学· ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-12-18 09:33:52 | 只看该作者 Only view this author
多谢老师

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发表于 Post on 2025-12-18 13:58:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 CM234 于 2025-12-18 23:25 编辑
sobereva 发表于 2025-12-18 04:40
去掉maxstep=4,否则每一步最多只能走一丁点长度,收敛当然巨慢
maxstep=4只适合用于解决震荡不收敛,绝 ...

好的,谢谢老师。还有两个问题:
1、我现在是停止计算,将opt=(gdiis,maxstep=4,notrust)更改为opt(gdiis,notrust,restart)然后读取停止计算的chk文件继续运算后,除了总能量外,受力和位移都在增大(图在下面,out文件在附件)请问是正常的吗?如果是,为什么会出现这种现象?
2、后续算单点能用大一点的基组,是否用 def-TZVP或者 def2-TZVP就可以?



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-18 23:59:00 | 只看该作者 Only view this author
CM234 发表于 2025-12-18 13:58
好的,谢谢老师。还有两个问题:
1、我现在是停止计算,将opt=(gdiis,maxstep=4,notrust)更 ...

1 甭用restart,否则保不齐步长上限设置也会读进来。当前轨迹明显能看到每一步步长都很小

2 单点至少用def-TZVP,能算得动的情况一律用def2-TZVP
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发表于 Post on 2025-12-19 09:22:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-18 23:59
1 甭用restart,否则保不齐步长上限设置也会读进来。当前轨迹明显能看到每一步步长都很小

2 单点至少 ...

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2025-12-20 22:27:05 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我看到博文推荐revTPSS/pcSseg-1计算NMR化学位移,我打算用这个方法计算完化学位移后,再用pcJ-1计算自旋耦合常数。
计算自旋耦合常数时,也是使用revTPSS的结果更好吗,还是有别的更好的方法。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-24 05:14:28 | 只看该作者 Only view this author
Cinene0523 发表于 2025-12-20 22:27
老师好,我看到博文推荐revTPSS/pcSseg-1计算NMR化学位移,我打算用这个方法计算完化学位移后,再用pcJ-1计 ...

算J未必revTPSS最佳。但可以用,尤其是算磁屏蔽值已经用这个的时候
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发表于 Post on 2025-12-24 14:41:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-24 05:14
算J未必revTPSS最佳。但可以用,尤其是算磁屏蔽值已经用这个的时候

谢谢老师

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发表于 Post on 2025-12-24 16:46:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NHX 于 2025-12-25 09:05 编辑

各位老师好,当前计算的体系涉及一个镧系原子以及若干个前三周期非金属原子,总原子数5个左右。算单点的时候想用全电子相对论(X2C标量计算),准备采用CCSD(T),对镧系原子用cc-pwCVQZ-X2C,对前三周期非金属原子用cc-pVQZ-X2C,这样的搭配合理吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-25 05:39:53 | 只看该作者 Only view this author
NHX 发表于 2025-12-24 16:46
各位老师好,当前计算的体系涉及一个镧系原子以及若干个前三周期非金属原子,总原子数5个左右。算单点的时 ...

CCSD(T)哪能说成泛函
可以。但若无特殊情况,没必要对镧系用带wC的
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发表于 Post on 2025-12-25 09:06:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-12-25 05:39
CCSD(T)哪能说成泛函
可以。但若无特殊情况,没必要对镧系用带wC的

感谢sob老师,已改正

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发表于 Post on 2025-12-25 09:59:54 | 只看该作者 Only view this author
你好楼主,我的输入文件如下:
%mem=1500MB
%chk=C:\Users\Summer\Desktop\Organic molecules\03-3N\01-Gaussian\01.chk
# opt freq b3lyp/6-311g(d,p)

01

0 1
S                  1.52110000    0.15190000   -0.01640000
O                  2.51130000   -1.12450000    0.20910000
O                  1.59050000    1.00860000    1.15360000
O                  1.73340000    0.67550000   -1.35370000
N                 -3.64150000    0.36600000   -0.00350000
C                 -1.19610000    0.21370000   -0.00260000
C                 -0.00530000   -0.73340000    0.01190000
C                 -2.51340000   -0.55790000    0.00170000
H                 -1.15300000    0.87840000    0.86940000
H                 -1.14320000    0.85760000   -0.88990000
H                 -0.01850000   -1.39900000   -0.85690000
H                 -0.01660000   -1.33920000    0.92400000
H                 -2.57410000   -1.20940000   -0.87700000
H                 -2.57590000   -1.19200000    0.89250000
H                 -4.51110000   -0.16290000   -0.05280000
H                 -3.60970000    0.94230000   -0.84360000
H                  2.49850000   -1.51700000    1.11360000


但是报错了,报错内容如下:
Trust Radius=3.00D-01 FncErr=1.00D-07 GrdErr=1.00D-06
Number of steps in this run=     90 maximum allowed number of steps=    102.
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

                          Input orientation:                          
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1         16           0        1.521100    0.151900   -0.016400
      2          8           0        2.511300   -1.124500    0.209100
      3          8           0        1.590500    1.008600    1.153600
      4          8           0        1.733400    0.675500   -1.353700
      5          7           0       -3.641500    0.366000   -0.003500
      6          6           0       -1.196100    0.213700   -0.002600
      7          6           0       -0.005300   -0.733400    0.011900
      8          6           0       -2.513400   -0.557900    0.001700
      9          1           0       -1.153000    0.878400    0.869400
     10          1           0       -1.143200    0.857600   -0.889900
     11          1           0       -0.018500   -1.399000   -0.856900
     12          1           0       -0.016600   -1.339200    0.924000
     13          1           0       -2.574100   -1.209400   -0.877000
     14          1           0       -2.575900   -1.192000    0.892500
     15          1           0       -4.511100   -0.162900   -0.052800
     16          1           0       -3.609700    0.942300   -0.843600
     17          1           0        2.498500   -1.517000    1.113600
---------------------------------------------------------------------
                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  S    0.000000
     2  O    1.631117   0.000000
     3  O    1.451775   2.508001   0.000000
     4  O    1.451757   2.507483   2.533363   0.000000
     5  N    5.167054   6.334330   5.396818   5.550530   0.000000
     6  C    2.717938   3.947203   3.119904   3.258942   2.450138
     7  C    1.764782   2.554432   2.623856   2.621629   3.798798
     8  C    4.096503   5.060796   4.541232   4.625332   1.458159
     9  H    2.909167   4.227848   2.761252   3.648924   2.686474
    10  H    2.891282   4.300220   3.416403   2.919435   2.696086
    11  H    2.341388   2.758912   3.525270   2.760347   4.119423
    12  H    2.339285   2.635803   2.854409   3.508480   4.111917
    13  H    4.400504   5.200780   5.136804   4.725955   2.093855
    14  H    4.406538   5.133342   4.719079   5.206058   2.089422
    15  H    6.040518   7.092769   6.329086   6.433431   1.019004
    16  H    5.256815   6.545722   5.570932   5.374021   1.019265
    17  H    2.239964   0.986073   2.684161   3.388215   6.518681
                    6          7          8          9         10
     6  C    0.000000
     7  C    1.521582   0.000000
     8  C    1.526651   2.514253   0.000000
     9  H    1.097300   2.156483   2.160220   0.000000
    10  H    1.097591   2.153913   2.162415   1.759450   0.000000
    11  H    2.171951   1.094537   2.769326   3.074696   2.521564
    12  H    2.159006   1.095010   2.774000   2.492416   3.063559
    13  H    2.165334   2.759611   1.095559   3.070561   2.513987
    14  H    2.163572   2.755677   1.095223   2.512316   3.070902
    15  H    3.336701   4.542234   2.037106   3.634776   3.617307
    16  H    2.657744   4.065901   2.041325   2.995635   2.468388
    17  H    4.229810   2.845485   5.222579   4.373903   4.786932
                   11         12         13         14         15
    11  H    0.000000
    12  H    1.781905   0.000000
    13  H    2.562702   3.130696   0.000000
    14  H    3.105406   2.563723   1.769586   0.000000
    15  H    4.728422   4.747457   2.350837   2.386973   0.000000
    16  H    4.287025   4.608690   2.388178   2.939051   1.630752
    17  H    3.198763   2.528495   5.457873   5.089602   7.233849
                   16         17
    16  H    0.000000
    17  H    6.869417   0.000000
Stoichiometry    C3H9NO3S
Framework group  C1[X(C3H9NO3S)]
Deg. of freedom    45
Full point group                 C1      NOp   1
Largest Abelian subgroup         C1      NOp   1
Largest concise Abelian subgroup C1      NOp   1
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1         16           0       -1.382753   -0.179088    0.005185
      2          8           0       -2.382742    1.099284   -0.157081
      3          8           0       -1.471685   -0.670880    1.368226
      4          8           0       -1.566178   -1.061295   -1.133088
      5          7           0        3.779448   -0.330420    0.170173
      6          6           0        1.333878   -0.207947    0.084359
      7          6           0        0.138945    0.692979   -0.190741
      8          6           0        2.647487    0.546237   -0.106168
      9          1           0        1.276332   -0.599528    1.107794
     10          1           0        1.301399   -1.076826   -0.585493
     11          1           0        0.166529    1.086036   -1.211896
     12          1           0        0.129504    1.531915    0.512925
     13          1           0        2.722819    0.923435   -1.131984
     14          1           0        2.689536    1.406798    0.569982
     15          1           0        4.647563    0.171452   -0.011127
     16          1           0        3.766835   -1.120914   -0.473148
     17          1           0       -2.389611    1.731491    0.599628
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      3.9944367      0.7804937      0.7665817
Standard basis: 6-311G(d,p) (5D, 7F)
There are   206 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
Integral buffers will be    262144 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
   206 basis functions,   342 primitive gaussians,   214 cartesian basis functions
    37 alpha electrons       37 beta electrons
       nuclear repulsion energy       513.8869627342 Hartrees.
NAtoms=   17 NActive=   17 NUniq=   17 SFac= 1.00D+00 NAtFMM=   60 NAOKFM=F Big=F
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis=   206 RedAO= T  NBF=   206
NBsUse=   206 1.00D-06 NBFU=   206
Harris functional with IExCor=  402 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 7.71D-02 ExpMax= 9.34D+04 ExpMxC= 3.17D+03 IAcc=2 IRadAn=         4 AccDes= 0.00D+00
HarFok:  IExCor=  402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         4 IDoV= 1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=           0 FMFlag=      100000 FMFlg1=           0
         NFxFlg=           0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
         Omega=  0.000000  0.000000  1.000000  0.000000  0.000000 ICntrl=     500 IOpCl=  0
         NMat0=    1 NMatS0=    1 NMatT0=    0 NMatD0=    1 NMtDS0=    0 NMtDT0=    0
         I1Cent=           4 NGrid=           0.
Petite list used in FoFCou.
Initial guess orbital symmetries:
       Occupied  (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A)
       Virtual   (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A) (A)
                 (A)
The electronic state of the initial guess is 1-A.这是什么原因呀?

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发表于 Post on 2025-12-25 10:02:27 | 只看该作者 Only view this author
caiyan 发表于 2025-12-25 09:59
你好楼主,我的输入文件如下:
%mem=1500MB
%chk=C:%users\Summer\Desktop\Organic molecules\03-3N\01-G ...

你为什么觉得这是报错了?
注意如果只是没有新的信息输出了,不一定意味着报错。任务管理器(或linux下的top命令)看不到高斯相关的进程了才是报错了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2025-12-25 10:03:56 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-12-25 10:02
你为什么觉得这是报错了?
注意如果只是没有新的信息输出了,不一定意味着报错。任务管理器(或linux下 ...

因为它报2070已经被杀掉了

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4950#
发表于 Post on 2025-12-25 10:05:30 | 只看该作者 Only view this author
已经报2070了,被杀掉了,所有我才判定为,它报错了

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